Los laboratorios de búsqueda de virus del Reino Unido buscan reforzar la red global de variantes

La asistente de investigación Emily verifica una celda de flujo antes de colocarla en el secuenciador en el Instituto Wellcome Sanger, Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. Al secuenciar tantos casos positivos como sea posible, los investigadores esperan identificar variantes de preocupación lo más rápido posible y luego rastrear su propagación para proporcionar advertencias tempranas a los funcionarios de salud. Crédito: AP Photo/Frank Augstein

Los acondicionadores de aire zumban constantemente en el laboratorio del Instituto Wellcome Sanger, contrarrestando el calor emitido por filas de máquinas de secuenciación de alta tecnología que funcionan los siete días de la semana analizando el material genético de COVID-19. 19 casos de todo el Reino Unido

El laboratorio es un ejemplo de cómo los científicos británicos han industrializado el proceso de secuenciación genómica durante la pandemia, reduciendo el tiempo y el costo necesarios para generar una huella genética única para cada caso de coronavirus analizado. Eso convirtió al Reino Unido en un líder mundial en la secuenciación de COVID-19, ayudando a las autoridades de salud pública a rastrear la propagación de nuevas variantes, desarrollar vacunas y decidir cuándo imponer bloqueos.

Pero ahora los investigadores del Instituto Sanger en Cambridge y Los laboratorios de todo el Reino Unido tienen una nueva misión: compartir lo que han aprendido con otros científicos porque COVID-19 no tiene en cuenta las fronteras nacionales.

La variante omicron que ahora está alimentando una nueva ola de infección en todo el mundo muestra la necesidad de cooperación global, dijo Ewan Harrison, investigador principal de Sanger. Omicron fue identificado por primera vez por científicos en el sur de África que publicaron rápidamente sus hallazgos, dando tiempo a las autoridades de salud pública de todo el mundo para prepararse.

Dado que las mutaciones peligrosas del virus pueden ocurrir en cualquier lugar, los científicos deben monitorear su desarrollo en todas partes para proteger a todos, dijo Harrison, estableciendo un paralelo con la necesidad de acelerar las vacunas en el mundo en desarrollo.

Los asistentes de investigación observan las máquinas de secuenciación que analizan el material genético de los casos de COVID-19 en el Instituto Wellcome Sanger, Genome Campus, Hinxton. , Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. El laboratorio es un ejemplo de cómo los científicos británicos han industrializado el proceso de secuenciación genómica durante la pandemia, reduciendo el tiempo y el costo necesarios para generar una huella genética única para cada caso de coronavirus. analizado. Crédito: AP Photo/Frank Augstein

«Necesitamos estar preparados a nivel mundial», dijo. «No podemos simplemente poner una cerca alrededor de un país individual o partes del mundo, porque eso cortarlo».

Gran Bretaña hizo de la secuenciación una prioridad al principio de la pandemia después de que la profesora de la Universidad de Cambridge, Sharon Peacock, identificara el papel clave que podría desempeñar en la lucha contra el virus y obtuviera fondos del gobierno para una red nacional de científicos, laboratorios y centros de pruebas conocidos como COVID-19 Genomics UK Consortium. Esto permitió al Reino Unido movilizar la experiencia académica y científica acumulada desde que los investigadores británicos identificaron por primera vez la estructura química del ADN en 1953.

El consorcio ahora respalda los esfuerzos para impulsar los esfuerzos de secuenciación global con un programa de capacitación centrado en los investigadores. países en desarrollo. Con fondos del gobierno del Reino Unido, el consorcio y Wellcome Connecting Science planean ofrecer cursos en línea sobre muestreo, intercambio de datos y trabajo con agencias de salud pública para ayudar a los investigadores a crear programas nacionales de muestreo.

