Estudio de genómica ayuda a guiar el desarrollo de vacunas contra Shigella
Visualización de mutaciones y su efecto previsto en antígenos proteicos modelados IpaB, IpaC e IpaD. Visualización de mutaciones en proteínas modeladas IpaB, IpaC e IpaD. Los rangos de residuos de proteínas modelados se muestran entre paréntesis. Las regiones azules representan epítopos determinados empíricamente. Las mutaciones identificadas dentro de las proteínas se colorean utilizando la escala que se muestra en la clave incrustada. Las visualizaciones en la columna de la derecha son rotaciones de 180 grados de los modelos en relación con la columna de la izquierda. Crédito: DOI: 10.1038/s41564-021-01054-z
Un nuevo estudio de genómica dirigido por la Universidad de Liverpool ayudará a guiar el desarrollo y el uso de vacunas contra una de las principales causas de diarrea grave en niños a nivel mundial: la shigella.
Shigella es la principal causa bacteriana de diarrea infantil grave en países de ingresos bajos y medianos (LMIC) y se está volviendo cada vez más resistente a los antimicrobianos. Sin embargo, no existe una vacuna autorizada ampliamente disponible para la shigella y uno de los principales desafíos en su desarrollo es la considerable diversidad genómica y fenotípica de la bacteria.
En un nuevo artículo publicado en Nature Microbiology, los investigadores analizaron -secuencias del genoma de 1246 muestras de shigella recolectadas sistemáticamente de siete LMIC para caracterizar esta diversidad, que es esencial para informar el desarrollo y la implementación de vacunas, y otros aspectos del control de enfermedades.
La colección sin precedentes de muestras cubrió los cuatro shigella (S. sonnei, S. flexneri, S. boydii y S. dysenteriae) y se recolectó como parte del Estudio Multicéntrico Global Enteric (GEMS) entre 2007 y 2011.
El estudio destaca las características del patógeno eso complicará los enfoques de vacunas actuales, las diferencias regionales en la diversidad de shigella, así como los determinantes de la resistencia a los antimicrobianos.
Entre los hallazgos se encuentran que shigella sonnei contribuye al menos con seis ti mes más enfermedad que otras especies de shigella en relación con su diversidad genómica, y que la diversidad existente y la capacidad de adaptación entre S. flexneri pueden generar variantes de escape de la vacuna en menos de seis meses.
La investigación también revela la evolución convergente de resistencia contra la ciprofloxacina, el antimicrobiano actual recomendado por la OMS para el tratamiento de la shigellosis.
Dr. Rebecca Bengtsson, quien dirigió el análisis de datos, dijo: «La genómica de patógenos es una herramienta poderosa que tiene una amplia gama de aplicaciones para ayudar a combatir enfermedades infecciosas. A través de análisis genómicos de un conjunto de datos epidemiológicamente representativo, revelamos el alcance de la diversidad genómica de la población de shigella que impacta aquellos que son más vulnerables a la shigellosis y las implicaciones que esta diversidad tiene en las estrategias de vacunas actuales».
Muchos enfoques de vacunas actuales se enfocan en el serotipo de shigella, pero hay> 50 serotipos entre shigella y estos pueden cambiar rápidamente para generar variantes de escape inmune. Una alternativa atractiva y/o complemento a este enfoque son las vacunas de subunidades específicas que se dirigen a proteínas altamente conservadas y pueden ofrecer una amplia protección, pero se desconoce el grado de variación antigénica en estos objetivos. Este estudio exploró la cantidad y el tipo de variación en los antígenos y la velocidad a la que pueden cambiar de serotipo. En general, los resultados sugieren que los antígenos basados en proteínas proporcionan objetivos de vacuna más estables para este patógeno de importancia mundial.
Dr. Kate Baker, quien dirigió el estudio, dijo: «La carga de la enfermedad y el aumento de la RAM de shigella requieren una revisión de las opciones de tratamiento y manejo, y se ha generado un impulso significativo para enfrentar este desafío. La diversidad genómica en shigella presenta un obstáculo importante para controlar la enfermedad y hemos demostrado los escollos anticipados de los enfoques de vacunación actuales. Esto destaca la necesidad de considerar la diversidad genómica en el desarrollo de vacunas y planes de tratamiento para shigella y otros patógenos».
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Nuevos detalles sobre cómo el patógeno Shigella entrega proteínas bacterianas a nuestras células Más información: Rebecca J. Bengtsson et al, Los análisis patogenómicos de los aislados de Shigella informan sobre los factores que limitan la prevención y la prevención de la shigellosis. control en LMICs, Nature Microbiology (2022). DOI: 10.1038/s41564-021-01054-z Información de la revista: Nature Microbiology
Proporcionado por la Universidad de Liverpool Cita: El estudio de genómica ayuda a guiar el desarrollo de una vacuna contra la shigella (2022) , 1 de febrero) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-02-genomics-shigella-vaccine.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.