Inspirado en el almacenamiento de datos: una nueva plataforma integra sistemas de información dispares
Representación gráfica de cómo RINS integra información en sistemas dispares. Crédito: Danielle Hutchison.
Los centros médicos académicos se esfuerzan continuamente por mejorar la atención al paciente. Uno de los principales mecanismos para mejorar los resultados de salud de los pacientes es a través de la investigación traslacional, que lleva los avances de la investigación del laboratorio a los pacientes a través de ensayos clínicos. Hacer que los ensayos clínicos sean más eficientes y, en última instancia, más exitosos, mejoraría significativamente la atención al paciente. Sin embargo, la fragmentación de los datos relevantes necesarios para implementar mejoras en la ciencia traslacional es una barrera importante.
Si bien algunas herramientas bioinformáticas intentaron abordar este problema, a menudo carecían de la capacidad de evaluar la eficiencia de la ciencia traslacional. Investigadores del Instituto de Investigación Clínica y Traslacional de Carolina del Sur (SCTR), un centro de Premios de Ciencias Clínicas y Traslacionales (CTSA) con un hogar académico en la Universidad Médica de Carolina del Sur (MUSC), han desarrollado una nueva herramienta bioinformática llamada RINS, el Research Red integrada de sistemas, que se puede utilizar para evaluar si las mejoras en el proceso de ensayos clínicos están marcando la diferencia. Sus resultados, publicados en línea el 17 de marzo en el Journal of the American Medical Informatics Association, mostraron que RINS puede integrar datos sobre estudios clínicos en sistemas dispares y proporcionar métricas sobre la eficiencia y eficacia de los ensayos clínicos de MUSC.
«Usted podría llamarlo metadatos: datos sobre cómo producimos datos en los estudios o cómo ponemos en marcha los estudios y los aceleramos», dijo Leslie A. Lenert, MD, directora de información de investigación de MUSC y directora del Centro de Informática Biomédica (BMIC ). «Todos estaban en un lugar diferente, en un formato diferente, usando números que no tenían una definición acordada. Pero reunimos todo en una vista para obtener una visión integral de los procesos para hacer ciencia. Y nosotros ‘ Nunca había tenido eso antes porque los datos vivían en sistemas dispares».
Tomar decisiones informadas sobre cómo mejorar y optimizar las prácticas de investigación traslacional requiere datos detallados, y para acumular esos datos, las instituciones necesitan herramientas de evaluación sólidas. Con ese fin, MUSC ha desarrollado y utilizado un sistema de gestión de transacciones de investigación, SPARCRequest, que proporciona una poderosa herramienta para ayudar a los investigadores a determinar los presupuestos para las solicitudes de subvenciones, navegar el proceso regulatorio, reclutar diversos participantes en el estudio y realizar ensayos clínicos. Como plataforma de código abierto, SPARCRequest es utilizado por 12 CTSA y centros de investigación clínica y de traducción (CTR) que comprenden 27 instituciones en todo el país.
Si bien SPARCRequest fue fundamental para optimizar la investigación clínica, originalmente no lo era. configurado para el seguimiento de métricas en sistemas dispares. Para abordar ese problema, Lenert se acercó a Royce R. Sampson, director de operaciones de SCTR y uno de los inventores de SPARCRequest, con la idea de generar un data mart de investigación. El data mart, imaginado por Lenert, llevó las actividades de seguimiento de métricas de investigación que Sampson ya estaba liderando con SPARCRequest al siguiente nivel y permitió el seguimiento y la comunicación de grupos interdisciplinarios.
«Un data mart de investigación es un almacén de datos que integra datos de múltiples sistemas en un formato que facilita la devolución de métricas y análisis de diferentes sistemas», dijo Katie G. Kirchoff, administradora de la base de datos que dirige el data mart de investigación para BMIC.
» Es un concepto simple, pero difícil de ejecutar», agregó Lenert, quien también se desempeña como rector adjunto de Ciencias de la Información e Informática. «Nadie ha tenido la oportunidad de reunir estos diversos sistemas para decirnos cuánto tiempo lleva aprobar un protocolo de la junta de revisión institucional o si esta financiación llevó a ese resultado, esas son cosas difíciles de hacer».
In Para albergar y acceder a los datos dentro del almacén, el equipo de RINS necesitaba una forma de identificar cada estudio de manera única y vincular los sistemas dispares. Para resolver el problema de identificar cada estudio, el equipo creó un identificador maestro de investigación (RMID).
«RMID nos ayudó a poder tener un sistema de numeración de protocolo estandarizado para poder vincular los sistemas que tenemos en -casa», dijo Sampson. «RINS es la plataforma donde lo unimos todo».
