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Se publica el conjunto de datos de acceso abierto del cerebro de un macaco

Se publica el conjunto de datos de acceso abierto del cerebro de un macaco

(a) Numeración de las 16 matrices que se implantaron en la corteza visual. LS: surco semilunar. STS: surco temporal superior. El punto amarillo en cada matriz indica el lado por el cual el haz de cables sale de la matriz. Derecha: Numeración de canales en cada matriz, vistos desde la parte superior de la matriz después de la implantación, girados 90 grados hacia la izquierda en relación con el panel izquierdo. (be) Mapa de RF, que muestra las coordenadas de los centros de RF V1 (b,c) y V4 (d,e) para canales con una SNR de más de 2 para cada condición (N = 893 y 679 en monos L y A, respectivamente) ). Los canales están codificados por colores por número de matriz, utilizando el mismo código de color que en a. Los campos receptivos se encuentran en el cuadrante inferior derecho del campo visual. Crédito: Scientific Data, DOI: 10.1038/s41597-022-01180-1

Investigadores del Instituto Holandés de Neurociencia (NIN) publicaron un conjunto de datos que se registró en la corteza visual de monos durante el estado de reposo. El conjunto de datos se puede compartir con otros investigadores para su análisis, utilizarse como material didáctico y/o servir como plantilla para futuras publicaciones de grandes conjuntos de datos de electrofisiología, por lo que se necesitan menos monos para la investigación. El conjunto de datos se recopiló en el NIN y se preparó para su publicación por parte del NIN y colaboradores de la Universidad Juelich y la Universidad de Aquisgrán (Alemania).

El conjunto de datos consta de datos de electrofisiología que se registraron en la corteza visual (V1 y V4) de dos monos, de 1024 sitios de registro simultáneamente durante el estado de reposo, y también incluye conjuntos de datos de apoyo obtenidos mientras los monos realizaban tareas visuales. Los datos proporcionan una imagen de la actividad neuronal en grandes regiones de la corteza visual con una resolución espacial y temporal sin precedentes, con una cobertura de campo receptivo de alta densidad. El conjunto de datos incluye datos en su forma ‘más cruda’, para permitir su uso más amplio, así como datos procesados para facilitar el análisis de las señales neuronales de uso común.

Imagen detallada espacial y temporalmente

Las grabaciones se pueden utilizar para observar las ondas cerebrales en regiones más grandes de la corteza, lo que ofrece una imagen espacialmente detallada de la actividad cerebral. ‘»En este documento, proporcionamos el conjunto de datos, describimos los formatos de datos sin procesar y procesados y los métodos de adquisición de datos, e indicamos cómo se pueden usar los datos para generar nuevos conocimientos sobre la actividad ‘de fondo’ que influye en el procesamiento de información visual en nuestro cerebro'», dice Xing Chen, investigador sénior del laboratorio de visión y cognición del NIN.

La mayoría de los estudios han examinado la actividad en estado de reposo en todo el cerebro mediante resonancias magnéticas, una técnica de imagen médica no invasiva, o mediante el registro de la actividad. de un pequeño número de electrodos implantados. El laboratorio de Visión y Cognición, dirigido por el profesor Pieter Roelfsema, llevó a cabo grabaciones de más de mil electrodos implantados de forma crónica en la corteza visual de primates no humanos, lo que produjo un conjunto de datos de estado de reposo con una alta resolución espacio-temporal, una observación muy detallada y precisa. ‘»Parte de nuestro conjunto de datos ya se ha utilizado con éxito para investigar los correlatos neurales de la actividad cerebral obtenidos a través de imágenes no invasivas», dice Chen.

Acceso abierto

Un descriptor de datos El artículo acompaña al conjunto de datos. El artículo incluye una descripción detallada de los conocimientos científicos que podrían obtenerse de los datos, formatos de datos y métodos de adquisición y procesamiento de datos. Se incluyen secciones sobre registros de datos (que describen el uso de datos y los formatos de archivo); Validación técnica (para validar los datos en cuanto a usabilidad y corrección); y disponibilidad de código (que describe los scripts utilizados para la recopilación, el procesamiento y el análisis de datos).

‘»Este conjunto de datos permite a otros científicos obtener nuevos conocimientos neurocientíficos fundamentales sobre la actividad subyacente que influye en el procesamiento de la información visual en nuestro cerebro», dice Chen. El conjunto de datos se ha publicado bajo una licencia Creative Commons de acceso abierto para que otros investigadores puedan acceder a los datos.

El estudio se publica en la revista Scientific Data.

Explore más

El nuevo conjunto de datos públicos de neuroimagen proporciona muestras profundas de cerebros humanos individuales. Más información: Xing Chen et al, registros electrofisiológicos de 1024 canales en macacos V1 y V4 durante el estado de reposo, Scientific Datos (2022). DOI: 10.1038/s41597-022-01180-1 Proporcionado por el Instituto Holandés de Neurociencia – KNAW Cita: Conjunto de datos de acceso abierto del cerebro de macaco publicado (11 de marzo de 2022) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https:/ /medicalxpress.com/news/2022-03-open-access-dataset-macaque-brain-published.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.