La prueba del mismo día identifica infecciones secundarias en pacientes con COVID-19

Crédito: Pixabay/CC0 Dominio público

Se ha demostrado que una prueba del mismo día identifica con éxito infecciones secundarias para pacientes en cuidados intensivos en horas en lugar de días, según investigación de Guy’s y St Thomas’.

La prueba basada en la secuenciación del ADN fue evaluada por médicos en la unidad de cuidados intensivos (UCI) del Hospital St Thomas con 34 pacientes de la UCI durante la primera ola pandémica de COVID-19.

El estudio mostró cómo esto La prueba rápida garantizará que los pacientes obtengan el antibiótico correcto más rápido, al mismo tiempo que minimizará las prescripciones innecesarias de antibióticos para reducir el riesgo de resistencia a los antimicrobianos. Las pruebas se evaluaron para pacientes con COVID-19 y se demostró que identifican infecciones bacterianas y fúngicas e identifican brotes con bacterias resistentes en 24 horas.

Esta investigación ahora puede trasladarse al servicio clínico este invierno para COVID-19 y pacientes con influenza en la UCI para demostrar el beneficio total de la tecnología de nanoporos integrada en un entorno del NHS. Esto es particularmente importante para los pacientes con COVID-19 que son altamente susceptibles a infecciones secundarias y brotes.

La investigación se realizó en Guy’s and St Thomas’ en colaboración con investigadores del King’s College London y el Quadram Institute. Está publicado en Genome Medicine.

Cuando se atiende a pacientes en estado crítico en la UCI, los médicos toman muestras profundas de sus pulmones. Actualmente, estas muestras a menudo se envían a múltiples laboratorios donde se establecen diferentes cultivos de bacterias y hongos junto con otras pruebas moleculares complejas. Los resultados iniciales tardan de dos a cuatro días en volver. Durante este tiempo, el paciente a menudo permanece con el tratamiento antibiótico estándar, algunos de los cuales pueden ser innecesarios. En otros pacientes, el tratamiento puede ser ineficaz, ya que la bacteria tiene genes de resistencia a los antibióticos estándar.

Profesor Jonathan Edgeworth, director del Centro de Investigación de Diagnóstico e Infecciones Clínicas (CIDR) y director médico de Viapath , dirigió la investigación. Él dijo: «Tan pronto como comenzó la pandemia, nuestros científicos se dieron cuenta de que sería beneficioso secuenciar los genomas de todas las bacterias y hongos que causan infección en pacientes con COVID-19 mientras estaban en la UCI. En unas pocas semanas demostramos que puede diagnosticar una infección secundaria, dirigir el tratamiento con antibióticos y detectar brotes mucho antes que las tecnologías actuales, todo a partir de una sola muestra Esto revolucionará nuestro enfoque para la prevención y el tratamiento de infecciones graves en la UCI y ahora planeamos ofrecerlo como un servicio clínico para pacientes con COVID-19 e influenza este próximo invierno».

El nuevo servicio en el mismo día utiliza la tecnología de secuenciación Nanopore de vanguardia para identificar todos los patógenos bacterianos y fúngicos presentes en las muestras de los pacientes, así como cualquier gen de resistencia presente. El avance significa que se puede reducir el tratamiento innecesario y que los pacientes pueden beneficiarse de comenzar antes el tratamiento adecuado.

Al día siguiente, la misma prueba proporciona suficiente secuencia genética para comparar los genomas de patógenos con una base de datos que identifica con precisión a los pacientes. portadores de la misma cepa para que los brotes puedan detectarse desde el principio. Esta es la primera vez que se demuestra este beneficio combinado de una sola prueba.

Este innovador servicio fue posible gracias a la financiación del NIHR Guy’s and St Thomas’ Biomedical Research Centre, y una asociación entre Kings Colegio de Londres; viavía; el Instituto Quadram en Norwich; Oxford Nanopore Technologies y Guy’s and St Thomas’.

Gordon Sanghera, director ejecutivo de Oxford Nanopore, dijo: «La caracterización rápida de las coinfecciones para la prescripción precisa es el siguiente paso vital tanto para los pacientes con COVID-19 como para las enfermedades respiratorias en general. «Este año, hemos visto una respuesta sorprendente de la comunidad de investigación que utiliza la tecnología de secuenciación de Oxford Nanopore para obtener información rápida sobre muchos aspectos de COVID-19, desde la epidemiología genómica hasta las pruebas y ahora las coinfecciones. Es un privilegio ver una innovación tan rápida, enorme felicidades al equipo.»

Dra. Andrew Page, del Quadram Institute, dijo: «Hemos estado trabajando en tecnología de metagenómica durante los últimos siete años. Es fantástico ver cómo se aplica a la atención de los pacientes durante la pandemia de COVID-19 y demuestra cómo una prueba puede ayudar a responder varias preguntas clínicas. estamos realmente emocionados de que esta tecnología esté ahora en proceso de implementación en uno de los mejores hospitales del mundo, para mejorar el manejo de los pacientes y reducir la resistencia a los antimicrobianos».

Explore más

La prueba de ADN puede identificar rápidamente la neumonía en pacientes con COVID-19 grave, lo que ayuda a un tratamiento más rápido Más información: Themoula Charalampous et al, Evaluación del potencial de la metagenómica respiratoria para mejorar el tratamiento de infección secundaria y detección de transmisión nosocomial en unidades de cuidados intensivos COVID-19 ampliadas, Genome Medicine (2021). DOI: 10.1186/s13073-021-00991-y Información de la revista: Genome Medicine

Proporcionado por NIHR Biomedical Research Center at Guy’s and St Thomas’ and King’s College London Cita: La prueba del mismo día identifica infecciones secundarias en pacientes con COVID-19 (2021, 17 de noviembre) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-11-day-secondary-infections-covid-patients.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.