La conexión de varios sistemas se logró mediante el desarrollo de interfaces de programación de aplicaciones (API). Las API unen los sistemas y permiten que los datos se actualicen en todos los sistemas casi en tiempo real.
Usando RMID y API, RINS integra SPARCRequest con otras bases de datos electrónicas, incluido el registro de salud electrónico de MUSC; junta de revisión institucional electrónica; y sistemas para la gestión de concesión de subvenciones, seguimiento de gastos y gestión de ensayos clínicos. RINS ha sido lo suficientemente flexible para adaptarse a nuevos programas y al mismo tiempo mantener datos históricos.
Como un nuevo almacén de datos digitales, RINS proporciona dos mejoras clave para monitorear los datos de ciencia traslacional. La primera mejora es la integración de sistemas dispares en una plataforma. Esto permite una imagen más completa de los procesos de investigación e identifica los éxitos y desafíos de los ensayos clínicos.
La segunda mejora es el uso de un sistema descentralizado. La mayoría de las plataformas utilizan un sistema centralizado que requeriría que cada área de administración de la investigación adoptara cualquier sistema que se hubiera integrado en la solución centralizada, incluso si no era el que mejor se adaptaba a sus necesidades. En contraste, RINS es un sistema descentralizado que permite que cada grupo use su sistema preferido mientras mantiene informes completos e integrados. Esto permite, por ejemplo, realizar un seguimiento de los estudios clínicos en todos los sistemas para dar una idea mucho más clara del ciclo de vida del proyecto, proporciona métricas sobre el impacto de los esfuerzos de traducción e identifica áreas para mejorar la eficiencia de los ensayos clínicos.
«No estamos tratando de construir un sistema que se adapte a todas las necesidades, pero en realidad estamos utilizando los sistemas existentes y vinculándolos para satisfacer las necesidades de informes», dijo Wenjun He, ingeniero de sistemas de SCTR y autor principal del informe. . «Siempre podemos expandirlo a cualquier sistema nuevo en el campus, es una transición perfecta».
A medida que más instituciones analizan el rendimiento de sus programas y más agencias de financiación requieren datos de rendimiento, las instituciones pueden buscar ayuda en RINS. . Si bien RINS es una plataforma de código abierto en MUSC, podría ser difícil para otras instituciones adoptar la plataforma tal cual.
«En este punto, está personalizado para los sistemas que utilizamos», dijo Andrew. M. Cates, director de Investigación de Soluciones Web. “Se podrían hacer nuevas integraciones, pero otra institución no puede empezar a usarlo sin tener que hacer algunas personalizaciones o tener sistemas similares a los que tenemos en MUSC”.
Aunque actualmente no está disponible para todas las instituciones, RINS ha despertado el interés del Consorcio de Código Abierto SPARCRequest y puede ayudar a estas instituciones a hacer la transición hacia un mejor monitoreo de métricas. Debido a que muchas de estas instituciones ya emplean SPARC, podría ser más fácil para ellas integrar una gama más amplia de sistemas a través de RINS.
Trabajar juntos en una amplia gama de sistemas ayuda a garantizar que los ensayos clínicos se desarrollen sin problemas y de manera efectiva. . A través de herramientas como RINS y una gran cantidad de servicios y recursos, SCTR apoya a los investigadores en la realización de investigaciones efectivas.
«El objetivo es mejorar el rendimiento de los ensayos y equipos de estudio y eliminar las barreras y los desafíos para la investigación clínica, dijo Samson. «SCTR brinda más de 900 consultas, servicios y recursos por año para apoyar y educar a los equipos de estudio. RINS permite nuestra capacidad para identificar oportunidades a nivel institucional».
En general, RINS es una herramienta poderosa para extraer datos críticos sobre la ciencia traslacional. RINS integra datos de estudios clínicos a través de sistemas dispares y proporciona análisis que pueden usarse para mejorar el proceso de ensayo clínico. La Oficina de Investigación Clínica ha sido una parte interesada integral, crítica y líder en RINS y con su apoyo continuo, el futuro de RINS podría incorporar datos de las ciencias básicas para proporcionar nuevos datos sobre la concesión de subvenciones para investigación, instalaciones centrales y ciencia innovadora.
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Las nuevas tecnologías vinculan los tratamientos con los pacientes que más los necesitan Más información: Wenjun He et al, Research Integrated Network of Systems (RINS): un almacén de datos virtual para la aceleración de la investigación traslacional, Journal of the American Medical Informatics Association (2021). DOI: 10.1093/jamia/ocab023 Información de la revista: Journal of the American Medical Informatics Association
Proporcionado por Medical University of South Carolina Cita: Inspirado en el almacenamiento de datos: A nueva plataforma integra sistemas de información dispares (2021, 16 de abril) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-04-warehousing-platform-disparate.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.