¿Ayudará más quimioterapia? Físicos estudian pruebas de expresión génica
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Después de la cirugía, las pacientes con cáncer de mama se enfrentan a la pregunta de si la quimioterapia adicional es necesaria y realmente efectiva. Es importante que estas mujeres no reciban demasiado tratamiento, pero tampoco demasiado poco. Físicos de la Universidad de Leipzig modelaron las pruebas de expresión génica y examinaron su utilidad sobre la base de estos modelos.
El profesor Josef Ks de la Universidad de Leipzig dirigió estas investigaciones en colaboración con el director del Instituto de Patología de Hamburgo-Oeste, el profesor Axel Niendorf, y el consultor estadístico independiente Bernhard Ulm. Acaban de publicar sus hallazgos en PLOS ONE.
Las pruebas de expresión génica examinan la actividad de ciertos genes en las células tumorales. A menudo, estos genes están relacionados con rasgos característicos del cáncer, como el crecimiento del tumor o la invasión del tejido circundante por células tumorales. Por lo tanto, una prueba de expresión génica representa un método para cuantificar las actividades de varios genes, es decir, una lista de genes, y así calcular la probabilidad de que el paciente desarrolle metástasis y cuándo.
Los resultados de estos estudios muestran que, por un lado, los límites de la certeza de las predicciones logradas con tales listas de genes y además indican que el examen de diferentes combinaciones de listas de genes no difiere significativamente en términos de resultados. Curiosamente, los investigadores han demostrado que incluso los genes aleatorios pueden ser pronósticos: eso significa incluso aquellos genes que parecen no estar relacionados con las características del cáncer.
Aquí, utilizando un análisis estadístico clásico y un nuevo enfoque en el aprendizaje automático , los físicos demostraron que tales listas de genes son, de hecho, pronósticas en un colectivo lo suficientemente grande y muestran altas correspondencias entre el pronóstico y el curso real de la enfermedad.
Contrariamente a la recomendación común en la práctica clínica de realizar solo una prueba, estas listas de genes mostraron que la certeza con respecto a una recomendación de quimioterapia es mucho mayor si se realiza más de una prueba.
«El hecho de que las pruebas son muy exitosas en un colectivo y tienden a ser menos exitosas en el paciente individual parece al principio ser una contradicción», dijo el profesor Ks, «pero estas pruebas se basan en listas de genes y cometen errores en diferentes puntos, por así decirlo. Esto podría aprovecharse combinando varios pruebas y, por lo tanto, aumentar la probabilidad de encontrar pacientes que definitivamente no se beneficiarán de la quimioterapia».
Con los debates en curso sobre si las pruebas de expresión génica son útiles, esta es una contribución importante al proceso de toma de decisiones y tienen un gran impacto en términos de cómo los médicos utilizan dichas herramientas. Para pacientes individuales en particular, estos resultados implican que se requiere cautela en el uso de pruebas de expresión génica.
Una limitación desde un punto de vista metodológico es que los investigadores no realizaron pruebas disponibles comercialmente; los análisis se basan en valores de expresión génica registrados en bases de datos públicas de cáncer de mama.
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El índice SET2,3 puede ser pronóstico en el cáncer de mama HR+, independientemente de la puntuación de recurrencia Más información: Dimitrij Tschodu et al, Análisis comparativo de firmas moleculares revela un enfoque híbrido en cáncer de mama: combinación del índice de pronóstico de Nottingham con expresiones génicas en una firma híbrida, PLOS ONE (2022). DOI: 10.1371/journal.pone.0261035 Información de la revista: PLoS ONE
Proporcionado por la Universidad de Leipzig Cita: ¿Ayudará más quimioterapia? Los físicos estudian las pruebas de expresión génica (11 de febrero de 2022) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-02-chemotherapy-physicists-gene.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.