Juan 19:26, 27 “Cuando Jesús vio a su madre y al discípulo que estaba junto a él, a quien amó, dijo a su madre: ¡Mujer, he aquí tu hijo! Entonces dice al discípulo: ¡Ahí tienes a tu madre! Y desde aquella hora aquel discípulo la acogió en su casa.”

El Evangelio de Juan menciona, el discípulo a quien Jesús amaba. Esta frase está solamente en el libro de Juan. Los comentaristas están de acuerdo en que esto se refiere al autor, John. No quería llamar la atención sobre sí mismo. Se refiere a sí mismo con esa frase en otros versículos del libro de Juan (13:23; 20:1, 2, 21:7,8, 20-24, ver más abajo). Dado que Jesús amaba a todos, no sería irrazonable agregar «los discípulos que Jesús amaba ESPECIALMENTE». Juan 21:24 es claro en que Juan, quien escribió el libro de Juan, es al que se hace referencia como «el discípulo».

No se menciona a Santiago ni a ninguno de los otros discípulos en la cruz. La noche anterior en el jardín de Getsemaní cuando la turba vino a arrestar a Jesús, sus discípulos huyeron. (Marcos 14:50  “Y todos lo abandonaron y huyeron”).  Los Evangelios no registran a los discípulos reunidos nuevamente como grupo hasta después de que Jesús’ resurrección.