El estudio destaca el riesgo de que surjan nuevas mutaciones del SARS-CoV-2 durante la infección crónica
Una micrografía electrónica de barrido coloreada del virus SARS-CoV-2. Crédito: NIAID
Las mutaciones del SARS-CoV-2 similares a las de la variante B1.1.7 del Reino Unido podrían surgir en casos de infección crónica, donde el tratamiento durante un período prolongado puede proporcionar al virus múltiples oportunidades para evolucionar, dicen los científicos.
Escribiendo en Nature, un equipo dirigido por investigadores de Cambridge informa cómo pudieron observar la mutación del SARS-CoV-2 en el caso de un paciente inmunocomprometido tratado con plasma convaleciente. En particular, vieron el surgimiento de una mutación clave que también se vio en la nueva variante que llevó a que el Reino Unido se viera obligado una vez más a un confinamiento estricto, aunque no hay ninguna sugerencia de que la variante se haya originado en este paciente.
Usando una versión sintética de la proteína Spike del virus creada en el laboratorio, el equipo demostró que los cambios específicos en su código genético, la mutación observada en la variante B1.1.7, hicieron que el virus fuera dos veces más infeccioso en las células que la cepa más común.
SARS-CoV-2, el virus que causa el COVID-19, es un betacoronavirus. Su ARN, su código genético, está compuesto por una serie de nucleótidos (estructuras químicas representadas por las letras A, C, G y U). A medida que el virus se replica a sí mismo, este código puede transcribirse incorrectamente, lo que genera errores, conocidos como mutaciones. Los coronavirus tienen una tasa de mutación relativamente modesta de alrededor de 23 sustituciones de nucleótidos por año.
De particular preocupación son las mutaciones que podrían cambiar la estructura de la ‘proteína de punta’, que se encuentra en la superficie del virus, dándole su característica forma de corona. El virus usa esta proteína para unirse al receptor ACE2 en la superficie de las células del huésped, lo que le permite ingresar a las células donde secuestra su maquinaria para permitir que se replique y se propague por todo el cuerpo. La mayoría de las vacunas actuales en uso o que se están probando se dirigen a la proteína de pico y existe la preocupación de que las mutaciones puedan afectar la eficacia de estas vacunas.
Investigadores del Reino Unido dentro de COVID-19 Genomics UK (COG- UK) ha identificado una variante particular del virus que incluye cambios importantes que parecen hacerlo más infeccioso: la eliminación del aminoácido H69/V70 en parte de la proteína espiga es uno de los cambios clave en esta variante.
Aunque la deleción H69/V70 se ha detectado varias veces, hasta ahora, los científicos no las habían visto emerger dentro de un individuo. Sin embargo, en un estudio publicado hoy en Nature, los investigadores de Cambridge documentan cómo aparecieron estas mutaciones en un paciente con COVID-19 ingresado en el Addenbrooke’s Hospital, parte de Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust.
La persona en cuestión era un hombre. de setenta años a quien previamente se le había diagnosticado un linfoma de células B marginales y recientemente había recibido quimioterapia, lo que significa que su sistema inmunológico estaba gravemente comprometido. Después de la admisión, el paciente recibió una serie de tratamientos, incluido el medicamento antiviral remdesivir y plasma convaleciente, es decir, plasma que contenía anticuerpos extraídos de la sangre de un paciente que había eliminado con éxito el virus de su sistema. A pesar de que su condición se estabilizó inicialmente, luego comenzó a deteriorarse. Fue ingresado en la unidad de cuidados intensivos y recibió tratamiento adicional, pero luego falleció.
Durante la estadía del paciente, 23 muestras virales estuvieron disponibles para análisis, la mayoría de su nariz y garganta. Estos fueron secuenciados como parte de COG-UK. Fue en estas secuencias que los investigadores observaron la mutación del genoma del virus.
Entre los días 66 y 82, luego de las dos primeras administraciones de sueros convalecientes, el equipo observó un cambio dramático en la población del virus, con una variante con deleciones H69/V70, junto con una mutación en la proteína espiga conocida como D796H, que se vuelve dominante. Aunque inicialmente esta variante pareció desaparecer, volvió a surgir cuando se administró el tercer curso de remdesivir y terapia de plasma convaleciente.
El profesor Ravi Gupta del Instituto de Inmunología Terapéutica y Enfermedades Infecciosas de Cambridge, quien dirigió la investigación, dijo: «Lo que estábamos viendo era esencialmente una competencia entre diferentes variantes del virus, y creemos que fue impulsada por la terapia de plasma convaleciente.
«El virus que finalmente ganó, que tenía el D796H La mutación y las deleciones H69/V70 ganaron inicialmente la ventaja durante la terapia de plasma convaleciente antes de ser superadas por otras cepas, pero resurgieron cuando se reanudó la terapia. Una de las mutaciones está en la nueva variante del Reino Unido, aunque no hay indicios de que nuestro paciente estuviera donde surgieron por primera vez».
Bajo condiciones estrictamente controladas, los investigadores crearon y probaron una versión sintética del virus. con las deleciones H69/V70 y las mutaciones D796H, tanto individualmente como juntas. Las mutaciones combinadas hicieron que el virus fuera menos sensible a la neutralización por el plasma convaleciente, aunque parece que la mutación D796H por sí sola fue responsable de la reducción de la susceptibilidad a los anticuerpos en el plasma. La mutación D796H por sí sola condujo a una pérdida de la infección en ausencia de plasma, típica de las mutaciones que adquieren los virus para escapar de la presión inmunitaria.
Los investigadores descubrieron que la deleción H69/V70 por sí sola hizo que el virus dos veces más infeccioso que la variante dominante anterior. Los investigadores creen que el papel de la eliminación fue compensar la pérdida de infecciosidad debido a la mutación D796H. Este paradigma es clásico para los virus, w por lo tanto, las mutaciones de escape van seguidas o acompañadas de mutaciones compensatorias.
«Dado que tanto las vacunas como los tratamientos están dirigidos a la proteína espiga, que vimos mutar en nuestro paciente, nuestro estudio plantea la posibilidad preocupante de que el virus podría mutar para burlar a nuestras vacunas», agregó el profesor Gupta.
«Es poco probable que este efecto ocurra en pacientes con sistemas inmunitarios en funcionamiento, donde es probable que la diversidad viral sea menor debido a un mejor control inmunitario. Pero destaca el cuidado que debemos tener al tratar a pacientes inmunocomprometidos, donde puede ocurrir una replicación viral prolongada, lo que brinda una mayor oportunidad para que el virus mute».
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Es probable que la vacuna Pfizer BioNTech sea eficaz contra B1. 1.7 cepa de SARS-CoV-2 Más información: Kemp, SA et al. Evolución del SARS-CoV-2 durante el tratamiento de la infección crónica. Nature; 5 de febrero; DOI: 10.1038/s41586-021-03291 -y Información del diario: Nature
Proporcionado por la Universidad de Cambridge Cita: El estudio destaca el riesgo de que surjan nuevas mutaciones del SARS-CoV-2 durante la infección crónica (2021, febrero 5) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-02-highlights-sars-cov-mutations-emerging-chronic.html Este documento está sujeto a derechos de autor. estudio privado o investigación, ninguna parte puede ser reproducida sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona con fines informativos. ses solamente.