Ciclo de microbiomas de cazadores-recolectores con las estaciones
Los hombres hadza se preparan para cazar. IMAGEN CORTESÍA DE JEFF LEACHMenos de 200 personas hadza viven como cazadores-recolectores cerca de la orilla del lago Eyasi en Tanzania. En un estudio publicado hoy (24 de agosto) en Science, un equipo dirigido por Justin Sonnenburg de la Universidad de Stanford ha demostrado que la composición de su microbiota intestinal cambia con las estaciones de Tanzania. Los autores también encontró una clara segregación en la composición del microbioma entre poblaciones no industrializadas e industrializadas.
Este resultado «nos da alguna evidencia de que hubo un tipo común de microbioma que acompañó a los humanos durante decenas de años». miles, tal vez cientos de miles de años a medida que nos extendemos por el planeta” dice Sonnenburg. «Lo que es sorprendente es que las mismas especies en Hadza que muestran volatilidad a lo largo de las estaciones son las mismas que hemos perdido en el mundo industrializado». Algo acerca de las fluctuaciones en el microbioma hace que ciertas especies sean vulnerables…
Para comprender mejor el microbioma de los cazadores-recolectores modernos, Sonnenburg y sus colegas recolectaron 350 muestras de heces de 188 individuos Hadza durante 12 meses. El análisis genómico de los autores y los datos de un estudio anterior revelaron que los microbiomas Hadza son más diversos durante la estación seca de Tanzania que en la estación húmeda, y que los taxones presentes durante una estación seca coincidían con la otra estación seca.
El phylum Bacteriodetes disminuyó durante los períodos de lluvia, mientras que el phylum Firmicutes se mantuvo estable. El muestreo repetido de la microbiota de ocho individuos a lo largo de las estaciones mostró que algunos otros taxones, como las espiroquetascaían por debajo de los límites de detección durante la estación húmeda.
IMAGEN CORTESÍA DE JEFF LEACH
Los autores descubrieron que la producción de enzimas que los microbios utilizan para digerir los carbohidratos también variaba según la estación. En la estación seca, cuando una gran proporción de la dieta hadza se compone de animales de caza, hubo una mayor diversidad de estas enzimas que en la estación húmeda, cuando los hadza comen más a menudo bayas y miel.
Los microbiomas industrializados contenían menos diversidad en estas enzimas y tenían niveles más bajos de las enzimas que se utilizan principalmente para digerir las plantas.
Luego, los investigadores reunieron datos de microbiomas de estudios de otros grupos no industrializados de todo el mundo y los compararon con los análisis. de la microbiota de las poblaciones industrializadas. Los microbiomas de los grupos no industrializados eran más similares entre sí que los microbiomas de las regiones industrializadas, que se agruparon. Los autores encontraron que los grupos de microbios que variaban estacionalmente en Hadza estaban en gran parte ausentes en los microbiomas industrializados, pero presentes en los microbiomas de las personas que viven de manera similar a ellos.
Amanda Henry, antropóloga de la Universidad de Leiden en los Países Bajos, que no participó en este estudio pero dirigió un trabajo anterior que investigaba los microbiomas de Hadza, advierte que no se debe considerar la microbiota de Hadza como un microbioma saludable ideal por el que luchar y explica que sus microbiomas no reflejan necesariamente los de los ancestros humanos. Aunque viven como cazadores-recolectores, los hadza han estado coevolucionando con sus microbios durante tanto tiempo como las poblaciones industrializadas han estado coevolucionando con las suyas, dice.
Podemos decir que existen estas diferencias, pero no tenemos un buen manejo de lo que significan, explica Henry. En algunos casos, puede establecer correlaciones entre la salud y la enfermedad y ciertas comunidades bacterianas, pero parece que todavía hay un poco del problema del huevo y la gallina con eso.
El camino a seguir es estudiar lo que estos microbios en el huésped humano, dice Jens Walter, biólogo de la Universidad de Alberta en Canadá que no participó en el estudio. Por el momento sabemos que están perdidos, y tenemos esta atractiva hipótesis de que perderlos podría contribuir a la enfermedad occidental, pero realmente no tenemos muchos estudios funcionales para demostrarlo.
Una mujer Hadza recolecta bayas .IMAGEN CORTESÍA DE JEFF LEACH
El grupo de Sonnenburg ya está trabajando para aislar y caracterizar la biología de los microbios de Hadza. A corto plazo, el equipo explorará la función microbiana en ratones libres de gérmenes y luego posiblemente se trasladará a los humanos.
Estamos entrando en una era en la que muchas personas en el campo están pensando en cambiar el microbioma para cambiar la salud de las personas, dice Sonnenburg. Esta investigación sugiere que la paleta de microbios que se usará para reprogramar el microbioma humano es mucho mayor de lo que pensábamos originalmente cuando solo estábamos secuenciando a otras personas industrializadas.
SA Smits et al., Seasonal ciclismo en el microbioma intestinal de los cazadores-recolectores hadza de Tanzania, Science, doi:10.1126/science.aan4834, 2017.
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