La secuenciación del genoma completo mejora el diagnóstico de enfermedades raras y acorta los viajes de diagnóstico para los pacientes
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Un primer estudio científico mundial, publicado en el New England Journal of Medicine, ha demostrado que la secuenciación del genoma completo ( WGS) puede descubrir nuevos diagnósticos para personas en la gama más amplia de enfermedades raras investigadas hasta la fecha y podría generar enormes beneficios en todo el NHS.
El estudio piloto de enfermedades raras no diagnosticadas involucró el análisis de los genes de 4660 personas de 2183 familias, todas las cuales fueron los primeros participantes en el Proyecto 100 000 Genomas. El proyecto innovador, dirigido por Genomics England y NHS England, se estableció en 2013 para secuenciar 100 000 genomas completos de pacientes del NHS y sus familias.
El estudio piloto, dirigido por Genomics England y la Universidad Queen Mary de Londres y realizado en asociación con el Instituto Nacional de Investigación en Salud (NIHR) BioResource, descubrió que el uso de WGS condujo a un nuevo diagnóstico para el 25% de los participantes. De estos nuevos diagnósticos, el 14 % se encontró en regiones del genoma que otros métodos convencionales no detectarían, incluidos otros tipos de pruebas genómicas no completas.
Muchos de los participantes habían pasado por años de citas , sin obtener ninguna respuesta. Al secuenciar todo su genoma, se descubrieron diagnósticos que antes no habrían sido detectables. El estudio piloto muestra que WGS puede asegurar de manera efectiva un diagnóstico para los pacientes, ahorrar recursos vitales del NHS y allanar el camino para otras intervenciones.
Los participantes que recibieron un diagnóstico a través del piloto incluyen:
- una niña de 10 años cuya búsqueda previa de siete años para un diagnóstico tuvo múltiples admisiones en cuidados intensivos durante 307 visitas al hospital a un costo de 356,571. El diagnóstico genómico le permitió recibir un trasplante curativo de médula ósea (con un coste de 70.000). Además, las pruebas predictivas de sus hermanos mostraron que no había más miembros de la familia en riesgo.
- un hombre de unos 60 años que había soportado años de tratamiento por una enfermedad renal grave, incluidos dos trasplantes de riñón. Sabiendo que su hija había heredado la misma afección, un diagnóstico genómico realizado al observar el genoma completo para él y su hija permitió que se hiciera la prueba a su nieta de 15 años. Esto reveló que no había heredado la enfermedad y que podía suspender los costosos chequeos periódicos.
- Un bebé que se enfermó gravemente inmediatamente después del nacimiento y lamentablemente murió a los cuatro meses, pero sin diagnóstico y con costos de atención médica de 80 000. El análisis de todo su genoma descubrió un trastorno metabólico grave debido a la incapacidad de tomar vitamina B12 dentro de las células, lo que explica su enfermedad. Esto permitió ofrecer una prueba predictiva a su hermano menor dentro de la semana de su nacimiento. Al niño más pequeño se le diagnosticó el mismo trastorno, pero pudo ser tratado con inyecciones semanales de vitamina B12 para prevenir el avance de la enfermedad.
Para alrededor de una cuarta parte de los participantes del estudio, su diagnóstico significaba que pudieron recibir atención clínica más enfocada. Esto incluyó más exámenes de detección familiares, cambios en la dieta, provisión de vitaminas y/o minerales y otras terapias.
El estudio es el primero en analizar el diagnóstico y el impacto clínico de WGS para una amplia gama de enfermedades raras dentro de un sistema nacional de salud. Los hallazgos respaldan su adopción generalizada en los sistemas de salud de todo el mundo.
El alto rendimiento de WGS para condiciones específicas observadas en el estudio piloto, que incluye discapacidad intelectual, trastornos de la vista y auditivos, con un rendimiento diagnóstico del 40-55 %, ha respaldado el caso de la inclusión de WGS para diagnosticar enfermedades raras específicas como parte del nuevo Directorio Nacional de Pruebas Genómicas del NHS.
