Seguimiento de la transmisión de distintas variantes del SARS ‑ COV ‑ 2 de China y Europa a África occidental
El mapa geográfico revela distintos patrones de introducción de variantes del virus basadas en China y Europa en los países de África occidental (hasta abril de 2020). Crédito: Wruck, W, Adjaye J, Heinrich-Heine-University Dsseldorf, Alemania
Al comienzo de la pandemia del SARS-CoV-2, surgieron temores de que abrumaría los débiles sistemas de salud en muchos países africanos. Sin embargo, resultó que Europa y América tenían incidencias y tasas de mortalidad mucho más altas en comparación con África. Las razones de esto pueden residir en las poblaciones relativamente jóvenes, infecciones virales previas y el clima cálido. Sin embargo, el SARS-CoV-2 afectó a todos los países africanos y, por lo tanto, se iniciaron iniciativas para una distribución mundial de vacunas. Los genomas de los aislados virales se secuencian continuamente en la mayoría de los países. Las secuencias de ADN pueden someterse a análisis filogenéticos para identificar los orígenes de las variantes virales y monitorear el desarrollo y la distribución de nuevas variantes que pueden ser más leves o, en el peor de los casos, más letales. Investigadores de la Universidad Heinrich-Heine de Dsseldorf ahora han revelado patrones distintos de variantes del SARS-CoV-2 en un análisis filogenético de secuencias virales de los países de África occidental Gambia, Ghana, Nigeria y Senegal. El Prof. Dr. James Adjaye es el autor principal del estudio, publicado en Scientific Reports. El bioinformático Wasco Wruck es el primer autor del artículo.
Aunque los cuatro países investigados tienen condiciones geográficas y climáticas similares, los investigadores encontraron distintos patrones de variantes del virus. Esto puede reflejar un mecanismo de deriva genética llamado «efecto fundador» donde la diversidad genética es impulsada por solo una pequeña parte de una población que forma una nueva población separada, por ejemplo, las personas infectadas particulares que transmiten variantes del virus de Francia a Senegal. «Cuando observa los distintos patrones de las variantes del virus, puede ver directamente las relaciones históricas, por ejemplo, Senegal era una colonia francesa y tiene un patrón similar al de Francia porque todavía hay mucho tráfico y comercio entre Senegal y Francia. Ghana y Nigeria son ambos. ex colonias británicas con patrones virales similares. Ambos países tienen vínculos comerciales y laborales con Europa y China», dice James Adjaye, profesor ghanés-británico de la Facultad de Medicina de la Universidad Heinrich-Heine de Dsseldorf y director del Instituto de Stem Investigación Celular y Medicina Regenerativa. Wruck agrega que «sorprendentemente, descubrimos que las variantes posteriores de Europa se detectaron antes que las variantes anteriores. Las explicaciones para esto podrían ser que las variantes anteriores del virus circularon de forma latente, y las variantes posteriores se detectaron antes debido a una mayor transmisibilidad del virus».
Como el SARS-CoV-2 es un virus de ARN, pueden surgir mutaciones cuando el ARN se copia dentro de las células huésped humanas. En el análisis filogenético, patrones similares de mutaciones que apuntan a orígenes similares se agrupan en ramas de un árbol que, si son lo suficientemente grandes, pueden denominarse variantes. Las mutaciones pueden no tener ningún efecto o pueden dar lugar a sustituciones de aminoácidos que pueden alterar la función o la estructura de las proteínas virales. El Prof. Adjaye y su colega descargaron secuencias de SARS-CoV-2 de los cuatro países de África Occidental de la base de datos GISAID y usaron secuencias de China, Europa y América como referencia. Empleando análisis filogenéticos, estas secuencias podrían asociarse con variantes virales, además, podrían detectarse distintos patrones de variantes para cada país. En la primera fase del estudio en abril de 2020, la sustitución de aminoácidos más destacada fue un cambio de ácido aspártico (D) por glicina (G) en la posición 614 (D614G) dentro de la proteína espiga del virus (causada por el ARN mutación A23403G). Wruck dice que «vimos que D614G reemplazó gradualmente otras variantes en abril de 2020. En junio de 2021, las reemplazó y se incluyó en todas las variantes nuevas, como alfa () y delta (). En octubre de 2021, la variante delta dominó y en el futuro, la pregunta será qué subvariante de delta prevalecerá». La variante delta se propaga con una ventaja evolutiva porque la sustitución de aminoácidos conduce a una mayor transmisión dentro de la población.
«En abril de 2020 solo pudimos detectar algunas mutaciones raras que parecían originarse en África occidental, en junio 2021 estaba la variante Eta () que se originó en Nigeria», comenta Wruck. Adjaye agrega que «se necesita un monitoreo continuo de las secuencias virales para permitir el control de la transmisión de nuevas variantes y evaluar la eficacia de la vacuna. Sin embargo, para futuras terapias también es crucial comprender mejor los mecanismos subyacentes a COVID19 como lo hicimos en una publicación anterior que aclara cambios moleculares resultantes de la infección de SARS-CoV-2 en las células pulmonares El riñón es el segundo órgano más afectado y ha habido informes de adultos infectados con COVID-19 que han desarrollado lesión renal aguda (AKI) y una pérdida repentina de riñón «Actualmente estamos introduciendo proteína de punta producida en laboratorio (que es la base de las vacunas actuales) en células de riñón humano aisladas de muestras de orina. Este trabajo debería arrojar luz sobre los genes y las vías farmacológicas asociadas con la tormenta de citocinas, el daño celular y la lesión renal. .»
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Los anticuerpos COVID-19 permanecen en el cuerpo 10 meses después de la infección Más información: Wasco Wruck et al, Un análisis filogenético detallado rastrea la transmisión de distintas variantes de SARS-COV-2 de China y Europa a África Occidental, Scientific Reports (2021). DOI: 10.1038/s41598-021-00267-w Información de la revista: Scientific Reports
Proporcionado por la Universidad Heinrich-Heine de Düsseldorf Cita: seguimiento de la transmisión de distintas variantes de SARSCOV2 de China and Europe to West Africa (2021, 16 de noviembre) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-11-tracking-transmission-distinct-sarscov2-variants.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.