El asistente de investigación Robert demuestra cómo preparar una muestra para la secuenciación en el Instituto Wellcome Sanger, Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. El laboratorio es un ejemplo de cómo los científicos británicos han industrializado el proceso de secuenciación genómica durante la pandemia, reduciendo el tiempo y costo necesario para generar una huella genética única para cada caso de coronavirus analizado. Crédito: AP Photo/Frank Augstein

«Hay desigualdad en el acceso a la secuenciación en todo el mundo, y (el proyecto) está comprometido a contribuir a los esfuerzos que cierran esta brecha», dijo el grupo, al anunciar planes para ofrecer los primeros cursos a principios de este año. .

Al secuenciar tantos casos positivos como sea posible, los investigadores esperan identificar variantes de preocupación lo más rápido posible y luego rastrear su propagación para proporcionar advertencias tempranas a los funcionarios de salud.

Reino Unido ha proporcionado más secuencias de COVID-19 al centro de intercambio de información mundial que cualquier otro país que no sea EE. UU. y ha secuenciado un porcentaje mayor de sus casos que cualquier nación grande del mundo.

Los investigadores del Reino Unido han enviado 1,68 millones de secuencias, cubriendo el 11,7 % de los casos notificados, según datos recopilados por GISAID, que promueve el intercambio rápido de información sobre la COVID-19 y la gripe. EE. UU. ha proporcionado 2,22 millones de secuencias, o el 3,8 % de sus casos notificados.

Ewan Harrison , investigador sénior en Wellcome Sang er Institute, habla con The Associated Press en el Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. Los científicos británicos que buscan variantes del coronavirus tienen una nueva misión: compartir su experiencia con otros en todo el mundo. La variante omicron que ahora alimenta una nueva ola de infección en todo el mundo muestra la necesidad de cooperación global, dijo Harrison. Crédito: AP Photo/Frank Augstein

La mayoría de los países están realizando algunas secuencias, pero el volumen y la velocidad varían mucho. Si bien 205 jurisdicciones han compartido secuencias con GSAID, más de la mitad han secuenciado y compartido menos del 1 % del total de sus casos.

Durante los últimos dos años, los laboratorios de todo el Reino Unido han perfeccionado el proceso de recopilación y análisis Muestras de COVID-19 hasta que se asemejan a estrategias de fabricación justo a tiempo. Los protocolos específicos cubren cada paso, desde el hisopo hasta la secuencia y el informe, incluidos los sistemas para garantizar que los suministros estén en el lugar correcto en el momento correcto para mantener el flujo de trabajo.

Eso ha ayudado a reducir el costo de analizar cada genoma en un 50 %. mientras reduce el tiempo de respuesta de la muestra a la secuencia de tres semanas a cinco días, según Wellcome Sanger.

Aumentar la capacidad de secuenciación es como construir una tubería, según el Dr. Eric Topol, presidente de medicina innovadora en Scripps Investigación en San Diego, California. Además de comprar costosas máquinas de secuenciación, los países necesitan suministros de reactivos químicos, personal capacitado para realizar el trabajo e interpretar las secuencias y sistemas para garantizar que los datos se compartan de manera rápida y transparente.

Un asistente de investigación, Robert, demuestra cómo preparar una muestra con un agitador para la secuenciación en el Instituto Wellcome Sanger, Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. Al secuenciar tantos casos positivos como sea posible, los investigadores esperan identificar variantes de interés lo más rápido posible. como sea posible, luego haga un seguimiento de su propagación para proporcionar alertas tempranas a los funcionarios de salud. Crédito: AP Photo/Frank Augstein

Colocar todas esas piezas en su lugar ha sido un desafío para EE. UU., y mucho menos para los países en desarrollo, dijo Topol.

La secuenciación genómica «como herramienta de vigilancia en todo el mundo es esencial, porque muchos de estos países de bajos y medianos ingresos no tienen las capacidades de secuenciación, particularmente con un tiempo de respuesta razonable», dijo. «Así que la idea de que hay una mano amiga allí del Wellcome Center es excelente. Lo necesitamos».

