Coronavirus mutante: lo que significa para todos nosotros

Las pruebas de diagnóstico buscan ciertos genes del coronavirus. No buscan una coincidencia en todo el genoma. Crédito: Exposure Visuals

Un hito importante en la lucha contra el COVID-19 se produjo a principios de enero de 2020, cuando se secuenció por primera vez el genoma viral completo del nuevo coronavirus que causa la enfermedad. Desde entonces, se ha secuenciado el genoma completo del coronavirus, tomado de miles de pacientes infectados en todo el mundo.

Este vasto banco de secuencias genómicas es un recurso importante. Particularmente porque los virus como el coronavirus tienen una alta tasa de mutación, con la secuencia del genoma variando hasta en un 0,02%. Esto puede parecer bajo, pero teniendo en cuenta que el genoma humano varía solo un 0,001 % entre individuos, está claro que el virus muta mucho más rápido que nosotros y puede evolucionar rápidamente.

La secuenciación del coronavirus en diferentes momentos puede decirnos cómo se está adaptando y puede indicar la dirección que probablemente tomará.

En un estudio reciente, la London School of Hygiene and Tropical Medicine (LSHTM) analizó las secuencias del genoma viral aisladas de más de 5000 pacientes con COVID-19 en todo el mundo. Entonces, ¿qué nos dice este análisis de las variaciones del genoma? ¿Qué implicaciones tiene para las vacunas, los tratamientos y las pruebas? ¿Y qué nos dice acerca de la dirección futura de este patógeno destructivo?

Vacunas

Todas las vacunas virales contienen material que se parece al virus contra el que intentan protegerse. Esto engaña al sistema inmunitario para que genere una respuesta y produzca anticuerpos listos para ser utilizados en caso de que se encuentre con algo real. En el caso del coronavirus, el sistema inmunitario produce anticuerpos que se dirigen a la proteína espiga, la parte del virus que se utiliza para invadir nuestras células.

Una preocupación es que el virus mute para formar «mutantes de escape». Estas son versiones mutadas del virus que los anticuerpos inducidos por la vacuna no reconocerán. Vemos esto con otros virus, como la influenza. La vacuna contra la gripe debe modificarse cada año para contrarrestar los cambios en las cepas circulantes.

Afortunadamente, el nuevo coronavirus tiene una tasa de mutación más baja que la influenza. Y aunque el estudio LSTHM identificó cambios en el gen S (el gen que produce el pico) de las diversas cepas de virus, las mutaciones en este gen fueron comparativamente raras. Las mutaciones en las regiones del epítopo (los sitios en la proteína de pico a los que se adhieren los anticuerpos) también fueron poco frecuentes.

Medicamentos antivirales

Las búsquedas iniciales de un tratamiento eficaz se han centrado en los medicamentos existentes, como visto en informes recientes sobre el éxito de la dexametasona. Si bien este medicamento previene una reacción inmunitaria hiperactiva al virus, otros medicamentos prometedores, como el remdesivir, atacan directamente al virus en sí. Remdesivir se dirige específicamente a la enzima que el virus necesita para replicarse.

Estudios anteriores encontraron dos mutaciones en el gen de la enzima que confieren resistencia al remdesivir, pero el estudio LSHTM no encontró muchos casos de estas mutaciones. Sin embargo, el uso generalizado del fármaco ejercerá una presión selectiva sobre el virus (factores ambientales que contribuyen al cambio evolutivo), por lo que será importante controlar estas mutaciones.

Exámenes

Para diagnosticar una infección actual, las pruebas de diagnóstico buscan ciertos genes del virus. La precisión de estas pruebas depende de que las áreas objetivo del genoma sean las esperadas.

El primer método de diagnóstico publicado, lanzado poco después de que se secuenciara el primer genoma viral, evaluó más de un gen viral que se consideraba «bien conservado» en las cepas virales. (Los genes bien conservados son importantes para que el virus funcione y, por lo tanto, tienden a no cambiar a medida que el organismo evoluciona). p>

Los autores del estudio LSHTM buscaron variaciones en las regiones del genoma examinadas en las pruebas de diagnóstico comunes y encontraron varias mutaciones que podrían resultar en «falsos negativos», donde una persona tiene la enfermedad pero la prueba dice que no ‘t. Estas mutaciones tenían una fuerte distribución geográfica, por lo que los científicos clínicos deben conocer las cepas que circulan localmente al considerar qué pruebas utilizar.

Del mismo modo, una vez que se relajen las restricciones a los viajes internacionales, los científicos deberán tener cuidado con los posibles falsos negativos entre los casos importados de la enfermedad.

¿Más o menos letales?

Algunos virus que cruzan la barrera de las especies hacia los humanos están mal equipados para replicarse en su huésped humano y no logran mantener una presencia en la población humana. Sin embargo, el coronavirus ya ha logrado una transmisión sostenida de persona a persona, pero ¿se mantendrá esta presencia? Y si es así, ¿evolucionará el virus para volverse más o menos letal?

Al igual que las mutaciones en cualquier organismo, para que prevalezca una mutación viral, debe proporcionar una ventaja evolutiva. No hay ventaja evolutiva para un virus si mata a su huésped, particularmente si mata al huésped antes de transmitirlo a uno nuevo. Pero provocar síntomas en la persona infectada, como tos y estornudos, puede ayudar a que el virus se transmita a un nuevo huésped y esto ofrece una ventaja evolutiva.

Para identificar qué mutaciones pueden ayudar al virus a sobrevivir, los autores del estudio LSHTM se propusieron identificar «mutaciones convergentes» mutaciones que ocurrieron en diferentes partes del mundo y en una tasa superior a la aleatoria, lo que sugiere que estas mutaciones benefician la supervivencia del virus.

Aunque los científicos han analizado muchos genomas, el estudio de la relación genoma-enfermedad aún es un trabajo en progreso. Desafortunadamente, existe un sesgo en la base de datos de secuencias del genoma porque es más probable que se secuencien las muestras de pacientes con síntomas más graves, lo que dificulta asociar mutaciones particulares con la gravedad de la enfermedad.

Por supuesto, los resultados de la enfermedad también se ven afectados por otros factores, como la edad o la enfermedad del huésped. También se debe considerar el efecto de las intervenciones. Hasta que se disponga de un gran conjunto de datos del genoma de pacientes leves o asintomáticos de una población diversa, será difícil deducir cómo las mutaciones convergentes identificadas se traducen en la gravedad de la enfermedad.

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Las mutaciones del SARS-CoV-2 no parecen aumentar la transmisibilidad Proporcionado por The Conversation

Este artículo se vuelve a publicar de The Conversation bajo una licencia Creative Commons. Lea el artículo original.

Cita: Coronavirus mutante: lo que significa para todos nosotros (23 de junio de 2020) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-06-mutating- coronavirus.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.