Se cuestiona la transferencia horizontal de genes en rotíferos bdeloideos

Cuatro rotíferos bdeloideos del género AdinetaCG Wilson 2018

En 2016, un estudio sugirió que los rotíferos bdeloideos cultivan diversidad genética al compartir ADN entre ellos mediante transferencia horizontal . Sin embargo, en un trabajo publicado hoy (12 de julio) en Current Biology, , un equipo de investigación independiente identifica una posible contaminación en los datos sin procesar del primer informe, cuestionando sus conclusiones e iluminando la necesidad de una mayor investigación.

“Sabemos que los rotíferos bdeloideos son animales muy extraños, por lo que la historia [de 2016] parecía posible a primera vista” dice Chris Wilson, biólogo evolutivo del Imperial College London y coautor del nuevo artículo. «Hemos sabido durante mucho tiempo, por ejemplo, que tienen una gran cantidad de ADN extraño inesperado en sus células que ha sido robado de cosas como plantas y bacterias, por lo que a muchas personas les parecía natural que podrían estar intercambiando ADN entre sí también».

Bdeloide…

Cualquiera que sea su modo reproductivo, al final no los hace menos interesantes.

Tanja Schwander, Universidad de Lausana

Ciertamente existen animales que se reproducen asexualmente, pero para preservar la diversidad, necesitan alguna forma de intercambiar información genética o corren el riesgo de desaparecer. Una posibilidad que los científicos han analizado es la transferencia horizontal de genes intercambiando ADN entre individuos, en lugar de transmitirlo de padres a hijos.

Si bien los resultados de 2016 parecían plausibles, un par de cosas hicieron que Wilson y sus colegas cuestionaran los hallazgos. . En primer lugar, parecía que los donantes y los destinatarios de las transferencias horizontales propuestas se habían recopilado del mismo parque en Bélgica y se habían secuenciado para el documento de 2016. Wilson dice que es de esperar que algunos de estos animales hayan recogido ADN de otros animales que no fueron recogidos al mismo tiempo. Esta ordenada alineación apuntó a la idea de que lo que los autores del estudio original llaman evidencia de transferencia horizontal en realidad podría representar contaminación entre tubos en el laboratorio en lugar de un intercambio de genes que ocurre en la naturaleza.

También fue una Un poco sorprendente que el ADN de un animal y este otro animal sean idénticos a pesar de que son especies diferentes, dice Wilson. Nos preguntamos por qué nada del ADN había cambiado desde que se intercambió, por qué coincidía exactamente con este otro animal que fue llevado al mismo laboratorio al mismo tiempo.

Para investigar si podría haber Para obtener una explicación más sencilla de los resultados, Wilson y sus colegas se pusieron en contacto con los autores del estudio de 2016 y solicitaron los picos coloreados de los cromatogramas que representan los datos sin procesar generados por la secuenciación de Sanger. Los autores rápidamente compartieron sus cromatogramas, que Wilson y sus colegas analizaron. Se dieron cuenta de que los datos sin procesar tenían ruido, a veces con múltiples picos que representaban más de un nucleótido de ADN en la misma posición en la secuencia, una pista temprana de que podría haber contaminación. Wilson y sus colegas siguieron con una prueba estadística en la que compararon las señales secundarias en los datos con la secuencia de ADN predicha de los otros animales que podrían estar contaminando la muestra y luego calcularon la probabilidad de ver una coincidencia por casualidad. Resultó que las probabilidades eran de menos de 1 billón a uno de que el ruido en los datos sin procesar sería el mismo que el de una secuencia genética de otro rotífero. Su conclusión: debe haber ADN de dos animales en el mismo tubo.

El otro equipo no está del todo de acuerdo, aunque el análisis adicional ha proporcionado nueva información útil. Algo de lo que me di cuenta gracias a este intercambio académico con nuestros colegas de Londres es que la mayoría de la gente asume que estos pequeños picos en la parte inferior de los cromatogramas son solo ruido aleatorio cuando en realidad no lo son, dice Jean-Franois Flot, biólogo evolutivo de la Universit Libre de Bruxelles en Bélgica y coautor del estudio de 2016. No es aleatorio. ¿Es significativo? Esa es una pregunta diferente. No está claro a partir de los datos que muestran que esto realmente afecta nuestro análisis.

Flot y sus colegas han preparado una respuesta al nuevo análisis de sus datos que planean publicar como una preimpresión, en la que dan explicaciones de algunas de las cuestiones planteadas por el equipo de Wilson y discutir interpretaciones alternativas. A largo plazo, este [intercambio] será bueno para la ciencia, dice Flot.

El panorama general es . . . que si los bdelloides están o no intercambiando ADN o su grado de asexualidad sigue siendo una gran pregunta abierta, dice David Mark Welch, biólogo evolutivo del Laboratorio de Biología Marina en Woods Hole, Massachusetts, que no participó en ninguno de los estudios. Él dice que el esfuerzo de investigación de estos dos grupos muestra que incluso para las personas que son buenas y cuidadosas, trabajar con estos pequeños animales es extremadamente difícil.

En términos de lo que realmente ocurre durante la reproducción bdelloidea, ni el original ni esta respuesta demuestran que los bdelloides no se involucran en la transferencia horizontal, agrega Mark Welch. Todos sospechamos que sí, pero lo que [Wilson y sus colegas] señalan es que la evidencia que se presentó en el artículo original se explica más fácilmente y es casi seguro que se deba a la contaminación.

La Tanja Schwander, bióloga evolutiva de la Universidad de Lausana en Suiza, autora de una perspectiva sobre el estudio de 2016 para Current Biology, coincide en que existe alguna forma de intercambio genético. La pregunta realmente es: ¿a qué frecuencia [ocurren] esos intercambios genéticos? ¿Contribuyen realmente a la generación de variación dentro de . . . rotíferos o es algo que realmente ocurre tan raramente que es demasiado raro como para tener un impacto continuo? Cualquiera que sea su modo reproductivo, al final no los hace menos interesantes.

CG Wilson et al., La contaminación cruzada explica las transferencias genéticas horizontales interespecíficas e intraespecíficas entre rotíferos bdeloideos asexuales, Biología actual, doi:10.1016/j.cub.2018.05.070, 2018.

¿Le interesa leer más?

El científico ARCHIVOS

Conviértase en miembro de

Reciba acceso completo a más de 35 años de archivos, así como TS Digest, ediciones digitales de The Scientist, artículos destacados, ¡y mucho más!Únase gratis hoy ¿Ya es miembro?Inicie sesión aquí