Estados Unidos se apresura a ponerse al día en la carrera para detectar virus mutantes
El científico de laboratorio clínico Selam Bihon procesa muestras de las vías respiratorias superiores de pacientes sospechosos de tener COVID-19 en el Laboratorio Clínico de Virología de Stanford el miércoles 3 de febrero de 2021 en Palo Alto , California. Los virus mutan constantemente. Para adelantarse a la amenaza, los científicos analizan las muestras en busca de cambios genéticos, observando de cerca los que podrían hacer que el virus sea más infeccioso o más mortal. (Foto AP/Noah Berger)
A pesar de su sistema médico de clase mundial y sus elogiados Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades, EE. UU. se quedó atrás en la carrera por detectar mutaciones peligrosas del coronavirus. Y recién ahora está comenzando a ponerse al día.
El problema no ha sido la escasez de tecnología o experiencia. Más bien, dicen los científicos, es una ausencia de liderazgo y coordinación nacional, además de la falta de fondos y suministros para los laboratorios sobrecargados que intentan hacer malabarismos con las pruebas de diagnóstico con la búsqueda de cambios genéticos.
«Tenemos el cerebro. Tenemos tenemos las herramientas. Tenemos los instrumentos», dijo Ilhem Messaoudi, directora de un centro de investigación de virus en la Universidad de California, Irvine. «Es solo cuestión de apoyar ese esfuerzo».
Los virus mutan constantemente. Para adelantarse a la amenaza, los científicos analizan muestras y observan de cerca las mutaciones que podrían hacer que el coronavirus sea más infeccioso o más mortal.
Pero tales pruebas han sido dispersas.
Menos de 1 Se está secuenciando el % de muestras positivas en los EE. UU. para determinar si tienen mutaciones preocupantes. A otros países les va mejor. Gran Bretaña secuencia aproximadamente un 10 %, lo que significa que pueden ver más rápidamente las amenazas que se les avecinan. Eso les brinda una mayor oportunidad de desacelerar o detener el problema, ya sea a través de un rastreo de contactos más específico, posibles ajustes a la vacuna o advertencias públicas.
La científica de laboratorio clínico Carine Pokam procesa muestras de las vías respiratorias superiores de pacientes sospechosos de tener COVID-19 en el Laboratorio de Virología Clínica de Stanford el miércoles 3 de febrero de 2021 en Palo Alto, California. Los virus mutan constantemente. Para adelantarse a la amenaza, los científicos analizan las muestras en busca de cambios genéticos, observando de cerca los que podrían hacer que el virus sea más infeccioso o más mortal. (Foto AP/Noah Berger)
Los funcionarios de los CDC dicen que las variantes no han impulsado aumentos repentinos recientes en los casos generales de EE. UU. Pero a los expertos les preocupa que lo que está sucediendo con las variantes no esté claro y dicen que la nación debería haber sido más agresiva con respecto a la secuenciación antes en la epidemia que ahora ha matado a más de 450 000 estadounidenses.
«Si tuviéramos evidencia de que estaba cambiando, «, dijo el biólogo molecular de Ohio State Dan Jones, «tal vez la gente hubiera actuado de otra manera».
Científicos estadounidenses han detectado más de 500 casos de una variante identificada por primera vez en Gran Bretaña y esperan que se convierta en la causa de la mayoría de de las nuevas infecciones de este país en cuestión de semanas. Otra variante preocupante vinculada a Brasil y una tercera descubierta en Sudáfrica se detectaron la semana pasada en los EE. UU. y también se espera que se propaguen.
La variante británica es más contagiosa y se cree que es más letal que la original. , mientras que la de Sudáfrica puede hacer que las vacunas sean algo menos efectivas. El mayor temor es que eventualmente pueda surgir una variante resistente a las vacunas y tratamientos existentes.
También pueden formarse versiones potencialmente preocupantes dentro de los EE. UU. «Este virus está mutando y no le importa si está en Idaho o Sudáfrica», dijo Messaoudi.
