Ensayo para la monitorización y el tratamiento específicos del paciente para el cáncer de ovario

Figura 1. Interrogación de los datos de RNAseq a granel derivados del tumor o de RNAseq unicelular (sc) de tumor/sangre de pacientes con cáncer. (A,B) Las visualizaciones de incrustación de vecinos estocásticos distribuidos en t (tSNE) de los tipos de células inmunitarias indicados, a partir de datos de scRNAseq de pacientes con carcinoma neuroendocrino de células grandes y de células renales (n = 4 pacientes en total) (derivado de GSE139555) aislado de tejido tumoral (A) o sangre periférica (B). Estas células inmunitarias se colorearon adicionalmente para los niveles de firma del gen de respuesta de NFB e IFN/ISG. En este documento, las flechas resaltan las principales poblaciones inmunitarias con superposiciones entre el tumor y la sangre para estas firmas, y los círculos indican diferentes subconjuntos de células mieloides. (C) Análisis PCA de la expresión media de cada gen en los tipos de cáncer (de la figura S5A complementaria en línea) y valores de HR medianos (de la figura S5B complementaria en línea). El diagrama de Venn representa la porción de NFB e ISG en cada grupo. (D,E) Visualización del intervalo de confianza (IC) del 95% de la relación de riesgo (HR) para el impacto de la expresión de la firma del gen de señalización NFB (D) o la firma del gen de señalización ISG (E), para los conjuntos de datos de cáncer TCGA indicados en los que el El límite de expresión de la firma para la estratificación de pacientes binaria (expresión alta frente a baja) se basó en el principio de umbral de mejor rendimiento para OS de pacientes con cáncer indicados para TCGA (LIHC, n = 371; PAAD, n = 177; LUSC, n = 501; LUAD, n=513; HNSC, n=500; CESC, n=304; BLCA, n=405; UCEC, n=543; OV, n=374; SARC, n=259; BRCA; n=1090; KIRC; n=530) (Prueba de Mantel-Cox, *p