El análisis de proteómica identifica objetivos farmacológicos potenciales para cánceres humanos agresivos
Proteínas compartidas entre el grado específico del tipo de cáncer comparando el grado más alto con el grado más bajo (rojo, expresión más alta con un grado más alto; blanco, no significativo con p>0.05.) . Crédito: Monsivais, et al/Oncogene, 2021
Investigadores del Baylor College of Medicine muestran que el análisis de la proteómica, o todos los datos de proteínas, de cánceres humanos agresivos es un enfoque útil para identificar posibles objetivos terapéuticos novedosos. Informan en la revista Oncogene, la identificación de «firmas proteómicas» que están asociadas con medidas clínicas de enfermedad agresiva para cada uno de los siete tipos de cáncer estudiados. Algunas firmas se compartieron entre diferentes tipos de cáncer e incluyeron vías celulares de metabolismo alterado. Es importante destacar que los resultados experimentales proporcionaron una prueba de concepto de que su enfoque de análisis proteómico es una estrategia valiosa para identificar objetivos terapéuticos potenciales.
«Hay dos aspectos notables de este estudio. Uno es que exploramos el panorama proteómico del cáncer en busca de proteínas que se expresaron en asociación con formas agresivas de cáncer», dijo el coautor correspondiente, el Dr. Chad Creighton, profesor de medicina y codirector de Bioinformática del Cáncer en el Centro Integral del Cáncer Dan L Duncan en Baylor. «Analizamos datos de proteínas que incluían decenas de miles de proteínas de alrededor de 800 tumores, incluidos siete tipos diferentes de cáncer de mama, colon, pulmón, riñón, ovario, útero y glioma pediátrico, disponibles gracias a la espectrometría de masas del Consorcio de Análisis de Tumores Proteómicos Clínicos (CPTAC). conjuntos de datos proteómicos».
El análisis computacional de los conjuntos de datos CPTAC identificó firmas proteómicas asociadas con formas agresivas de cáncer. Estas firmas apuntaron a vías celulares alteradas que podrían estar impulsando un comportamiento agresivo del cáncer y podrían representar nuevos objetivos terapéuticos. Cada tipo de cáncer mostró una firma proteómica distintiva por su forma agresiva. Curiosamente, algunas firmas eran comunes a diferentes tipos de cáncer.
El otro aspecto de este estudio fue proporcionar una prueba de concepto de que el análisis proteómico era una estrategia útil para identificar impulsores de enfermedades agresivas que podrían potencialmente manipularse para controlar el crecimiento del cáncer.
«Eso es exactamente lo que pudimos hacer con este nuevo y poderoso conjunto de datos», dijo la coautora para la correspondencia, la Dra. Diana Monsivais, profesora asistente de patología e inmunología en Baylor . «Nos enfocamos en los datos de cáncer uterino para los cuales el análisis computacional identificó alteraciones en varias proteínas que estaban asociadas con cáncer agresivo. Seleccionamos proteínas quinasas, enzimas que representarían candidatos más fuertes para la terapia».
Of cientos de candidatos iniciales, los investigadores seleccionaron cuatro quinasas para estudios funcionales en líneas celulares de cáncer de útero. Descubrieron que las quinasas no solo se expresaban en las líneas de células de cáncer uterino, sino que la manipulación de la expresión de algunas de las quinasas reducía la supervivencia o la capacidad de migrar de algunas células de cáncer uterino. La migración celular es una propiedad de las células cancerosas que les permite propagar el cáncer a otros tejidos.
Este trabajo es el resultado de una colaboración productiva entre dos centros de Baylor, el Centro Oncológico Integral Dan L Duncan y el Centro de Descubrimiento de fármacos.
«Chad realizó este maravilloso análisis en nuevos conjuntos de datos CPTAC y estaba interesado en validarlo en un cáncer humano. Se acercó a nosotros para realizar estudios funcionales para determinar si algunas proteínas podrían traducirse en nuevos objetivos para el endometrio cáncer», dijo Monsivais. «Nuestros experimentos proporcionaron una prueba de concepto de que el análisis proteómico es una estrategia útil no solo para comprender mejor qué provoca el cáncer, sino también para identificar nuevas formas de controlarlo o eliminarlo».
«Históricamente, los investigadores han solo ha estado generando datos transcriptómicos (el ARN mensajero (ARNm) que se traduce en proteína). Observar los datos de proteínas en sí, que pone a disposición el CPTAC, permite a los investigadores extraer una nueva capa de información de estos cánceres», dijo Creighton . «En este estudio, comparamos las firmas de ARNm y proteínas y, aunque en muchos casos se superpusieron, aproximadamente la mitad de las proteínas en las firmas proteómicas no se incluyeron en la firma de ARNm correspondiente, lo que sugiere la necesidad de incluir datos de proteínas y ARNm en estudios de cáncer. .»
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Nuevos jugadores potenciales del cáncer revelados por un extenso análisis de proteínas tumorales Más información: Diana Monsivais et al, Los correlatos proteómicos basados en espectrometría de masas de grado y etapa revelan vías y quinasas asociadas con cánceres humanos agresivos, Oncogene (2021). DOI: 10.1038/s41388-021-01681-0 Información de la revista: Oncogene
Proporcionado por Baylor College of Medicine Cita: El análisis de proteómica identifica posibles objetivos farmacológicos para humanos agresivos cancers (2021, 4 de marzo) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-03-proteomics-analysis-potential-drug-aggressive.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.