El estudio identifica mutaciones específicas de la variante omicron
Distribución de la posición del residuo de aminoácido en la interfaz Spike/ACE o Spike/anticuerpo. El panel A muestra la distribución de residuos de aminoácidos mutados en la variante Omicron en el complejo formado entre S-RBD codificado por BNT162b1 y ACE2. Esta cifra ha sido generada por la entrada 7L7F del PDB. El panel B muestra la posición de los residuos en la interfaz de S-RBD y el anticuerpo IGHV3-53, donde se identificaron las mutaciones en la variante Omicron. La proteína S se representa en cintas verdes, mientras que el anticuerpo se representa en cintas de color naranja y azul claro. Los residuos de aminoácidos que representan los sitios de mutación en la variante Omicron se representan como bolas y palos. El panel C muestra la interacción Y145 de la proteína S con los restos A97 y V98 del anticuerpo (187). Una mutación de deleción (como se ve en la variante Omicron) anulará estas interacciones. Esta figura también muestra algunas posiciones de residuos en la proteína S donde están presentes las mutaciones en las variantes Delta y Delta Plus. Las cifras para los paneles D y E se generaron a partir de las entradas 7JMP y 7L2D del PDB, respectivamente. En ambos paneles, los átomos de los residuos de proteína S están coloreados como carbonos verdes, nitrógenos azules y oxígenos rojos. Los átomos de los anticuerpos están coloreados como carbonos naranjas, nitrógenos azules y oxígenos rojos. Crédito: DOI: 10.1016/j.jaut.2021.102779
Mientras que la variante omicron continúa infectando a personas en todo el mundo, los investigadores de la Universidad de Missouri han identificado las mutaciones específicas altamente prevalentes que están causando la alta tasa de infección de la variante omicron .
Los hallazgos ayudan a explicar cómo la nueva variante puede escapar de los anticuerpos preexistentes presentes en el cuerpo humano, ya sea por vacunación o naturalmente por una infección reciente de COVID-19.
«Sabemos que los virus evolucionan a lo largo tiempo y adquirir mutaciones, por lo que cuando escuchamos por primera vez sobre la nueva variante de omicron, queríamos identificar las mutaciones específicas de esta variante», dijo Kamlendra Singh, profesora de la Facultad de Medicina Veterinaria de MU, directora asistente del Núcleo de Interacciones Moleculares de MU e investigador del Bond Life Sciences Center.
Singh colaboró con Saathvik Kannan, estudiante de primer año en Hickman High School en Columbia, Missouri, y Austin Spratt, estudiante de pregrado en MU, y Sid Byrareddy de la Universidad de Nebraska Medical Center, para analizar secuencias de proteínas de muestras de omicrones de todo el mundo, incluidos Sudáfrica, Botswana y los Estados Unidos. El equipo identificó 46 mutaciones altamente prevalentes específicas de omicron, incluidas varias ubicadas en la región de la proteína de punta del virus donde los anticuerpos se unen al virus para prevenir la infección.
«El propósito de los anticuerpos es reconocer el virus y detener la unión, lo que previene la infección», dijo Singh. «Sin embargo, encontramos que muchas de las mutaciones en la variante omicron están ubicadas justo donde se supone que se unen los anticuerpos, por lo que estamos mostrando cómo el virus continúa evolucionando de una manera que potencialmente puede escapar o evadir los anticuerpos existentes y, por lo tanto, continúan infectando a tantas personas».
A medida que se siguen desarrollando los tratamientos antivirales para las personas infectadas con COVID-19, Singh explicó que tener una mejor comprensión de cómo evoluciona el virus ayudará a garantizar que los futuros tratamientos antivirales apuntar hacia las partes específicas del virus para producir los resultados más efectivos.
En un viaje reciente a su India natal, Singh se reunió con Manish Sisodia, el viceprimer ministro de Delhi, para discutir el lanzamiento de CoroQuil-Zn, un suplemento que se puede tomar mientras se está infectado con COVID-19 para ayudar a reducir la carga viral. El suplemento, que Singh ayudó a desarrollar, ahora está siendo utilizado por pacientes en Tamil Nadu, un estado de la India. El fabricante pronto buscará la aprobación de la FDA para su distribución en los Estados Unidos.
«El primer paso para resolver un problema es obtener una mejor comprensión del problema específico en primer lugar», dijo Singh. «Se siente bien contribuir a la investigación que está ayudando con la situación de la pandemia, que obviamente ha estado afectando a personas de todo el mundo».
«Variante Omicron SARS-CoV-2: características únicas y sus impacto en los anticuerpos preexistentes» se publicó recientemente en el Journal of Autoimmunity.
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La variante de Omicron es más transmisible pero las vacunas siguen siendo efectivas Más información: Saathvik R. Kannan et al, Variante de Omicron SARS-CoV-2: características únicas y su impacto en anticuerpos preexistentes, Journal of Autoimmunity (2021). DOI: 10.1016/j.jaut.2021.102779 Proporcionado por la Universidad de Missouri Cita: El estudio identifica mutaciones específicas de la variante omicron (2022, 20 de enero) obtenido el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news /2022-01-mutations-specific-omicron-variant.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.