Panel más grande encuentra más mutaciones genéticas, objetivos de tratamiento para la leucemia
Drs. Ravindra Kolhe (izquierda) y Vamsi Kota. Crédito: Kim Ratliff, fotógrafa de la Universidad de Augusta.
Un panel de genes que busca unas 10 veces más genes causantes de cáncer que los paneles que se usan actualmente para diagnosticar y ajustar el tratamiento para una variedad de cánceres es efectivo para identificar genes problemáticos en el leucemia más común, informan los investigadores.
El panel de 523 genes, desarrollado por la empresa de biotecnología Illumina, con sede en San Diego, que incluye todos los genes que se sabe que pueden causar cáncer, se puede adoptar fácilmente para su uso en laboratorios clínicos para diagnosticar la leucemia mieloide aguda o AML, informan los investigadores. en la revista PLOS ONE.
Identificar más mutaciones genéticas en el cáncer de un individuo también permite un tratamiento más específico para ese paciente, dicen. Eso incluye encontrar mutaciones no asociadas previamente con su tipo de cáncer, lo que abre la puerta al uso de medicamentos dirigidos a esas mutaciones que tradicionalmente se han usado contra otros tipos de cáncer.
«Tener un panel más grande nos brinda más objetivos», dice Dr. Ravindra Kolhe, vicepresidente de investigación traslacional en el Departamento de Patología de la Facultad de Medicina de Georgia en la Universidad de Augusta.
«Parte de lo que encontramos aquí es que este panel 523 funciona para la leucemia y que es una herramienta práctica y clínicamente relevante para los laboratorios clínicos para la elaboración de perfiles moleculares de rutina del cáncer de la sangre», dice Kolhe, el autor correspondiente del estudio.
La AML es una enfermedad distinta en cada paciente porque, a medida que los investigadores aprenden cada vez más, la las mutaciones genéticas involucradas pueden no ser las mismas en dos pacientes, dice el Dr. Vamsi Kota, hematólogo/oncólogo de MCG que dirige el Programa de Trasplante de Médula Ósea y Células Madre en el Centro de Cáncer de Georgia y AU Health.
» El término ‘l eukemia’ es amplio y no deberíamos tratar a todos por igual», dice Kota, coautor del estudio. «Esa es una de las razones por las que ves que el mismo tratamiento funciona para algunos y no funciona para otros».
Los investigadores de MCG analizaron retrospectivamente 61 muestras de médula ósea, que incluían muestras de 40 pacientes con leucemia confirmada y detallaron información clínica sobre 27 de esos pacientes.
El panel más grande identificó 880 variantes en 292 genes, y solo el 14,8 % de las variantes estaban en genes incluidos en el panel más pequeño de 54 genes que actualmente utilizan muchos laboratorios, escriben. Las 749 variantes restantes normalmente no se evalúan en un diagnóstico de leucemia ni se detectan mediante el panel de 54 genes, señalan.
Cuando observaron la información disponible sobre esas 749 variantes en el seguimiento, encontraron al menos 14 de las variantes en 10 genes probablemente podrían contribuir a la LMA y el 96,2 % de los pacientes tenían al menos una de las 14 variantes nuevas. También encontraron 22 variantes en otros cinco genes asociados con otros tipos de tumores en la gran mayoría de los pacientes con AML.
Las nuevas variantes identificadas en los pacientes podrían ser significativas para proporcionar un diagnóstico y pronóstico más completos para los pacientes. y en una mejor identificación del tratamiento que se dirige más directamente a sus mutaciones asociadas con el cáncer, dicen.
A menudo hay una superposición en las mutaciones que contribuyen a los diferentes tipos de cáncer y la evaluación más amplia de las mutaciones presentes debería ayudar a identificar aquellas .
«Cuanto más sabemos, más aumenta nuestro conocimiento sobre la leucemia y nuestras formas de tratarla», dice Kota. «Si encuentra algo anormal en los genes, que está presente en otros tipos de cáncer, entonces podemos usar esos medicamentos en estos pacientes», agrega Kolhe.
«La esperanza es encontrar más de estas mutaciones, podemos Ya no llamamos al cáncer por un nombre, sino que lo llamamos y lo tratamos mediante las mutaciones», dice Kota.
