Coronavirus introducido en Rusia al menos 67 veces
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Un equipo de investigación de la Universidad HSE y SkolTech, junto con expertos del Instituto de Investigación de Influenza Smorodintsev en San Petersburgo y el Instituto RAS Kharkevich para Information Transmission Problems (IITP) descubrió que el virus SARS-CoV-2 ingresó a Rusia de forma independiente al menos 67 veces, principalmente a fines de febrero y principios de marzo de 2020. La gran mayoría de las introducciones provino de países europeos. No se registraron casos de introducción desde China, lo que probablemente se deba al cierre oportuno de las fronteras con el país. Actualmente, nueve linajes de virus locales circulan en Rusia que no están presentes en otras partes del mundo. Dado que Rusia estaba «importando» activamente el virus del extranjero, los investigadores no han detectado ningún caso de «exportación» de linajes de SARS-CoV-2 en otros países.
El artículo, «Epidemiología genómica de las primeras etapas del brote de SARS-CoV-2 en Rusia», se publicó en Nature Communications.
Para analizar y construir árboles filogenéticos, los investigadores utilizaron 211 virus genomas, que fueron secuenciados en el Instituto de Investigación de Influenza Smorodintsev. Todos los genomas se obtuvieron de pacientes de 25 regiones rusas (incluida la República de Crimea) durante el período del 11 de marzo al 23 de abril de 2020. El conjunto de datos resultante reflejó la situación en las primeras etapas de la epidemia en Rusia.
Además, para establecer el alcance completo de los vínculos filogenéticos, los académicos usaron un conjunto de datos de 19 623 genomas de SARS-CoV-2 del resto del mundo disponibles el 26 de mayo de 2020. El análisis también usó ampliamente datos sobre las personas transitan a través de las fronteras rusas y dentro del país.
Los árboles filogenéticos construidos por los investigadores demostraron que en las primeras etapas de la epidemia, casi todos los linajes de SARS-CoV-2 que evolucionaron en ese momento circularon en Rusia . Mientras tanto, la gran mayoría de los genomas pertenecían a los linajes predominantes en Europa. Resultó que solo el 2% de ellos eran asiáticos, mientras que en este momento comprendían alrededor del 50% de los linajes en China. Esto significa que el principal canal de ‘importación’ de coronavirus fue el tráfico de pasajeros de países europeos. Probablemente, los linajes chinos también provenían de Europa, ya que las fronteras con China ya se habían cerrado mucho antes.
Los investigadores creen que se logró una diversidad tan alta del virus debido a al menos 67 virus independientes. introducciones en diferentes ciudades rusas a finales de febreroprincipios de marzo. De estos, nueve introducciones condujeron a la aparición de linajes de virus locales, que circulan solo en Rusia.
«El estudio demuestra una forma de investigar objetivamente las vías y el carácter de la propagación de un virus en una población. Hoy es una situación única para los investigadores: estamos obteniendo datos, incluidos datos genómicos, casi en tiempo real. «Gracias a la pandemia, estamos aprendiendo mucho sobre las epidemias en general, lo que ayudará a predecirlas y controlarlas en el futuro». dice Vladimir Shchur, director del Laboratorio Internacional de Genómica Estadística y Computacional
Uno de los resultados más interesantes es que el virus que inició la epidemia apareció en Rusia bastante tarde. La mayoría de las personas que trajeron el nuevo coronavirus a Rusia llegó a finales de febreroprincipios de marzo. No había rastros de evolución anterior de linajes específicos en el país.
El SARS-CoV-2 llegó a Rusia para quedarse. No hay signos de ‘exportación’ de los linajes rusos variaciones del virus en el extranjero (al menos a los países con datos disponibles). Esto diferencia al país de superpropagadores globales como Italia y España, que sentaron las bases para la epidemia europea, o Gran Bretaña. Dentro de Rusia, el virus comenzó a propagarse casi inmediatamente después de su importación. La primera transmisión en Rusia ocurrió el 11 de marzo.
Los investigadores prestaron especial atención al brote del virus en uno de los hospitales no infecciosos de San Petersburgo, el Hospital Vreden, donde más de 700 personas estaban encerradas. en cuarentena durante un mes, y más de 400 de ellos fueron infectados. Según el gobernador de la ciudad, Alexander Beglov, el virus fue llevado allí por un empleado que regresó de unas vacaciones en Turquía. Sin embargo, el análisis de varias decenas de genomas de la institución demostró que el virus se introdujo allí de dos a tres veces. Y cada vez, esto condujo a un brote específico, que se fusionó y parecía un gran brote.
Las características específicas del caso del Hospital Vreden, su comunidad aislada, hacen que parezca la notoria infección en el crucero Diamond Princess en el comienzo de la pandemia. Tales poblaciones cerradas realmente se infectan con una sola introducción. No había ninguna razón para creer que la situación en San Petersburgo fuera diferente. Y solo el análisis del genoma ayudó a revelar la dinámica real de la infección en el hospital, con múltiples introducciones repetidas de virus.
La epidemiología genómica solo puede disipar los rumores y mitos sobre la ‘epidemia temprana’ en Rusia en noviembre de 2019Enero 2020, que se discuten persistentemente en las redes sociales. También demuestra la eficacia de las políticas restrictivas estatales. Por ejemplo, el cierre oportuno de las fronteras con China no permitió la introducción del nuevo coronavirus desde allí a Rusia en enero y febrero de 2020.
Al mismo tiempo, las medidas para controlar el tráfico de pasajeros desde Europa y otros países en febrero y marzo de 2020 resultó ser insuficiente. De aquí es de donde vino el SARS-CoV-2, que provocó varios brotes locales que llevaron a una epidemia a gran escala.
Además, la epidemiología genómica es una buena herramienta práctica para epidemiólogos, médicos y desarrolladores de vacunas. . Cuanto más tiempo pasa desde el inicio de la pandemia, más genomas secuenciados hay de virus de todas partes del planeta. Partirán más adelante diferentes linajes, que nos ayudarán a comprender el vector evolutivo general del SARS-CoV-2, cómo se adapta a la humanidad y si muestra signos de atenuación (disminución del efecto nocivo sobre el cuerpo humano y virulencia).
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La cepa de COVID-19 de Rusia no provino de China Más información: Andrey B. Komissarov et al. Epidemiología genómica de las primeras etapas del brote de SARS-CoV-2 en Rusia, Nature Communications (2021). DOI: 10.1038/s41467-020-20880-z Información del diario: Nature Communications
Proporcionado por la Escuela Superior de Economía de la Universidad Nacional de Investigación Cita: Coronavirus introducido en Rusia en menos 67 veces (28 de enero de 2021) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-01-coronavirus-russia.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.