Al laboratorio de última generación de Wellcome Sanger, las muestras llegan constantemente de todo el país. Los asistentes de laboratorio preparan cuidadosamente el material genético y lo cargan en placas que se insertan en las unidades de secuenciación que descifran el código de ADN único de cada muestra. Luego, los científicos analizan los datos y los comparan con genomas previamente identificados para rastrear mutaciones y ver si surgen nuevas tendencias.

Los asistentes de investigación trabajan en máquinas de secuenciación que analizan el material genético de los casos de COVID-19 en el Instituto Wellcome Sanger, Genome Campus. , Hinxton, Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. El laboratorio es un ejemplo de cómo los científicos británicos han industrializado el proceso de secuenciación genómica durante la pandemia, reduciendo el tiempo y el costo necesarios para generar una huella genética única para cada Caso de coronavirus analizado. Crédito: AP Photo/Frank Augstein

Con el COVID-19 en constante mutación, la prioridad es buscar nuevas variantes más peligrosas, incluidas aquellas que pueden ser resistentes a las vacunas, dijo Harrison. La información es fundamental para ayudar a los investigadores a modificar las vacunas existentes o desarrollar otras nuevas para combatir el virus en constante cambio.

Harrison elogió a Sudáfrica por su trabajo en la variante omicron altamente transmisible y por compartir rápidamente su investigación con las autoridades internacionales. . Desafortunadamente, muchos países luego restringieron los viajes a Sudáfrica, lo que perjudicó su economía.

Harrison dijo que se debe alentar a las naciones en desarrollo a publicar datos sobre nuevas variantes sin temor a las repercusiones económicas porque castigar a países como Sudáfrica solo obstaculizará la información. compartir lo que se necesita para combatir el COVID-19 y futuras pandemias.

«La clave, obviamente, es esta vigilancia de rutina constante», dijo. «Y creo que el paso más importante ahora es aumentar eso a nivel mundial».

• El asistente de investigación Robert demuestra cómo preparar una muestra para la secuenciación en el Instituto Wellcome Sanger, Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. Al secuenciar tantos casos positivos como sea posible En la medida de lo posible, los investigadores esperan identificar variantes de preocupación lo más rápido posible y luego rastrear su propagación para proporcionar advertencias tempranas a los funcionarios de salud. Credit: AP Photo/Frank Augstein
• Un asistente de investigación señala los recipientes de muestra para la secuenciación en el Instituto Wellcome Sanger, Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. El laboratorio es un ejemplo de cómo los británicos Los científicos han industrializado el proceso de secuenciación genómica durante la pandemia, reduciendo el tiempo y el costo necesarios para generar una huella genética única para cada caso de coronavirus analizado. Credit: AP Photo/Frank Augstein
• Asistentes de investigación observan las máquinas de secuenciación que analizan el material genético de los casos de COVID-19 en el Instituto Wellcome Sanger, Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire, Inglaterra, el viernes 7 de enero de 2022. Por secuenciación tantos casos positivos como sea posible, los investigadores esperan identificar variantes de preocupación lo más rápido posible, luego rastrear su propagación para proporcionar alertas tempranas a los funcionarios de salud. Credit: AP Photo/Frank Augstein

Para ahora, también significa mucho trabajo, todos los días, vigilar. Pero tal vigilancia tiene sus beneficios, dijo Tristram Bellerby, gerente del laboratorio.

«Ha sido bueno ver que nuestro trabajo ha sido valioso para encontrar estas nuevas variantes», dijo. «Espero que en algún momento pueda ayudarnos a salir de esta situación en la que nos encontramos.

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Cita: Los laboratorios de búsqueda de virus del Reino Unido buscan reforzar la red global de variantes (2022, 13 de enero ) obtenido el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-01-uk-virus-labs-bolster-global.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio privado o investigación, ninguna parte puede ser reproducida sin el permiso por escrito El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.