Pequeño estudio demuestra que la inactivación de muestras puede conducir a falsos negativos de SARS-CoV-2
Crédito: CC0 Public Domain
Para proteger al personal de laboratorio médico de infecciones cuando se analizan muestras clínicas para SARS-CoV-2, la mayoría de los laboratorios inactivan el virus antes pruebas. No se ha determinado el efecto de la inactivación en la detección de resultados, pero se ha estimado que la tasa de falsos negativos para una prueba única de virus inactivado oscila entre el 30 % y el 50 %.
Un equipo de investigadores dirigido por Chaofeng Ma del Centro para el Control y la Prevención de Enfermedades de Xi’an planteó la hipótesis de que la inactivación viral puede contribuir a los falsos negativos. Ahora han probado varias metodologías de inactivación para determinar si reducen el virus detectable en una muestra clínica y en qué medida. La investigación aparece en el Journal of Clinical Microbiology, una publicación de la Sociedad Estadounidense de Microbiología.
Los investigadores tomaron muestras clínicas de 63 pacientes que habían sido infectados con SARS-CoV-2. Primero usaron una tecnología llamada PCR digital para determinar la cantidad total de partículas de virus en cada muestra.
Luego inactivaron el virus de las muestras y determinaron cuánto menos virus era detectable en 2 sitios dentro del genoma, un gen que codifica la proteína «nucleocápside» y una sección del genoma llamada ORF 1ab.
El primer tratamiento de inactivación utilizó un reactivo llamado TRIzol y destruyó el 47,54 % de los genes de la nucleocápside y casi el 40 % del ORF 1ab.
El segundo tratamiento de inactivación calentó las muestras a 56 °C durante 30 minutos y redujo las cantidades de las dos secciones del genoma en un 48,55 % y un 56,40 %, respectivamente. Calentar a 80 °C durante 20 minutos redujo aún más el número de copias virales, y hervir o esterilizar en autoclave a 121 °C prácticamente no dejó virus detectables.
Los estudios futuros deberían incluir reactivos de inactivación además de TRIzol, escribieron los investigadores. Pero por ahora, «… se recomienda TRIzol para la inactivación de muestras… ya que TRIzol tiene el menor efecto sobre el número de copias de ARN entre los métodos probados».
Explore más
Siga las últimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) Más información: Hailong Chen et al, Influence of Different Inactivation Methods on Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 RNA Número de copia, Journal of Clinical Microbiology (2020). DOI: 10.1128/JCM.00958-20 Información de la revista: Journal of Clinical Microbiology
Proporcionado por la Sociedad Estadounidense de Microbiología Cita: Un pequeño estudio demuestra que la inactivación de la muestra puede provocar Falsos negativos de SARS-CoV-2 (2 de junio de 2020) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-06-small-sample-inactivation-sars-cov-false.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.