Análisis de sangre de ADN del cáncer validados por un equipo de investigación internacional
Modelo 3D de ADN. Crédito: Michael Strck/Wikimedia/ GNU Free Documentation License
Un equipo internacional informa hoy los hallazgos de una evaluación independiente de cinco ensayos disponibles comercialmente para la secuenciación del ADN tumoral, un método rápido, económico y menos invasivo para diagnosticar y monitorear el cáncer.
Los investigadores revelaron que todos los ensayos podían detectar de forma fiable el llamado ADN tumoral circulante (ctDNA) cuando constituía el 0,5 % del ADN total en la sangre, un nivel de sensibilidad que permite la detección, el análisis genético y el seguimiento de la etapa tardía y tumores metastásicos.
Publicado en la revista Nature Biotechnology, el estudio es un hito importante para el uso de ensayos de ctDNA como diagnóstico de cáncer, que describe pautas de mejores prácticas y descubre áreas clave de desarrollo futuro.
La investigación fue dirigida por el Instituto Garvan de Investigación Médica, el Centro Nacional de Investigación Toxicológica de la FDA y la Universidad de Ciencias Médicas de Arkansas. Forma parte del proyecto Fase 2 de control de calidad de secuenciación liderado por la FDA, cuyo objetivo es desarrollar protocolos estándar y métricas de control de calidad para el uso de secuenciación de próxima generación en medicina de precisión, para que sea una realidad para los pacientes.
«Para que los ensayos de ctDNA sean de beneficio para los pacientes en la clínica, necesitan detectar de manera precisa y consistente las mutaciones del cáncer en diferentes laboratorios y muestras. Nuestro estudio es la evaluación más completa del rendimiento analítico entre los ensayos de ctDNA hasta la fecha y representa un importante paso adelante en el campo», dice el primer autor, el Dr. Ira Deveson del Instituto Garvan.
Secuenciación de próxima generación para monitorear el ADN del cáncer
Cuando las células cancerosas se desarrollan, se acumulan mutaciones en su ADN, cuyos fragmentos ingresan al torrente sanguíneo cuando las células cancerosas se descomponen. Gracias a los ensayos que emplean la secuenciación de próxima generación, estos fragmentos de ctDNA ahora pueden detectarse en las muestras de sangre de un paciente, lo que podría usarse para identificar y monitorear el cáncer como una alternativa a las biopsias de tejido más invasivas.
Sin embargo, mientras Los ensayos de ctDNA ya se están adoptando en ensayos clínicos de oncología de precisión, los investigadores y los médicos aún carecen de un conocimiento profundo de cuán precisos son los ensayos actuales y qué aspectos de la tecnología aún deben mejorarse. Este conocimiento ayuda a definir para qué aplicaciones es adecuada y necesaria la secuenciación de ctDNA antes de que la secuenciación de ctDNA pueda implementarse ampliamente en la práctica clínica.
En su estudio, investigadores de 12 laboratorios participantes en Europa, Asia y Estados Unidos evaluaron el rendimiento de los ensayos actuales de ctDNA líderes en la industria, de las empresas Roche Sequencing Solutions, Illumina, Integrated DNA Technologies y Burning Rock Dx y Thermo Fisher Scientific.
Probaron los ensayos utilizando experimentos sintéticos y muestras de referencia de ctDNA simuladas . Su análisis reveló que todos los laboratorios detectaron mutaciones de ctDNA por encima del 0,5 % de frecuencia relativa (en consonancia con tumores metastásicos y en etapa tardía) con alta sensibilidad, precisión y reproducibilidad utilizando todos los ensayos participantes. Sin embargo, los ensayos detectaron niveles más bajos de ctDNA (consistentes con cáncer en etapa temprana o signos tempranos de recaída de la enfermedad) de manera poco confiable e inconsistente entre diferentes pruebas.
En su artículo publicado, los investigadores describen las prioridades para el desarrollo futuro de ensayos de ctDNA, que dicen ayudará a avanzar la tecnología para aplicaciones clínicas en el control de la progresión tumoral, la respuesta a la terapia y la recaída del cáncer.
«Nuestros hallazgos indican que los ensayos de ctDNA participantes pueden ser adecuados para la estratificación molecular y perfilar la evolución del tumor en pacientes con cáncer avanzado. Esto debería ayudar a despejar el camino para ensayos clínicos más avanzados de ensayos de ctDNA», dice el profesor asociado Donald Johann Jr., MD, de la Facultad de Ciencias Médicas de la Universidad de Arkansas para los departamentos de Informática Biomédica y Medicina Interna.
«Comprender los límites de detección de los ensayos actuales fue un paso crucial hacia un futuro en el que los análisis de sangre se pueden realizar de forma rutinaria utilizado como una herramienta de detección del cáncer. Este estudio crítico es una evaluación analítica exhaustiva de los ensayos de ctDNA, que definió los límites de diagnóstico, evaluó la reproducibilidad e identificó variables experimentales clave que afectan el rendimiento, y que ha sido solicitada por organizaciones gubernamentales, reguladoras y clínicas», dice el Dr. Joshua Xu del Centro Nacional de Investigación Toxicológica de la FDA de EE. UU.
«Nuestro análisis de rendimiento independiente es un mecanismo crucial para impulsar los avances en los enfoques de secuenciación de próxima generación para su uso en la detección y el tratamiento del cáncer. Esperamos que ayude a mejorar la sensibilidad y la confiabilidad de las pruebas para diagnosticar tumores en etapas tempranas», dice el coautor principal, el profesor asociado Tim Mercer del Instituto Garvan y el Instituto Australiano de Bioingeniería y Nanotecnología de la Universidad de Queensland.
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Evidencia limitada de validez clínica, utilidad de ctDNA Más información: Evaluación de la validez analítica de los ensayos de secuenciación de ADN tumoral circulante para oncología de precisión, Nature Biotechnology (2021). DOI: 10.1038/s41587 -021-00857-z Información de la revista: Nature Biotechnology
Proporcionado por el Instituto Garvan de Investigación Médica Cita: Análisis de sangre de ADN del cáncer validados por un equipo de investigación internacional (2021, 12 de abril) obtenido el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-04-cancer-dna-blood-validated-international.html Este documento está sujeto a derechos de autor. estudiante dy o investigación, ninguna parte puede ser reproducida sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.