N\u00famero total de aislamientos para cada f\u00e1rmaco por sensibilidad. Cada f\u00e1rmaco est\u00e1 representado por un c\u00edrculo de color ponderado por la prevalencia de resistencia fenot\u00edpica a ese f\u00e1rmaco. El centro de cada c\u00edrculo muestra la intersecci\u00f3n entre los valores en el eje x y el eje y. Grupo 1 = asociado a resistencia. Grupo 2 = asociado a resistencia interina. Cr\u00e9dito: El microbio Lancet (2022). DOI: 10.1016\/S2666-5247(21)00301-3 <\/p>\n
La pandemia de COVID-19 contin\u00faa, pero hay otra enfermedad infecciosa global que tiene un gran impacto en el mundo. La tuberculosis (TB) causa m\u00e1s de 1,5 millones de muertes y m\u00e1s de 10 millones de infecciones por a\u00f1o. Las estimaciones sugieren que se han perdido alrededor de 10 a\u00f1os de progreso en la reducci\u00f3n de la carga global de TB debido a la pandemia de COVID-19, con 1,4 millones de pacientes menos diagnosticados y tratados en 2020 en comparaci\u00f3n con 2019. <\/p>\n
Al igual que muchas infecciones bacterianas, tratamos con antibi\u00f3ticos Con el tiempo, las mutaciones en el genoma bacteriano pueden dar a Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) la capacidad de sobrevivir al tratamiento y volverse resistente a los medicamentos. Esto puede ocurrir incluso en un solo paciente durante el curso de la terapia. En los \u00faltimos a\u00f1os, este problema ha ido en aumento, y alrededor de medio mill\u00f3n de personas padecen TB multirresistente (MDR) cada a\u00f1o.<\/p>\n
Esta enfermedad tiene un impacto terrible en los pacientes; la enfermedad es grave, el tratamiento es largo y las drogas tienen efectos secundarios brutales. El tratamiento para la TB-MDR tambi\u00e9n es dram\u00e1ticamente m\u00e1s costoso, y el costo para tratar adecuadamente todos los casos se eleva a miles de millones.<\/p>\n
Como parte del tema de investigaci\u00f3n Biolog\u00eda de la infecci\u00f3n de EMBL, los investigadores de mi grupo en EMBL-EBI han estado trabajando para mejorar la elecci\u00f3n de la terapia y la vigilancia a trav\u00e9s de la secuenciaci\u00f3n del genoma del pat\u00f3geno. A continuaci\u00f3n se muestran algunos ejemplos de c\u00f3mo lo estamos haciendo.<\/p>\n
Trabajando con la OMS<\/p>\n
El aumento de la resistencia a los medicamentos ha llevado a cambios en el m\u00e9todo est\u00e1ndar para tratar la TB. El est\u00e1ndar de oro es tomar una muestra, generalmente esputo, el moco espeso producido en los pulmones de un paciente, aislar la M. tuberculosis, cultivarla durante varias semanas y evaluar a qu\u00e9 medicamentos es susceptible la infecci\u00f3n. Esto brinda una lectura personalizada para ver qu\u00e9 medicamentos funcionar\u00e1n para este paciente en particular. Esta es una informaci\u00f3n realmente poderosa, pero puede llevar hasta dos o tres meses, ya que M. tuberculosis es una bacteria de crecimiento lento. En los \u00faltimos a\u00f1os, muchos estudios han demostrado que las mutaciones en el genoma bacteriano pueden usarse para detectar la resistencia a los medicamentos; mutaciones espec\u00edficas confieren resistencia a medicamentos espec\u00edficos, y poco a poco vamos acumulando informaci\u00f3n sobre las mutaciones clave.<\/p>\n
A diferencia de otras enfermedades bacterianas, la Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud (OMS) brinda consejos sobre qu\u00e9 tratamiento de TB administrar dependiendo de qu\u00e9 medicamentos funcionar\u00e1n o no en una infecci\u00f3n en particular. Sin embargo, no han dado ninguna recomendaci\u00f3n para determinar qu\u00e9 mutaciones afectan la eficacia de f\u00e1rmacos espec\u00edficos. Mi equipo forma parte de un grupo de trabajo t\u00e9cnico de la OMS y hemos analizado m\u00e1s de 40 000 genomas de M. tuberculosis y catalogado las mutaciones presentes. Combinando esta informaci\u00f3n con una amplia gama de otras publicaciones, incluido el enorme conjunto de datos de genotipos y fenotipos del proyecto CRyPTIC, el grupo de trabajo acaba de publicar una base de conocimiento de todas estas mutaciones de alta confianza.<\/p>\n
