Los africanos tienen más ADN neandertal de lo que se pensaba anteriormente
ARRIBA: ISTOCK.COM, OLENA YEPIFANOVA
Los africanos modernos tienen un promedio de 17 megabases de ADN neandertal en sus genomas, según un análisis publicado hoy (30 de enero) en Celular. Si bien eso todavía es un poco menos que las más de 50 megabases de ADN neandertal que se encuentran en los genomas de los euroasiáticos modernos, es más de lo que algunos científicos esperaban y bastante más que el cero asumido por los métodos estadísticos que se han utilizado para identificar la ascendencia neandertal. en los genomas humanos modernos.
Siempre supimos que había algo de ADN neandertal en los africanos, dice Janet Kelso, bióloga computacional del Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva que no participó en el estudio. Lo que sorprende aquí es la cantidad. En realidad, es una proporción mayor de lo que creo que la gente había imaginado.
Tony Capra, un genetista evolutivo de la Universidad de Vanderbilt que tampoco participó en la investigación, está de acuerdo. No hubiera esperado que fuera tanto.
Al encontrar ascendencia neandertal en los africanos, proporcionó información adicional sobre este proceso de cómo las poblaciones se han estado moviendo dentro y fuera de África durante un mucho tiempo.
Joshua Akey, Universidad de Princeton
Se cree que el mestizaje entre los neandertales y los primeros humanos modernos ocurrió en Eurasia, donde los neandertales alguna vez prosperaron, después de que los ancestros de los euroasiáticos modernos se separaran de los antepasados de los africanos modernos hace 50.00080.000 años. Debido a que los ancestros de los africanos modernos no se reprodujeron directamente con los neandertales, los científicos construyeron modelos para identificar el ADN de los neandertales que asumieron que los individuos africanos no tienen ascendencia neandertal. De hecho, usarían los genomas africanos modernos como un nulo para eliminar las variantes que no son de origen neandertal.
Pero hacerlo aparentemente fue una simplificación mayor de lo que pensaban. Los humanos modernos que emigraron de Europa a África trajeron algo de ADN neandertal con ellos, aparentemente una cantidad sustancial, según el nuevo estudio.
Ver infografía: Historia del mestizaje de homínidos antiguos
Para buscar moderno genomas humanos para la ascendencia neandertal sin hacer tal suposición, el biólogo evolutivo de la Universidad de Princeton Joshua Akey y sus colegas desarrollaron una técnica estadística que les permitió renunciar al uso de un genoma de referencia africano. En cambio, se basaron simplemente en comparar los 2504 genomas del Proyecto 1000 Genomas con el genoma neandertal de referencia. El análisis encontró que los individuos africanos tenían un promedio de 17 megabases (Mb) de secuencia de neandertal, aproximadamente un tercio de la cantidad de ADN de neandertal que se encuentra en personas de ascendencia euroasiática.
Los genomas africanos incluso contenían algunos tramos de ADN de neandertal. que no se encontraron en los genomas euroasiáticos, y secuencias neandertales que se encontraron en frecuencias mucho más altas. El nuevo método también reveló variantes que diferían en frecuencia entre las poblaciones europeas y asiáticas. Habrá mucho trabajo interesante que indague en esas secuencias que varían entre las poblaciones modernas, dice Capra.
Ver El ADN neandertal en los genomas humanos modernos no es silencioso
El estudio también sugiere que los asiáticos orientales no tienen mucha más ascendencia neandertal que los europeos. Estimaciones anteriores han encontrado que los asiáticos orientales tienen un 20 por ciento más de ascendencia neandertal que los europeos. Pero debido a que las migraciones de regreso a África procedían principalmente de Europa, los africanos y los europeos comparten más ADN ADN neandertal que se eliminó en análisis anteriores de los genomas europeos modernos como no neandertal. Al no usar el genoma de referencia africano, el grupo de Akeys descubrió que los genomas de Europa y Asia oriental diferían en menos del 8 por ciento en la cantidad de ADN de neandertal, y quizás mucho menos.
Se suma a este buen conjunto de métodos. que han surgido para la detección de ADN de Neanderthal y Denisovan de diferentes maneras en diferentes genomas, y haciendo diferentes suposiciones sobre la historia de la población, dice Kelso.
Se suma a este buen conjunto de métodos que han surgido para detección de ADN de Neanderthal y Denisovan [que hacen] suposiciones diferentes sobre la historia de la población.
Janet Kelso, Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva
Akey y sus colegas han sentado las bases para analizar el ADN de Neanderthal en los genomas africanos modernos, agrega el ex postdoctorado Michael Dannemann de Kelsos, biólogo computacional de la Universidad de Tartu en Estonia que no participó en el nuevo estudio. Han aplicado un método que realmente nos brinda algo que podemos observar y comenzar desde allí.
El grupo de Akeys también identificó otro sesgo potencial en la forma en que los investigadores han interrogado los datos genómicos modernos. Los análisis identificaron secuencias neandertales en genomas humanos modernos comparándolas con el genoma de referencia neandertal. Pero como resultado del cruce con humanos modernos, los neandertales portaron ADN humano moderno en sus genomas. Esto significa que todos los métodos actuales, incluso este nuevo, están sobreestimando la cantidad de ADN neandertal en los genomas humanos modernos en África, Europa y Asia, dice Akey. Estamos encontrando secuencias similares, no debido a la introgresión de los neandertales a los humanos modernos, sino a partir de este antiguo evento de hibridación donde los humanos dieron a los neandertales su ADN.
En muchos sentidos, la forma en que conceptualizamos la historia humana es siempre una especie de simplificación excesiva, dice Akey. Aunque es cierto que la mayoría de los no africanos remontan su ascendencia a [un solo evento fuera de África], eso no significa que esa fue la única vez que los humanos abandonaron África. . . . Al encontrar la ascendencia neandertal en los africanos, proporcionó información adicional sobre este proceso de cómo las poblaciones se han estado moviendo dentro y fuera de África durante mucho tiempo.
L. Chen et al., Identificación e interpretación de la ascendencia neandertal aparente en individuos africanos, Cell, doi:10.1016/j.cell.2020.01. 012, 2020.
Jef Akst es editor gerente de The Scientist. Envíele un correo electrónico a jakst@the-scientist.com.