Branching Out
Árbol de la vida basado en genomas completamente secuenciadosWIKIMEDIA, GRINGERScientíficos han creado un nuevo árbol de la vida que muestra las relaciones entre todos los seres vivos conocidos, que los taxónomos suelen clasificar en uno de tres dominios: eucariotas, bacterias y arqueas . Una de las ramas más grandes de este nuevo árbol consiste en bacterias que son esencialmente nuevas para la ciencia, según un estudio publicado hoy (11 de abril) en Nature Microbiology.
“El característica significativa [del árbol] es que muchos de los linajes principales no tienen representantes aislados», es decir, que ninguna de sus especies ha sido cultivada individualmente en el laboratorio, dijo Jillian Banfield de la Universidad de California, Berkeley, quien dirigió la obra. “Gran parte del mundo que nos rodea está poblado por organismos de los que no sabemos nada” agregó.
“Es un gran paso adelante” dijo Doug Soltis del Museo de Historia Natural de Florida, quien no participó en el trabajo. Soltis…
El árbol de la vida se ha desarrollado a pasos agigantados, explicó el biólogo evolutivo de la Universidad de California, Davis, Jonathan Eisen, que no participó en el trabajo pero que comentó el manuscrito antes de que fuera publicado. presentado y ha colaborado previamente con Banfield. Las iteraciones de los árboles han incluido la dicotomía eucariota-procariota, el sistema de los cinco reinos y el sistema de los tres dominios, descrito por el microbiólogo Carl Woese en un artículo histórico de 1987 que [muchos científicos], incluido yo mismo, literalmente llevamos a todas partes, recordó Eisen.
Mi sensación es que la gente va a hacer lo mismo con este periódico, dijo Eisen. Van a imprimir estos árboles y los colocarán en su puerta.
El nuevo árbol se basa en datos de secuencias genómicas disponibles públicamente, complementados con la propia secuenciación metagenómica de los investigadores de más de 1000 especies microbianas cuyos genomas no estaban disponibles anteriormente. . Estas especies fueron muestreadas de varios ambientes remotos, incluido un acuífero y las bocas de dos delfines. Para determinar la relación y construir el árbol, los investigadores compararon las secuencias de aminoácidos de 16 proteínas ribosómicas.
La rama misteriosa de los árboles, llamada Candidate Phyla Radiation (CPR), es enorme: alrededor de un tercio de la genética la diversidad dentro de todo el árbol, tanto como la de eucariotas y arqueas combinadas, proviene del CPR, dijo a The Scientist la coautora del estudio Laura Hug, exmiembro del laboratorio de Banfield que ahora se encuentra en la Universidad de Waterloo en Canadá. en un correo electrónico. Actualmente, todo el grupo tiene un solo representante aislado, dijo Banfield.
Los miembros de los CPR comparten características biológicas distintivas. Hasta la fecha, parecería que todos estos organismos [dentro del CPR] tienen estilos de vida simbióticos o al menos dependen de otros organismos para la gran mayoría de sus recursos metabólicos básicos, dijo Banfield.
Muchos genes aislados de Las bacterias CPR tienen una función desconocida, por lo que el árbol puede representar una rica fuente de información para la biotecnología, dijo Banfield.
En ese sentido, señaló Eisen, uno de los beneficios de estos árboles filogenéticos es que pueden ayudar en la búsqueda de nuevas funciones biológicas: una de las mejores formas de descubrir una nueva función es ir a un organismo que está relacionado de forma lejana con cualquier otra cosa.
L. Hug et al., Una nueva visión del árbol de la vida, Nature Microbiology, doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48, 2016.
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