El Dr. Benjamin Pinsky, director médico del Laboratorio de Virología Clínica de Stanford, explica cómo su laboratorio procesa muestras de las vías respiratorias superiores. de pacientes sospechosos de tener COVID-19 el miércoles 3 de febrero de 2021 en Palo Alto, California. Los virus mutan constantemente. Para adelantarse a la amenaza, los científicos analizan las muestras en busca de cambios genéticos, observando de cerca los que podrían hacer que el virus sea más infeccioso o más mortal. (Foto AP/Noah Berger)
Pero las verdaderas dimensiones del problema en EE. UU. no están claras debido al nivel relativamente bajo de secuenciación.
«Solo ves lo que hay debajo del poste de luz», dijo Kenny Beckman, director del Centro de Genómica de la Universidad de Minnesota, que comenzó a analizar la genética del virus la primavera pasada.
Después del comienzo lento, los laboratorios de salud pública en al menos 33 estados ahora están realizando análisis genéticos para identificar coronavirus emergentes. variantes. Otros estados han formado asociaciones con universidades o laboratorios privados para hacer el trabajo. Dakota del Norte, que comenzó a secuenciar la semana pasada, fue el más reciente en comenzar ese trabajo, según la Asociación de Laboratorios de Salud Pública.
Los CDC creen que se debe analizar un mínimo de 5000 a 10 000 muestras semanalmente en el laboratorio. Estados Unidos para monitorear adecuadamente las variantes, dijo Gregory Armstrong, quien supervisa el trabajo de detección molecular avanzada de la agencia. Y es solo ahora que la nación está alcanzando ese nivel, reconoció.
Aún así, es un revoltijo de enfoques: algunos laboratorios de salud pública secuencian cada muestra de virus positiva. Algunos se enfocan en muestras de ciertos brotes o ciertos pacientes. Otros seleccionan muestras al azar para analizarlas.
El Dr. Benjamin Pinsky, director médico del Laboratorio de Virología Clínica de Stanford, se encuentra en un laboratorio mientras los miembros del personal procesan muestras de prueba de COVID-19 el miércoles 3 de febrero de 2021 en Palo Alto. , California. Los virus mutan constantemente. Para adelantarse a la amenaza, los científicos analizan las muestras en busca de cambios genéticos, observando de cerca los que podrían hacer que el virus sea más infeccioso o más mortal. (Foto AP/Noah Berger)
Además, los laboratorios siguen teniendo problemas para obtener los suministros necesarios, como puntas de pipeta y productos químicos utilizados tanto en la secuenciación de genes como en las pruebas de diagnóstico.
El presidente Joe Biden, quien heredó la configuración de la administración Trump, está proponiendo un paquete de ayuda por el COVID-19 de 1,9 billones de dólares que exige aumentar el gasto federal en la secuenciación del virus, aunque la cantidad no se ha detallado y aún no se han resuelto otros detalles.
«Ocupamos el puesto 43 en el mundo en secuenciación genómica. Totalmente inaceptable», dijo el coordinador de respuesta al coronavirus de la Casa Blanca, Jeff Zients.
Durante más de cinco años, los laboratorios de salud pública de EE. hacen la secuenciación genómica, gracias en gran parte a un impulso federal para concentrarse en las fuentes de los brotes de intoxicación alimentaria.
Al comienzo de la pandemia, algunos laboratorios comenzaron a secuenciar el coronavirus de inmediato. El Departamento de Salud de Minnesota, por ejemplo, comenzó a hacerlo a las pocas semanas de sus primeros casos de COVID-19 en marzo, dijo Sara Vetter, subdirectora de laboratorio. «Eso nos puso un paso adelante», dijo.
