La agrupación de receptores de células inmunitarias podría ayudar a descifrar el historial personal de infección de los pacientes
Crédito: CC0 Public Domain
La agrupación de proteínas que reconocen patógenos en las células T inmunitarias puede ser clave para identificar si alguien ha tenido una infección en el pasado, sugiere un estudio publicado hoy en eLife.
Si bien las pruebas que miden los anticuerpos contra un patógeno a menudo se usan para detectar signos de una infección previa, es más difícil para los investigadores medir la fuerza y los objetivos de la respuesta de las células T de una persona a la infección o la vacunación, pero los hallazgos sugieren un nuevo enfoque potencial. Esta información del paciente algún día podría ser útil para detectar infecciones, guiar tratamientos o apoyar la investigación y el desarrollo de nuevas terapias y vacunas.
Las células T inmunitarias ayudan al cuerpo a encontrar y destruir virus y bacterias dañinas. Las proteínas en la superficie externa de las células T llamadas receptores permiten que las células T reconozcan y eliminen las células humanas que han sido infectadas por patógenos específicos.
«Si bien la abundancia de receptores específicos podría proporcionar pistas sobre infecciones pasadas, la enorme cantidad de moléculas «La diversidad de receptores de células T hace que sea increíblemente difícil evaluar qué receptores reconocen qué patógenos. No solo cada patógeno es reconocido por un conjunto distinto de receptores, sino que cada individuo desarrolla un conjunto personalizado de receptores para cada patógeno», explica el primer autor Koshlan Mayer. -Blackwell, científico de datos sénior en el Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson, Seattle, Washington, EE. UU. «Desarrollamos un nuevo enfoque computacional que nos permite encontrar similitudes entre los receptores de células T específicos de patógenos entre individuos. En última instancia, esperamos que esto ayude a desarrollar firmas de infecciones pasadas a pesar de la enorme diversidad de receptores de células T».
El equipo probó su enfoque utilizando datos del estudio immunoRACE de receptores de células T en pacientes con COVID-19. Usando su nuevo software para comparar rápidamente grandes conjuntos de receptores, pudieron generar 1831 agrupaciones de receptores de células T basadas en similitudes en las secuencias de aminoácidos de los receptores que sugieren que tienen funciones similares.
En un estudio independiente grupo de pacientes con COVID-19, el equipo encontró que los patrones moleculares comunes asociados con las agrupaciones de receptores se detectaron de manera más sólida que las secuencias de receptores individuales que previamente se suponía que reconocían partes del virus SARS-CoV-2, lo que demuestra una mejora importante en los enfoques existentes .
«Nuestro estudio presenta y valida un enfoque flexible para identificar conjuntos de receptores de células T similares, que esperamos sean ampliamente útiles para los científicos que estudian la inmunidad de las células T», dice Mayer-Blackwell. «Agrupar los receptores de esta manera hace posible comparar las respuestas a la infección o la vacunación en una población diversa».
Para ayudar a otros investigadores a utilizar este enfoque para desarrollar biomarcadores de células T con sus propios datos, el equipo ha creado un software personalizable gratuito llamado tcrdist3.
«Nuestro software proporciona herramientas flexibles que permitirán a los científicos analizar e integrar las bibliotecas de rápido crecimiento de datos de secuenciación de receptores de células T que se necesitan para identificar las características de patógenos- receptores de células T específicos», concluye el autor principal Andrew Fiore-Gartland, codirector del Centro de Estadística de Vacunas e Inmunología del Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson. «Esperamos que abra nuevas oportunidades no solo para identificar los recuerdos inmunológicos de infecciones y vacunas pasadas de los pacientes, sino también para predecir sus futuras respuestas inmunitarias».
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Uno más uno no es igual a dos: el equipo de investigación investiga los receptores que forman pares en la superficie de las células Más información: Koshlan Mayer-Blackwell et al, metaclonotipos de TCR para el descubrimiento de biomarcadores con tcrdist3 permitió la identificación de grupos públicos restringidos por HLA de TCR de SARS-CoV-2, eLife (2021). DOI: 10.7554/eLife.68605 Información de la revista: eLife
Proporcionado por eLife Cita: La agrupación de receptores de células inmunitarias podría ayudar a descifrar el historial personal de infección de los pacientes (2021 , 30 de noviembre) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-11-grouping-immune-cell-receptors-decode.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.