Opinión: de los datos al conocimiento y a la acción
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¿Pizza el martes a menos de 2 millas de su casa? Hay una búsqueda para eso. ¿Encontrar un amigo de la escuela secundaria perdido hace mucho tiempo o un libro agotado? Hay búsquedas para eso. ¿Correlacionar la información genómica con los datos proteómicos, la información del paciente y los resultados de los ensayos de fármacos? Estás solo. Es irónico y lamentable que las consultas en Internet puedan brindarle información sobre tantas cosas, pero los datos científicos que son cruciales para encontrar curas para numerosas enfermedades a menudo están enterrados en un formato inutilizable en un disco duro en el garaje de alguien.
Líderes en ciencia, tecnología, financiamiento, políticas y medios se reunirán el 3 y 4 de mayo en Washington, DC, para discutir los esfuerzos continuos de DELSA Global (Data-Enabled Life Sciences Alliance International) , cuyo objetivo es acelerar y profundizar la innovación colectiva y comunitaria en las ciencias de la vida. La investigación en ciencias de la vida requiere trabajo en diversos dominios. Este…
DELSA Global tiene como objetivo ensamblar un ecosistema abierto, sólido, colaborativo, solidario y sostenible para permitir una mayor utilización de los recursos existentes. A menudo, por ejemplo, puede que no sea posible hacer una referencia cruzada de conjuntos de datos cruciales debido a identificadores que no coinciden, formatos incompatibles o falta de tecnología capaz de manejar la carga de trabajo. Estas barreras pueden impedir el descubrimiento de conexiones clave entre experimentos que, por sí solos, no eran notables, pero que en conjunto pueden respaldar los conocimientos clave de la investigación. Se necesita un patrimonio común digital para facilitar el acceso a los datos y al conocimiento. Dicho sistema servirá para conectar a los científicos y el conocimiento científico mundial y tiene un potencial inmenso para los beneficios de la investigación no realizados. En lugar de verse frustradas por la falta de recursos, las nuevas ideas se expandirán fácilmente o se descartarán rápidamente para dar cabida a otros enfoques. En consecuencia, la progresión de los datos al conocimiento y a la acción se acelerará enormemente, impactando a cada científico, estudiante y ciudadano.
En mayo de 2011, la necesidad de un enfoque transdisciplinario para la investigación en ciencias de la vida condujo a la creación de DELSA Global para construir y promover este ecosistema. DELSA Global propone integrar la experiencia en ciencias de la vida y computación, industria y academia, ciberinfraestructura y análisis, y políticas y medios. El Proyecto Genoma Humano fue un ejemplo pionero de un enfoque transdisciplinario en las ciencias de la vida, pero fue solo el comienzo de la mentalidad totalmente integradora necesaria para abordar con éxito los problemas científicos del siglo XXI, que son más complejos y diversos que nunca. La experiencia debe provenir de todos los ámbitos de la vida y los límites de las disciplinas deben desdibujarse.
DELSA Global no comienza en el vacío: actualmente se están llevando a cabo múltiples iniciativas transdisciplinarias. Estos incluyen, por ejemplo, los Institutos CTSA de los Institutos Nacionales de Salud y el Consorcio de Biología de Células Beta, el Programa CIF’21 de la Fundación Nacional de Ciencias y Avances en Informática Biológica, y los Centros de Investigación y Base de Conocimiento de Bioenergía del Departamento de Energía, por nombrar algunos. Pero estas son la excepción y no la regla en las ciencias de la vida, que aún permanece en gran medida segmentada.
El objetivo de DELSA Global es conectar a líderes, partes interesadas y científicos de todo el mundo. mundo y en todas las disciplinas para asumir grandes desafíos en ciencia, educación, medio ambiente, energía, ecología, alimentación, seguridad y atención médica.
Este marco incluirá el desarrollo de un patrimonio digital común para compartir conocimientos científicos, identificar y utilizar iniciativas de agencias de financiación, fundaciones e industria, y permitir la innovación colectiva sostenible. Además, DELSA Global ha respondido a las solicitudes recientes de toda la comunidad de comentarios e información de agencias como la Junta Nacional de Ciencias y los NIH sobre las necesidades de las ciencias de la vida basadas en datos. Estos incluyen, por ejemplo, un acceso más amplio a datos y recursos de análisis, inclusión de experiencia diversa para transformar datos en acción y créditos adecuados para compartir datos, uso de software y participación en grandes proyectos de colaboración.
El próximo mes en su taller anual en Washington, DC, DELSA Global continuará con estos esfuerzos identificando hasta 10 proyectos a corto plazo (1-2 años), llamados Proyectos TOP. Estos proyectos abordarán diversos desafíos de la sociedad global, incluirán investigadores y expertos de múltiples disciplinas, y contarán con el apoyo de DELSA Global a través de conexiones colaborativas y asistencia para identificar fuentes de financiamiento.  ; La ciencia exitosa no se trata solo de lo que sucede en el laboratorio y el campo; también se basa (por nombrar algunos) en la perspicacia comercial, la infraestructura cibernética y los enfoques de traducción para hacer la transición de un descubrimiento del laboratorio a los productos. DELSA Global ayudará a sus líderes de proyecto elegidos a través de este proceso asociándolos con ejecutivos residentes experimentados que aplican la experiencia de la vida real a todas las facetas de la gestión, ejecución y entrega de proyectos. Anualmente, DELSA formulará un nuevo conjunto de Proyectos TOP y evaluará los Proyectos TOP actuales para refinar aún más el enfoque transdisciplinario e identificar métodos mejorados para el acceso y análisis de recursos.
Por supuesto, no será fácil DELSA Global ha identificado una serie de desafíos que deben abordarse. A medida que crece la necesidad de equipos transdisciplinarios, se ha vuelto obvio que los aspectos de educación, financiación y desarrollo profesional de la cultura científica deben adaptarse. Estos requieren un cambio de mentalidad del enfoque de un científico (un laboratorio) y un proyecto que se enseña con tanta frecuencia. También debe trascender el enfoque de un solo instituto (un consorcio), un problema del siglo XX. Pero si tiene éxito, un enfoque de innovación transdisciplinario colectivo debería conducir a recursos confiables y accesibles a nivel mundial, reduciendo así el desperdicio y liberando mentes y recursos para un nuevo ciclo de investigación. Un estudio sugiere que hasta el 85 por ciento de los recursos se desperdician debido a las ineficiencias graduales en el proceso de trasladar los resultados de la investigación a los pacientes y médicos. Como productores y consumidores de datos, podemos hacerlo mejor.
Encontrar pizza es útil si tiene hambre; encontrar una cura es un regalo de la vida si estás sufriendo. ¿Qué encontrará hoy?
Agradecimientos: Agradecemos sinceramente a la Fundación Gordon y Betty Moore por su liderazgo visionario en el apoyo a DELSA Global, así como a Rob Arnold, Peter Arzberger, Christian Burks, Jack Faris, Geoffrey Fox, Evelyne Kolker, Natali Kolker, Maggie Lackey, Courtney MacNealy-Koch, Chris Menztel, Vural Ozdemir, Charles Smith y Peter Tarczy-Hornoch por sus interesantes debates.
Eugene Kolker es cofundador y presidente de DELSA Global, director de datos en Seattle Childrens Hospital y director de Bioinformatics & Laboratorio de análisis de alto rendimiento en el Seattle Childrens Research Institute. Elizabeth Stewart es miembro de DELSA Global y científica sénior en Bioinformatics & Laboratorio de análisis de alto rendimiento en el Seattle Childrens Research Institute. Correspondencia a eugene.kolker@seattlechildrens.org
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