El Dr. Benjamin Pinsky, director médico del Laboratorio de Virología Clínica de Stanford, explica cómo su laboratorio procesa muestras de las vías respiratorias superiores de pacientes sospechosos de tener COVID-19 el miércoles 2 de febrero. 3 de enero de 2021, en Palo Alto, California. Los virus mutan constantemente. Para adelantarse a la amenaza, los científicos analizan las muestras en busca de cambios genéticos, observando de cerca los que podrían hacer que el virus sea más infeccioso o más mortal. (Foto AP/Noah Berger)
El CDC también trabajó con ciertos estados para secuenciar cerca de 500 muestras en abril y más de mil muestras en mayo y junio.
Pero muchos laboratorios no lo hicieron lo mismo, especialmente aquellos sobrecargados con el aumento gradual de las pruebas de diagnóstico de coronavirus. Armstrong, de los CDC, dijo que en ese momento no podía justificar decirles a los laboratorios que hicieran más secuenciaciones cuando ya tenían las manos llenas y no había ninguna evidencia de que se necesitara tal análisis.
«Hasta un hace un mes, no estaba en la lista de cosas que se necesitan con urgencia. Fue bueno tenerlo», dijo Trevor Bedford, científico del Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson en Seattle. «Definitivamente hubo una falta de recursos federales asignados para hacer exactamente esto».
Al mismo tiempo, debido a las órdenes de quedarse en casa impuestas durante el brote, se les dijo a los investigadores de algunos laboratorios que no entraran. a trabajar, dijo Messaoudi.
«En lugar de tener un llamado a las armas», dijo, «enviaron a todos a casa».
- Un científico de laboratorio procesa muestras de las vías respiratorias superiores de pacientes sospechosos de tener COVID-19 en el St. anford Clinical Virology Laboratory el miércoles 3 de febrero de 2021 en Palo Alto, California. Los virus mutan constantemente. Para adelantarse a la amenaza, los científicos analizan las muestras en busca de cambios genéticos, observando de cerca los que podrían hacer que el virus sea más infeccioso o más mortal. (Foto AP/Noah Berger)
- Marilyn Mar, a la derecha, y Nai-Hua Jeng procesan muestras de las vías respiratorias superiores de pacientes sospechosos de tener COVID-19 en el Laboratorio Clínico de Virología de Stanford el miércoles 2 de febrero de 2019. 3 de enero de 2021, en Palo Alto, California. Los virus mutan constantemente. Para adelantarse a la amenaza, los científicos analizan las muestras en busca de cambios genéticos, observando de cerca los que podrían hacer que el virus sea más infeccioso o más mortal. (Foto AP/Noah Berger)
Durante el verano, sin embargo, un grupo de científicos hizo sonar la alarma sobre el estado de la vigilancia genómica en los EE. UU. y comenzó a presionar por algo más sistemático.
En noviembre, los CDC comenzaron a implementar un programa nacional para extraer y verificar especímenes de manera más metódica para determinar mejor qué cepas están circulando. Luego, en diciembre, EE. UU. recibió una llamada de atención cuando investigadores británicos anunciaron que habían identificado una variante que parece propagarse más fácilmente.
Los CDC reaccionaron anunciando que su programa de vigilancia se ampliaría para procesar 750 muestras. a nivel nacional por semana. La agencia también contrató a tres empresas, LabCorp, Quest Diagnostics e Illuminato, para secuenciar miles más cada semana. Los laboratorios estatales están haciendo miles por su cuenta.
Mientras tanto, es casi seguro que el brote está sembrando más mutaciones de COVID-19.
«Donde tenga rienda suelta, habrá habrá variantes significativas que evolucionen», dijo el Dr. Eric Topol, científico del Instituto de Investigación Scripps. «Mientras más secuenciación genómica, más podemos adelantarnos al virus».
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Cita: EE. UU. se apresura a ponerse al día en la carrera para detectar virus mutantes (4 de febrero de 2021) consultado el 30 de agosto de 2022 en https://medicalxpress.com/news/2021-02- mutant-viruses.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.