Un Chia-PET diferente proporciona información sobre el cáncer de próstata
Este gráfico ilustra mapas tridimensionales de la organización del genoma obtenidos de una línea celular de cáncer metastásico representativa. Crédito: UT Southwestern Medical Center
Investigadores de UT Southwestern han identificado vastas redes de pequeños fragmentos del genoma que interactúan entre sí y con genes para promover el cáncer de próstata. Sus hallazgos, publicados el 22 de junio en Journal of Clinical Investigation, podrían conducir a nuevas formas de tratar el tipo de malignidad más común en los hombres estadounidenses además del cáncer de piel.
La investigación de las últimas décadas ha demostrado que las mutaciones genéticas desencadenan y fomentan el crecimiento y la propagación de muchos tipos de cáncer. Sin embargo, los cánceres de próstata suelen tener relativamente pocas de estas mutaciones, explica el líder del estudio Ram S. Mani, Ph.D., profesor asistente en los departamentos de patología y urología de la UTSW.
En cambio, cómo los cánceres de próstata regular la expresión génica, qué genes se activan y desactivan, y en qué medida tienden a salir mal. La causa de esta regulación genética aberrante ha sido un misterio. Aunque investigaciones anteriores habían identificado piezas de ADN en todo el genoma que parecían estar conectadas con el cáncer de próstata, muchas de estas piezas no eran genes, por lo que su función no estaba clara.
Para ayudar a responder estas preguntas, Mani y sus colegas se centraron en los potenciadores genéticos, piezas cortas de ADN que ayudan a alentar a los genes a producir proteínas. Sin embargo, explica Mani, no es tan simple como una proporción uno a uno de potenciador por gen objetivo. Un potenciador puede dirigirse a varios genes, o múltiples potenciadores pueden dirigirse a un solo gen. Además, cada potenciador podría tener hasta un millón de pares de bases de distancia de su gen objetivo en el mismo cromosoma, una distancia significativa que dificulta la vinculación de los potenciadores con sus genes.
Para emparejar potenciadores con sus genes objetivo en la próstata cáncer, Mani y su equipo utilizaron una técnica llamada ChIA-PET, abreviatura de análisis de interacción de cromatina mediante secuenciación de etiquetas de extremos emparejados. Esta técnica mapea asociaciones de proteínas particulares con ADN en todo el genoma.
Los investigadores usaron ChIA-PET para encontrar ADN objetivo de una proteína llamada ARN polimerasa II, buscando diferencias entre las células benignas de próstata y las células cancerosas de próstata. La ARN polimerasa II no solo se une a los genes para iniciar la transcripción, el proceso en el que las células usan las instrucciones del ADN para producir ARN, sino también potenciadores de estos genes. «Cuando esta técnica identifica un gen, también identifica todos los potenciadores que se dirigen a ese gen al mismo tiempo», dice Mani, miembro del Harold C. Simmons Comprehensive Cancer Center de UT Southwestern.
Usando análisis sofisticados Con estas técnicas, los científicos clasificaron cada una de estas complicadas interacciones exclusivas de las células de cáncer de próstata, encontrando vastos centros de potenciadores que interactúan no solo con los genes sino también entre sí. Descubrieron que muchos potenciadores interactuaban con decenas de otros potenciadores o genes. Estas interacciones explican la expresión anormal de varios genes clave del cáncer de próstata, como el gen del receptor de andrógenos que se sobreexpresa en muchos subtipos de cáncer de próstata y el oncogén MYC, que desempeña un papel en muchos tipos de cáncer. Investigaciones posteriores identificaron algunas «reglas gramaticales» para los potenciadores en el cáncer de próstata, agrupando genes y potenciadores en grupos que interactúan estrictamente entre sí.
Mani señala que encontrar estos centros de potenciadores y sus genes también ayuda a explicar el largo -el misterio permanente de las piezas cortas de ADN conectadas con el cáncer de próstata que se encuentran dispersas por todo el genoma. Esta nueva investigación sugiere que muchas de estas piezas son potenciadores.
La manipulación de la interacción entre estos potenciadores y sus objetivos genéticos podría eventualmente usarse como una estrategia para retrasar o detener la propagación del cáncer de próstata o potencialmente prevenir que se desarrolle en todo, añade. «Estos hallazgos abren un campo completamente nuevo centrado en los potenciadores», dice, «que podría conducir a nuevos tratamientos para el cáncer de próstata».
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La primera hoja de ruta de los superpotenciadores del cáncer de estómago allana el camino para nuevos tratamientos Más información: Susmita G. Ramanand et al. El panorama de las interacciones de cromatina asociadas a la ARN polimerasa II en el cáncer de próstata, Journal of Clinical Investigation (2020). DOI: 10.1172/JCI134260 Información de la revista: Journal of Clinical Investigation
Proporcionado por UT Southwestern Medical Center Cita: Un Chia-PET diferente proporciona información sobre el cáncer de próstata (2020 , 6 de julio) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-07-chia-pet-insight-prostate-cancer.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.