Cómo se encontró la variante sudafricana de COVID-19
Posiciones de las mutaciones identificadas en la nueva variante SA mostradas en rojo en la estructura de la proteína espiga del SARS-CoV-2 (PDB: 7a94). El dominio N-terminal y el dominio de unión al receptor de la espiga se muestran en tonos de azul y verde, respectivamente. La parte restante de la proteína espiga y el receptor ACE2 humano están en gris y negro, respectivamente. Crédito: laboratorio Godzik, UC Riverside.
Están apareciendo variantes del coronavirus en diferentes partes del mundo, muchas de ellas propagándose a una velocidad alarmante. Una variante contagiosa es la variante sudafricana, o SA, identificada por un equipo internacional de investigadores, incluidos científicos biomédicos de la Universidad de California, Riverside.
«Las nuevas variantes de COVID-19 son la próxima nueva frontera», dijo Adam Godzik, profesor de ciencias biomédicas en la Facultad de Medicina de UC Riverside y miembro del equipo de investigación que hizo el descubrimiento. «De estas, las cepas SA y Brasil son las más preocupantes. Tienen mutaciones que las hacen resistentes a los anticuerpos que generamos con las vacunas existentes. Comúnmente se cree que estamos en una carrera reñida: a menos que vacunemos a las personas rápidamente y aplastemos la pandemia, nuevas dominarían hasta el punto de que todas nuestras vacunas contra el COVID-19 serían ineficaces».
Godzik y Arghavan Alisoltani-Dehkordi, un investigador postdoctoral que se unió a su laboratorio hace dos años, ayudaron a caracterizar la nueva variante SA por proporcionando su estructura de proteína de punta usando simulaciones por computadora.
Los resultados del estudio aparecen hoy en Nature.
Alisoltani-Dehkordi, quien fue becaria postdoctoral en la Universidad de Ciudad del Cabo en Sudáfrica antes de se unió a la UCR, mencionó que equipos de investigación de la Universidad de KwaZulu-Natal en Sudáfrica y la Universidad de Ciudad del Cabo descubrieron el nuevo linaje o variante del SARS-CoV-2, el virus que causa el COVID-19, a partir de muestras recolectadas entre el 15 y el 15 de octubre. 25 de noviembre de 2020, en tres provincias sudafricanas. A principios de noviembre, esta variante se convirtió rápidamente en la variante dominante en las muestras de dos provincias.
«Cada variante del SARS-CoV-2 tiene mutaciones específicas que la definen», dijo Alisoltani-Dehkordi. «El profesor Godzik y yo usamos modelos informáticos para sugerir las posibles consecuencias estructurales y funcionales de las mutaciones de la proteína espiga en el linaje SA. Nuestro análisis, confirmado también por varios otros grupos de investigación, muestra que algunas de las mutaciones pueden resultar en una mayor transmisibilidad del virus. y una respuesta inmunitaria más débil».
La variante SA se ha detectado en al menos 40 países, incluidos los Estados Unidos.
«Esta variante probablemente se está propagando en áreas donde no ha sido secuenciado y, por lo tanto, no es identificable», dijo Godzik. «En los EE. UU., la secuenciación sigue siendo un proceso lento. En muchas partes del país, incluido Riverside, no tenemos ningún tipo de información sobre las variantes».
La investigación inicial sobre la variante SA sugirió que podría ser resistente a anticuerpos, que podrían reducir la eficacia de las vacunas.
«Fue entonces cuando recibió un alto nivel de interés», dijo Godzik. «La investigación posterior confirmó que es resistente a las vacunas y se está propagando. Sin embargo, Sudáfrica está haciendo un buen trabajo controlando la variante a través de la cuarentena y otras medidas».
Todo el SARS-CoV-2 recién surgido las variantes de interés en el Reino Unido, Sudáfrica, Brasil y California muestran firmas mutacionales comunes. Pero cada una de estas variantes también tiene un conjunto único de mutaciones. Por ejemplo, las variantes SA y Brazil tienen dos mutaciones únicas en las proteínas de pico K417N y E484K, respectivamente.
«Nuestros hallazgos preliminares indican que algunas de las mutaciones de pico pueden estar asociadas con una mayor transmisibilidad de la variante SA, dijo Alisoltani-Dehkordi. «Sin embargo, aún no se ha determinado la importancia total de la espiga y otras mutaciones del genoma en este nuevo linaje. Se debe enfatizar que no tenemos suficiente evidencia que confirme la mayor progresión de la enfermedad, la gravedad o la tasa de mortalidad asociada con la SA linaje en comparación con otros linajes, pero la alta transmisibilidad y la divergencia inusual del linaje SA y otros linajes surgidos recientemente en comparación con el tipo salvaje crea una gran demanda de vigilancia sistemática de las cepas de SARS-CoV-2 y la detección temprana de variantes antes de que se conviertan. en brotes».
Godzik explicó que no existe un solo virus COVID-19. En cambio, existe una población de virus que evoluciona constantemente. Las variantes, que también evolucionan, adquieren mutaciones y pueden sufrir un escape viral en cualquier momento.
«Es difícil decir que solo hay una variante SA», dijo. «Una forma de entender esto es imaginar que esta variante es la rama principal de un árbol, que tiene muchas ramas más pequeñas. Algunas de estas más pequeñas pueden crecer más rápido que otras y asumir más importancia. Este proceso dinámico es difícil de predecir».
Godzik predice que la COVID-19 será una presencia constante en nuestras vidas, al igual que la gripe.
«Se necesitan seis meses para desarrollar una vacuna contra la gripe», dijo. «Los modelos predicen la evolución del virus de la gripe y las vacunas se producen antes de que aparezcan las variantes. Si las predicciones son buenas, las vacunas funcionan. Si fallan, sigue una fuerte temporada de gripe. Así es como probablemente se comportará la COVID-19. A se invertirá mucho esfuerzo en predecir lo que sucederá el año siguiente, las vacunas se actualizarán y las personas deberán recibir una vacuna de refuerzo».
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Siga las últimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) Más información: Houriiyah Tegally et al. Aparición de una variante preocupante del SARS-CoV-2 con mutaciones en la glicoproteína espiga, Nature (2021). DOI: 10.1038/s41586-021-03402-9 Información del diario: Nature
Proporcionado por la Universidad de California – Riverside Cita: Cómo la variante sudafricana de COVID-19 fue encontrado (2021, 9 de marzo) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-03-south-african-covid-variant.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.