Top 7 en genómica y genética

Las proteínas y los orgánulos marcados con MiniSOG exhiben una localización correcta a nivel microscópico de luz. CORTESÍA DE ROGER TSIEN Y PLOS BIOLOGÍA

1. Una etiqueta genética brillante Una nueva proteína fluorescente codificada genéticamente creada en el laboratorio de Roger Tsien, quien compartió un Premio Nobel por desarrollar la proteína fluorescente verde (GFP), está a punto de revolucionar la microscopía electrónica. Diseñado a partir de una proteína de Arabidopsis, "miniSOG" (para mini generador de oxígeno singlete) tiene menos de la mitad del tamaño de GFP, se une a un conjunto de proteínas bien caracterizadas y puede marcar fielmente una variedad de células de mamíferos, así como células en roedores y nematodos intactos.

X. Shu, et al., "Una etiqueta codificada genéticamente para microscopía de luz y electrónica correlacionada de células, tejidos y organismos intactos" PLoS Biology, 9:e1001041, 2011.

2. Veo, veo

Investigadores que prueban la capacidad de ingeniería E. coli para estabilizar proteínas inestables in vivo, tropezó con una nueva proteína chaperona, llamada Spy, que suprime la proteína…

S. Quan, et al., «La selección genética diseñada para estabilizar las proteínas descubre una chaperona llamada Spy», Nat Struct Mol Biol, 18:262-69, 2011.

3. La expresión génica se vuelve global

Usando una técnica llamada etiquetado de pulsos metabólicos paralelos, los investigadores midieron la abundancia y el recambio de ARNm y proteínas para más de 5000 genes de mamíferos, generando así las primeras predicciones de ARNm a escala genómica. y tasas de síntesis de proteínas. Los resultados sugieren que la abundancia de proteínas en una célula se controla principalmente a nivel de traducción.

B. Schwanhusser, et al., «Cuantificación global de genes de mamíferos control de expresión,» Nature, 17:708-14, 2011.

4. Get Smad, get even

Las proteínas Smad, que regulan la transcripción de genes específicos y desempeñan un papel en la inducción postranscripcional de un conjunto de microARN, realizan sus funciones de formas misteriosas. Pero ahora, los investigadores han descubierto un mecanismo molecular de cómo regulan los microARN específicos al unirse a una secuencia de consenso compartida por muchos de los ARN involucrados.

BN Davis, et al ., «Las proteínas Smad se unen a una secuencia de ARN conservada para promover la maduración de microARN por Drosha», Mol Cell, 39:373-84, 2011.

5. El baile de los fijadores de ADN

Por primera vez se ha descubierto la estructura cristalina de un complejo de proteínas formado por Mre11 y Rad50, implicadas en la detección y reparación de roturas de doble cadena del ADN. revelado.

HS Lim, et al., «Estructura cristalina del complejo Mre11-Rad50-ATPgammaS: comprender la interacción entre Mre11 y Rad50», Genes Dev, 25:1091-04, 2011.

6. Cromatina, respuesta al daño del ADN y muerte celular

Cuando se activan los oncogenes, las células responden aumentando su respuesta al daño del ADN (DDR) y entrando en un estado de senescencia, muy probablemente como una forma de supresión tumoral. Pero a medida que se llenan de heterocromatina, que se acumula con el estrés replicativo, apagan la DDR para mantenerse viables. Los investigadores han descubierto que la vía de la quinasa ATR (ataxia telangiectasia y relacionada con Rad3), que media en la producción de heterocromatina, es clave para este cambio, un conocimiento que podría usarse para tratar algunos tipos de cáncer.

R. Di Micco, et al., «Interacción entre la respuesta al daño del ADN inducida por oncogenes y la heterocromatina en la senescencia y el cáncer», Nat Cell Biol, 13:292 -302, 2011.

7. ¿Fuente molecular de la juventud?

Las células de la mayoría de los organismos complejos tienen la capacidad de restablecer esencialmente su edad, al dividirse en gametos que se combinarán para formar un nuevo organismo. Ahora, los investigadores han identificado al menos uno de los componentes moleculares, el gen NDT80 de la levadura, que lo hace posible. La expresión transitoria de NDT80 en células de levadura que no estaban experimentando gametogénesis también podría restablecer su vida útil.

E. Unal, et al ., «La gametogénesis elimina el daño celular inducido por la edad y restablece la vida útil en la levadura», Science, 332:1554-7, 2011

El F1000 Top 7 es una instantánea de la artículos mejor calificados de un período de 30 días en la Facultad de 1000 en genómica, genética y áreas relacionadas, calculado el 15 de julio de 2011. Los miembros de la facultad evalúan y califican los artículos más importantes en su campo. Para ver las clasificaciones más recientes, buscar en la base de datos y leer las evaluaciones diarias, visite http://f1000.com.

Corrección (20 de julio): la versión original de esta lista afirmaba incorrectamente que el Schwanhusser et al. El estudio (# 3) sugirió que la abundancia de proteínas se controló a nivel transcripcional. esto debería haber dicho «nivel de traducción». El error ha sido corregido y The Scientist lamenta el error.

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