Implementing sequencing in Sistema de salud de Argentina<\/p>\n
Gracias a un Fondo de Investigaci\u00f3n de Desaf\u00edos Globales (GCRF) de UKRI, mi equipo acaba de pasar dos a\u00f1os trabajando con colegas en el Instituto Malbran en Argentina, estableciendo flujos de trabajo de an\u00e1lisis de secuenciaci\u00f3n para TB. Como parte de este trabajo, quer\u00edamos entender c\u00f3mo hacer que la secuenciaci\u00f3n de rutina funcione dentro de la infraestructura de salud argentina y permitir la notificaci\u00f3n adecuada. Esta colaboraci\u00f3n contribuy\u00f3 a un caso exitoso presentado al ministerio argentino y ha llevado a la adopci\u00f3n de la secuenciaci\u00f3n de micobacterias de rutina en toda Argentina. <\/p>\n
\u00abHa sido un desaf\u00edo hacer avanzar este proyecto durante la pandemia del SARS-CoV-2, pero era importante para nosotros establecer y validar nuestras l\u00edneas de an\u00e1lisis y procedimientos operativos\u00bb, dijo Josefina Campos, Coordinadora de Gen\u00f3mica. y Plataformas Bioinform\u00e1ticas en la Administraci\u00f3n Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud (INEI-ANLIS), Argentina. \u00abAunque Argentina no es un pa\u00eds de alta prevalencia, hay regiones donde la TB es una preocupaci\u00f3n real. Esta colaboraci\u00f3n con EMBL-EBI ha sido muy fruct\u00edfera y contribuy\u00f3 a nuestra toma de decisiones nacional para implementar la secuenciaci\u00f3n de rutina para la TB\u00bb.<\/p>\n
Validaci\u00f3n de la tecnolog\u00eda de nanoporos<\/p>\n
El objetivo final del diagn\u00f3stico de TB basado en la secuenciaci\u00f3n es una prueba en el mismo d\u00eda que arroja un \u00abperfil de resistencia\u00bb que informa la elecci\u00f3n del r\u00e9gimen terap\u00e9utico, mientras el paciente est\u00e1 todav\u00eda en la cl\u00ednica. Se necesitan dos componentes para que esto funcione: 1) una forma de evitar el cultivo de bacterias durante dos semanas, y 2) un proceso de secuenciaci\u00f3n de respuesta r\u00e1pida en entornos de punto de atenci\u00f3n. El primero se aborda mediante la secuenciaci\u00f3n del esputo del paciente directamente, sin cultivo. El segundo puede abordarse mediante el uso de un secuenciador port\u00e1til Oxford Nanopore MinION. <\/p>\n
Mi doctorado. el estudiante Michael Hall public\u00f3 recientemente una preimpresi\u00f3n en MedRxiv, trabajando con colaboradores en Sud\u00e1frica, Madagascar e Inglaterra, evaluando la tecnolog\u00eda de nanoporos como una alternativa a otros m\u00e9todos establecidos para la secuenciaci\u00f3n est\u00e1ndar de M. tuberculosis. Las dos cosas que quer\u00edan verificar eran: 1) \u00bfEste m\u00e9todo proporciona la misma lectura de resistencia a los medicamentos en comparaci\u00f3n con otros m\u00e9todos establecidos? y 2) \u00bfDetecta los mismos \u00abgrupos de brotes\u00bb que los equipos de salud p\u00fablica usan para el seguimiento y seguimiento de la TB? rastro. Descubrieron que pod\u00edan obtener predicciones de resistencia a los medicamentos casi id\u00e9nticas en comparaci\u00f3n con otros m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n establecidos y pod\u00edan identificar f\u00e1cilmente a los pacientes de diferentes grupos de brotes. Este \u00faltimo hecho fue particularmente importante para los coautores en Madagascar, que quer\u00edan usar esta informaci\u00f3n para impulsar cuidadosamente el rastreo de contactos en todo el pa\u00eds.<\/p>\n
\u00abEs un gran placer colaborar con EMBL-EBI. Este El proyecto es muy importante para nuestro trabajo en Madagascar, donde hemos construido infraestructura y experiencia para la secuenciaci\u00f3n de nanoporos\u00bb, dijo Simon Grandjean Lapierre, profesor asociado en el Departamento de Microbiolog\u00eda, Enfermedades Infecciosas e Inmunolog\u00eda de la Universidad de Montral e investigador visitante en el Instituto Pasteur de Madagascar. . \u00abEra fundamental para nosotros validar c\u00f3mo pod\u00edamos usar esta tecnolog\u00eda para las investigaciones de brotes\u00bb.<\/p>\n