El Laboratorio Esotérico y Molecular de Georgia, que dirige Kolhe, fue el primero en la nación en validar el 523 -panel de genes al comparar los resultados con métodos establecidos pero menos completos, como la reacción en cadena de la polimerasa utilizada para amplificar pequeños segmentos de ADN para buscar cambios sospechosos. Para este estudio, también analizaron las mismas muestras de médula ósea varias veces en el panel de 523 genes y encontraron esencialmente una consistencia del 100 % cada vez. También realizaron pruebas individuales en busca de mutaciones específicas identificadas por el panel, y esas también estuvieron consistentemente a la par con los hallazgos del panel. Descubrieron que el panel más grande era casi 100 % efectivo en cuanto a sensibilidad, especificidad, precisión y exactitud clínicas.
«Es un panel que podemos hacer consistentemente en un laboratorio de forma rutinaria de una manera rentable que aumenta nuestra comprensión de las mutaciones genéticas que contribuyen al cáncer de un paciente individual», dice Kota.
Si bien notó que el tamaño de la muestra era pequeño, hubo correlaciones clínicas interesantes, como encontrar siete mutaciones en un hombre de 23 años que le habían diagnosticado dos mutaciones. Las nuevas mutaciones que encontraron incluían dos nuevas variantes ahora asociadas con la leucemia y otros tipos de cáncer, dicen. El paciente, que tenía la mayor cantidad de mutaciones genéticas identificadas por el panel más grande, solo sobrevivió cuatro meses y dos días.
Kota señala que han pasado décadas sin avances reales en el tratamiento de la AML, pero este año seis Se han aprobado nuevos medicamentos, que se dirigen a seis mutaciones identificadas por los paneles de genes más pequeños. Kolhe espera que el nuevo panel ayude a expandir el número de nuevos medicamentos al menos 10 veces también.
«La idea de tener un panel más grande no solo confirma lo que ya sabemos sobre qué mutaciones están asociadas con un cáncer pero identificando otros nuevos», dice Kolhe.
«Lo que estamos haciendo es tomar ese panel de 50 genes y pasar al siguiente nivel con un panel de 523 genes y uno de nuestros objetivos incluye identificar 60 nuevos objetivos dentro de los próximos cinco años», dice Kolhe.
La mayoría de los pacientes con AML recaen dentro de los tres años posteriores al diagnóstico, y una identificación más amplia de los objetivos del tratamiento debería mejorar esos porcentajes, dicen.
El La Red Nacional Integral del Cáncer recomienda que las pruebas para la AML incluyan un análisis molecular de al menos los seis genes que ahora se sabe que son causantes de la AML.
Las pautas actuales también sugieren el uso de paneles multigénicos y secuenciación de próxima generación. para una evaluación pronóstica integral. La secuenciación de próxima generación es un enfoque de alto rendimiento, como el panel de 523 genes, que permite a los investigadores secuenciar de manera eficiente una gran cantidad de genes a la vez, incluso el genoma completo en un día. La secuenciación significa observar el orden de los cuatro pares de bases de ADNA, T, C y G para encontrar cambios que causen enfermedades.
Kota y Kolhe dicen que si bien los paneles de genes más pequeños son eficientes en términos de costo y tiempo, brindan un perfil mutacional incompleto, incluidas las omisiones de varias mutaciones de puntos críticos conocidas. La mayor comprensión de la heterogeneidad molecular del cáncer de la sangre, y también de otros tipos de cáncer, hace que la evaluación más amplia sea lógica, dicen. Señalan que el costo del panel más amplio no es más alto que la prueba de los seis genes asociados con la AML.
Las células madre sanguíneas de la médula ósea producen glóbulos blancos que nos ayudan a combatir las infecciones y las células formadoras de sangre. llamadas células mieloides, y la LMA puede afectar a ambas.
Explore más
El nuevo modelo de los investigadores de CHOP identifica mutaciones no codificantes en cinco cánceres pediátricos Más información: Nikhil Shri Sahajpal et al. Rendimiento clínico y utilidad de un panel integral de secuenciación de ADN de próxima generación para el análisis simultáneo de variantes, TMB y MSI para neoplasias mieloides, PLOS ONE (2020). DOI: 10.1371/journal.pone.0240976 Información de la revista: PLoS ONE
Proporcionado por Medical College of Georgia en la Universidad de Augusta Cita: Panel más grande encuentra más mutaciones genéticas, objetivos de tratamiento para la leucemia (2021, 1 de febrero) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-02-larger-panel-gene-mutations-treatment.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.