Método de mapeo espacial identifica posibles nuevos objetivos terapéuticos en el lupus
Crédito: CC0 Public Domain
Un equipo de investigadores del Children’s Hospital of Philadelphia (CHOP) usó un nuevo método para identificar posibles cambios en el genoma que causan enfermedades para identificar dos nuevos objetivos terapéuticos potenciales para el lupus, al tiempo que allana el camino para identificar con mayor precisión las variaciones que causan enfermedades en otros trastornos autoinmunes. Los hallazgos fueron publicados en línea en Nature Communications.
Los estudios de asociación del genoma completo (GWAS) aprovechan las variaciones en el genoma, el conjunto completo de genes de una persona y el ADN asociado, para obtener más información sobre las enfermedades y los rasgos hereditarios. Estos estudios generalmente identifican grupos de cientos de polimorfismos de un solo nucleótido, o variantes, que podrían causar una enfermedad en particular, pero los estudios en sí mismos no pueden identificar cuáles son los responsables. Esto se debe a que la gran mayoría de las variantes no se encuentran en los genes mismos, sino en el ADN intermedio, y GWAS no resuelve necesariamente qué genes se ven afectados por los polimorfismos asociados a la enfermedad.
El lupus eritematoso sistémico es una enfermedad autoinmune Trastorno sin cura conocida que afecta tanto a niños como a adultos, con mayor prevalencia entre las minorías raciales. Si bien varios estudios sobre el lupus se han centrado en las células T auxiliares ingenuas y otras células sanguíneas, este estudio se diseñó para centrarse en las células T auxiliares foliculares, que desempeñan un papel más central en las respuestas inmunitarias relacionadas con el lupus. En lugar de utilizar un enfoque GWAS típico, los investigadores se propusieron crear mapas tridimensionales que coincidieran con las variantes de los genes que probablemente regulan. Su enfoque utilizó variantes como «señales» para identificar potenciadores genéticos potenciales en tejido normal.
«Antes de este estudio, no se habían generado mapas genómicos estructurales en 3D para este tipo de célula relevante para el lupus». dijo Andrew D. Wells, Ph.D., codirector del Centro de Genómica Espacial y Funcional de CHOP, y coautor principal del estudio junto con Struan FA Grant, Ph.D. «Con nuestro enfoque, creemos que estábamos en condiciones de identificar genes y vías que no tenían una función conocida anterior en el lupus».
Con este método, el equipo de estudio identificó 393 variantes en la proximidad de los genes en 3 -D, y por tanto potencialmente implicados en su regulación. Aproximadamente el 90% de esas variantes se habrían considerado distantes de su gen en una dimensión, pero en realidad estaban cerca en el mapa tridimensional adecuado creado por el equipo. Los investigadores pudieron identificar dos quinasas, HIPK1 y MINK1, que no tenían un papel conocido previamente en el lupus. Cuando estas enzimas se dirigen a las células T auxiliares foliculares, inhiben la producción de interleucina-21, una citocina involucrada en la regulación de la producción de anticuerpos.
«Creemos que HIPK1 y MINK1 pueden servir como objetivos terapéuticos valiosos para el lupus , una enfermedad que necesita urgentemente nuevas opciones de tratamiento», aseguró Wells. «También queremos tomar los métodos que usamos en este estudio y aplicarlos a otras enfermedades autoinmunes y ayudar a identificar más variaciones causales que de otro modo podrían haber permanecido ocultas solo por GWAS».
Wells también dijo que su equipo espera desarrollar modelos de ratones transgénicos HIPK1 para estudiar su susceptibilidad al lupus experimental, así como el impacto potencial de HIPK1 en la inmunidad antiviral.
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Un descubrimiento genético innovador muestra por qué se desarrolla el lupus Más información: Chun Su et al, Mapeo de genes efectores en los loci GWAS del lupus usando el promotor Capture-C en células T colaboradoras foliculares, Nature Comunicaciones (2020). DOI: 10.1038/s41467-020-17089-5 Información de la revista: Nature Communications
Proporcionado por Children’s Hospital of Philadelphia Cita: El método de mapeo espacial identifica nuevos objetivos terapéuticos potenciales in lupus (2020, 8 de julio) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-07-spatial-method-potential-therapeutic-lupus.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.