Estudio descubre gen que duplica el riesgo de muerte por COVID-19
Impresión 3D de una proteína espiga de SARS-CoV-2, el virus que causa la COVID-19, frente a una impresión 3D de una partícula del virus SARS-CoV-2. La proteína espiga (en primer plano) permite que el virus ingrese e infecte las células humanas. En el modelo de virus, la superficie del virus (azul) está cubierta con proteínas de pico (rojo) que permiten que el virus ingrese e infecte las células humanas. Crédito: NIH
Investigadores del Departamento de Medicina de Radcliffe han identificado el gen responsable de duplicar el riesgo de insuficiencia respiratoria por COVID-19. El sesenta por ciento de las personas con ascendencia del sur de Asia tienen la señal genética de alto riesgo, lo que explica en parte el exceso de muertes observado en algunas comunidades del Reino Unido y el impacto de la COVID-19 en el subcontinente indio.
El trabajo anterior ya identificó un tramo de ADN en el cromosoma 3 que duplicó el riesgo de que los adultos menores de 65 años mueran a causa de la COVID. Sin embargo, los científicos no sabían cómo funcionaba esta señal genética para aumentar el riesgo, ni el cambio genético exacto que era responsable.
En un estudio publicado en Nature Genetics, un equipo dirigido por los Profs. James Davies y Jim Hughes, del Instituto de Medicina Molecular MRC Weatherall de la Universidad de Oxford, utilizaron tecnología de punta para averiguar qué gen estaba causando el efecto y cómo lo estaba haciendo.
Codirector del estudio, el profesor Jim Hughes, profesor de regulación genética, dijo que «la razón por la que esto ha resultado tan difícil de resolver es que la señal genética previamente identificada afecta la ‘materia oscura’ del genoma. Descubrimos que el aumento del riesgo no se debe a una diferencia en el gen que codifica una proteína, sino debido a una diferencia en el ADN que activa un gen. Es mucho más difícil detectar el gen que se ve afectado por este tipo de efecto de cambio indirecto».
El equipo entrenó un algoritmo de inteligencia artificial para analizar grandes cantidades de datos genéticos de cientos de tipos de células de todas las partes del cuerpo, para demostrar que es probable que la señal genética afecte a las células del pulmón. Luego, utilizando una técnica de alta precisión que acababan de desarrollar, los investigadores pudieron reducir el ADN en la señal genética. Esto examina la forma en que los miles de millones de letras de ADN se pliegan para caber dentro de una célula para identificar el gen específico que estaba siendo controlado por la secuencia que causaba el mayor riesgo de desarrollar COVID-19 grave.
Dr. Damien Downes, quien dirigió el trabajo de laboratorio del grupo de investigación de Hughes, dijo que «sorprendentemente, como se sospechaba de varios otros genes, los datos mostraron que un gen relativamente poco estudiado llamado LZTFL1 causa el efecto».
Los investigadores descubrió que la versión de mayor riesgo del gen probablemente evita que las células que recubren las vías respiratorias y los pulmones respondan al virus de manera adecuada. Pero lo más importante es que no afecta el sistema inmunitario, por lo que los investigadores esperan que las personas que portan esta versión del gen respondan normalmente a las vacunas.
Los investigadores también tienen la esperanza de que los medicamentos y otras terapias puedan dirigirse a la vía que previene el revestimiento pulmonar se transforme en células menos especializadas, lo que aumenta la posibilidad de nuevos tratamientos personalizados para aquellos que tienen más probabilidades de desarrollar síntomas graves.
El codirector del estudio, el profesor James Davies, quien trabajó como consultor del NHS en cuidados intensivos medicina durante la pandemia y es profesor asociado de genómica en el Departamento de Medicina Radcliffe de la Universidad de Oxford, dijo: «El factor genético que hemos encontrado explica por qué algunas personas se enferman gravemente después de la infección por coronavirus. Muestra que la forma en que el pulmón responde a la infección es fundamental. Esto es importante porque la mayoría de los tratamientos se han centrado en cambiar la forma en que el sistema inmunitario reacciona al virus».
El sesenta por ciento de las personas con S La tercera ascendencia asiática portaba esta versión del gen de mayor riesgo en comparación con el 15 por ciento de las personas con ascendencia europea, lo que explica en parte las tasas más altas de mortalidad y hospitalizaciones en el primer grupo. El estudio también encontró que el 2 por ciento de las personas con ascendencia afrocaribeña portaban el genotipo de mayor riesgo, lo que significa que este factor genético no explica por completo las tasas de mortalidad más altas reportadas para las comunidades étnicas negras y minoritarias.
Profesor Davies explicó que «el código de ADN de mayor riesgo se encuentra más comúnmente en algunas comunidades negras y étnicas minoritarias, pero no en otras. Aunque no podemos cambiar nuestra genética, nuestros resultados muestran que las personas con el gen de mayor riesgo probablemente se beneficien particularmente de la vacunación». Dado que la señal genética afecta al pulmón en lugar del sistema inmunitario, significa que la vacuna debería cancelar el aumento del riesgo».
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El Alzheimer y la COVID-19 comparten un factor de riesgo genético Más información: Damien J. Downes et al, Identificación de LZTFL1 como gen efector candidato en riesgo de COVID-19 locus, Nature Genetics (2021). DOI: 10.1038/s41588-021-00955-3 Información de la revista: Nature Genetics
Proporcionado por la Universidad de Oxford Cita: Un estudio descubre un gen que duplica el riesgo de muerte por COVID-19 (2021, 5 de noviembre) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-11-uncovers-gene-death-covid-.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.