El estudio piloto también se llevó a cabo en asociación con el Instituto Nacional para la Investigación en Salud (NIHR) e Illumina, quienes se encargaron de la secuenciación , y fue financiado por NIHR, Wellcome Trust, Medical Research Council, Cancer Research UK, el Departamento de Salud y Atención Social y NHS England.
Profesor Sir Mark Caulfield (autor principal) de La Universidad Queen Mary de Londres, y excientífica jefe de Genomics England, dijo: «Esperamos que este importante avance permita a los pacientes de enfermedades raras en todo el mundo comenzar a recibir la secuenciación del genoma completo de diagnóstico cuando corresponda. Nuestra aleta Los resultados muestran que la implementación de esta prueba genómica integral y eficiente ante los primeros signos de síntomas puede mejorar las tasas de diagnóstico. Este estudio allanó el camino para la implementación clínica de la secuenciación del genoma completo como parte del Servicio de Medicina Genómica del NHS».
El profesor Damian Smedley (autor principal) de la Universidad Queen Mary de Londres, dijo: «Este es el Es la primera vez que la secuenciación del genoma completo se integra directamente en el diagnóstico de enfermedades raras en un sistema de salud como el NHS y se aplica a escala en toda la gama de enfermedades raras. Nuestro novedoso software, junto con la recopilación de datos clínicos detallados, fue clave para que pudiéramos resolver el desafío de «una aguja en un pajar» de encontrar la causa de la condición de un paciente con una enfermedad rara entre los millones de variantes en cada genoma. Una gran proporción de los diagnósticos que descubrimos se encontraron fuera de la región de codificación y no habrían sido detectados por los enfoques existentes. Este estudio aboga por que los sistemas de atención médica de todo el mundo adopten la secuenciación del genoma completo como la prueba genética de elección para los pacientes con enfermedades raras».
Jillian Hastings Ward, presidenta del panel de participantes de Genomics England, dijo: «La gente que se inscribieron para la secuenciación del genoma completo en este estudio piloto esperaban encontrar nuevos diagnósticos para sus seres queridos y estaban dispuestos a compartir sus valiosos datos con Genomics England para que las enfermedades raras pudieran entenderse mejor. El piloto ha ayudado en ambos frentes y estamos encantados de que, como resultado, el NHS ahora ofrezca la secuenciación del genoma completo a más familias en Inglaterra. Este es el comienzo de un gran salto adelante y necesita que las familias, los médicos y los investigadores sigan trabajando juntos para desarrollar todo su potencial».
Dr. Richard Scott, director médico de Genomics England, dijo: «Históricamente, el diagnóstico de enfermedades raras a menudo ha dependido de que los médicos realicen múltiples pruebas específicas diferentes, un enfoque que puede retrasar el diagnóstico y el acceso a una atención más personalizada. El conocimiento mejorado de la genómica y la secuenciación del genoma completo y la infraestructura de datos en la que el gobierno y el NHS han invertido ahora nos ofrece la capacidad de transformar radicalmente el proceso. Este documento proporciona evidencia de esa transformación y dónde tiene mayor impacto. Estamos orgullosos en Genomics England de trabajar en asociación con el NHS para llevar los beneficios de la secuenciación del genoma completo a los pacientes».
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La secuenciación del genoma completo aumenta el diagnóstico de trastornos raros en casi un tercio, estudio encuentra Más información: 100,000 Genomes Pilot on Rare-Disease Diagnosis in Health Care Informe preliminar, New England Journal of Medicine (2021). Información de la revista: New England Journal of Medicine
Proporcionado por Queen Mary, Universidad de Londres Cita: La secuenciación del genoma completo mejora el diagnóstico de enfermedades raras y acorta los procesos de diagnóstico de los pacientes (10 de noviembre de 2021) consultado el 29 de agosto de 2022 en https://medicalxpress. com/news/2021-11-genome-sequencing-diagnosis-rare-diseases.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Además de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido está previsto en únicamente con fines de formación.