Crean nuevo método para identificar genes detrás de tumores cerebrales
Cómo identificar genes que pueden impulsar el desarrollo de tumores cerebrales. Crédito: L. Gaffney
Investigadores de la Universidad de Uppsala han desarrollado un método para identificar mutaciones funcionales y su efecto en genes relevantes para el desarrollo del glioblastoma, un tumor cerebral maligno con muy mal pronóstico. El estudio se publica en Genome Biology.
El genoma humano consta de casi 22.000 genes. Muchos estudios han explorado el casi dos por ciento de nuestro ADN que produce proteínas. Se sabe considerablemente menos sobre el 98 por ciento que no codifica proteínas. Sin embargo, estas regiones no codificantes contienen información importante y regulan si un gen está activo en diferentes tejidos, en diferentes etapas de desarrollo y en enfermedades como el cáncer.
El cáncer es causado por mutaciones que conducen a células descontroladas. división. Uno de los tipos de cáncer más agresivos es el glioblastoma, una forma de tumor cerebral con muy mal pronóstico. Se sabe relativamente poco acerca de cómo las mutaciones en las regiones no codificantes impulsan el glioblastoma. Para abordar esta brecha de conocimiento, los investigadores de la Universidad de Uppsala realizaron la secuenciación del ADN del genoma completo en tejidos tumorales de pacientes con glioblastoma y analizaron las mutaciones identificadas.
«Una de nuestras tareas clave fue identificar mutaciones funcionales asociadas con elementos reguladores y relevancia potencial para el desarrollo de células cancerosas, y para distinguirlas de todas las variaciones aleatorias sin importancia presunta», dice la profesora Karin Forsberg-Nilsson del Departamento de Inmunología, Genética y Patología de la Universidad de Uppsala.
Los investigadores asumieron que las secuencias de ADN que se han mantenido sin cambios en los mamíferos a lo largo de la evolución probablemente tengan funciones importantes. Por lo tanto, cruzaron las miles de mutaciones que habían encontrado con información sobre la conservación evolutiva de las regiones genéticas donde se encuentran las mutaciones.
«Elegimos centrarnos en un subconjunto de mutaciones en las regiones genéticas mejor conservadas que es probable que afecten la regulación génica», dice la profesora Kerstin-Lindblad-Toh del Departamento de Bioquímica Médica y Microbiología de la Universidad de Uppsala, así como del Instituto Broad (EE. UU.).
Los investigadores validaron sus resultados usando el gen SEMA3C, en parte porque encontraron una gran cantidad de mutaciones en regiones reguladoras no codificantes cerca de este gen y en parte porque hallazgos previos, realizados por otros, sugieren que SEMA3C está relacionado con un mal pronóstico del cáncer.
«Nosotros Estudió cómo las mutaciones en las regiones no codificantes afectan la función y la actividad de SEMA3C.Nuestros resultados muestran que una mutación específica, conservada evolutivamente, en las cercanías de SEMA3C interrumpe la unión de ciertas proteínas cuya tarea es unir genes y regular e su actividad», dice Forsberg-Nilsson.
El estudio también identifica más de otros 200 genes enriquecidos para mutaciones no codificantes en las regiones involucradas. Es probable que estos tengan un potencial regulador, lo que aumenta aún más la cantidad de genes que son relevantes para el desarrollo de tumores cerebrales.
«Nuestros resultados confirman la importancia de la asociación entre alteraciones genéticas en regiones no codificantes, su biología función y patología de la enfermedad», concluye Forsberg-Nilsson.
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Nuevas mutaciones impulsoras de tumores descubiertas en las regiones poco exploradas del genoma del cáncer Más información: Sharadha Sakthikumar et al, La secuenciación del genoma completo del glioblastoma revela el enriquecimiento de células no -mutaciones de restricción de codificación en genes conocidos y nuevos, Genome Biology (2020). DOI: 10.1186/s13059-020-02035-x Información de la revista: Genome Biology
Proporcionado por la Universidad de Uppsala Cita: Nuevo método creado para identificar genes detrás de tumores cerebrales ( 2020, 9 de junio) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-06-method-genes-brain-tumors.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.