Ensayos cl\u00ednicos en Madagascar<\/p>\n
Mi equipo pronto tambi\u00e9n colaborar\u00e1 con investigadores del Instituto Pasteur de Madagascar y la Universit de Montral para un ensayo controlado aleatorio por conglomerados, en el que grupos preexistentes de personas se asignar\u00e1n al azar a distintas estrategias de intervenci\u00f3n para el control de la tuberculosis. Esto ayudar\u00e1 a evaluar el valor agregado del uso de informaci\u00f3n gen\u00f3mica para guiar el seguimiento y la localizaci\u00f3n en aldeas con alta incidencia de TB en las zonas rurales de Madagascar. El objetivo es evaluar si y c\u00f3mo la secuenciaci\u00f3n sistem\u00e1tica del genoma completo de M. tuberculosis puede ayudar a encontrar casos de TB en entornos rurales de alta incidencia.<\/p>\n
\u00abEstamos muy entusiasmados de colaborar con la Universidad de Montral y EMBL- EBI para comenzar a medir el impacto potencial de la secuenciaci\u00f3n de TB en la detecci\u00f3n de casos en una poblaci\u00f3n que m\u00e1s lo necesitar\u00eda, como Madagascar\u00bb, dijo Niaina Rakotosamimanana, directora de la Unidad de Micobacterias del Instituto Pasteur de Madagascar.<\/p>\n
La tuberculosis es un problema multifactorial para el que no habr\u00e1 una panacea simple basada en la ciencia. Sin embargo, los m\u00e9todos basados en la gen\u00f3mica que hemos discutido aqu\u00ed son un paso adelante en el camino hacia el diagn\u00f3stico y el control de la transmisi\u00f3n en el mismo d\u00eda, respaldados por el intercambio de datos de acceso abierto para acelerar el progreso cient\u00edfico. Este trabajo requiere el aporte de muchos investigadores, m\u00e9dicos y trabajadores de la salud p\u00fablica diferentes de diferentes or\u00edgenes y disciplinas, y sin esta red de colaboradores, esto simplemente no ser\u00eda posible. El trabajo sobre la base gen\u00e9tica de la resistencia a los medicamentos est\u00e1 en curso en nuestro pa\u00eds en todo el EMBL como parte del tema de investigaci\u00f3n Biolog\u00eda de las infecciones y esperamos que, como sociedad, al combinar el progreso cient\u00edfico con las mejoras en el desarrollo de medicamentos, el alivio de la pobreza y el acceso a medicamentos y diagn\u00f3sticos, haremos progresos contra esta enfermedad.<\/p>\n
La investigaci\u00f3n fue publicada en The Lancet Microbe. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
El estudio mundial m\u00e1s grande jam\u00e1s realizado sobre la tuberculosis identifica las causas gen\u00e9ticas de la resistencia a los medicamentos M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Timothy M Walker et al, The 2021 WHO catalog of Mycobacterium tuberculosis complex mutaciones asociadas con la resistencia a los medicamentos : un an\u00e1lisis genot\u00edpico, The Lancet Microbe (2022). DOI: 10.1016\/S2666-5247(21)00301-3 <\/p>\n Michael B. Hall et al, Secuenciaci\u00f3n de nanoporos para pruebas de susceptibilidad a f\u00e1rmacos de Mycobacterium tuberculosis e investigaci\u00f3n de brotes, (2022). DOI: 10.1101\/2022.03.04.22271870<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" N\u00famero total de aislamientos para cada f\u00e1rmaco por sensibilidad. Cada f\u00e1rmaco est\u00e1 representado por un c\u00edrculo de color ponderado por la prevalencia de resistencia fenot\u00edpica a ese f\u00e1rmaco. El centro de cada c\u00edrculo muestra la intersecci\u00f3n entre los valores en el eje x y el eje y. Grupo 1 = asociado a resistencia. Grupo 2 … Continuar leyendo \u00abLa secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica ayuda en la lucha mundial contra la tuberculosis\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-9971","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9971","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=9971"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9971\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=9971"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=9971"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=9971"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}