La sangre humana alberga ADN microbiano libre de células
ARRIBA: ISTOCK.COM,DARIA USTIUGOVA
La mayoría de los biomarcadores que los médicos usan para diagnosticar el cáncer son humanos. Pero la creciente evidencia de un vínculo entre el microbioma y la malignidad presenta una oportunidad para observar la presencia de ADN microbiano como una forma de identificar y posiblemente predecir la enfermedad. En un estudio publicado el 23 de junio en Genome Biology, los investigadores demuestran que es posible detectar ADN bacteriano en muestras de sangre tanto en personas sanas como en pacientes con melanoma.
Este es otro manuscrito más que demuestra que se pueden identificar firmas microbianas en la sangre, pero hasta la fecha hay muchos matices con estas estrategias [de identificación], en particular cuando se trata de una posible contaminación, dice Jennifer Wargo, cirujana de melanoma en el MD Anderson Cancer Center en Texas que no participó en el estudio. Definitivamente hay muchas promesas, pero sus primeros días y estas estrategias deben optimizarse e, idealmente, estandarizarse.
Stephen Wong, un postdoctorado en el grupo Sarah-Jane Dawsons en el Peter MacCallum Cancer Center en Australia , y sus colegas se han centrado en el pasado en los biomarcadores del cáncer, principalmente en el ADN tumoral circulante. Después de leer informes anteriores sobre el ADN microbiano circulante y su participación en enfermedades como el VIH y el cáncer, el equipo se dispuso a ver si podían encontrarlo o no en muestras de sangre humana.
En el nuevo estudio, los investigadores realizaron la secuenciación 16S, que cataloga los genes del ARN ribosómico bacteriano, en muestras de plasma, heces y saliva de 16 pacientes con melanoma avanzado. Wong dice que inicialmente se sorprendieron cuando detectaron una gran firma bacteriana en el plasma, pero rápidamente se dieron cuenta de que muchos de los microbios que detectaron eran contaminantes comunes del entorno y los reactivos del laboratorio.
El equipo comenzó a realizar controles sin muestras incluidas junto con sus muestras en cada paso del proceso. Como parte de su análisis bioinformático, filtraron la contaminación y encontraron una señal de ADN bacteriano pequeña pero aparentemente genuina en las muestras de plasma que era distinta de las muestras de heces y saliva. Cuando los investigadores compararon el ADN microbiano libre de células encontrado en 15 personas sanas y 15 nuevos pacientes con melanoma, observaron que el plasma sano contenía una diversidad más amplia de especies bacterianas. También identificaron un género Castellaniella que era exclusivo del plasma sano, lo que indica que algún día podría ser posible distinguir a las personas sanas de las enfermas a través del ADN microbiano circulante.
Véase Trasplante fecal podría Impulsar la inmunoterapia para tratar el melanoma
El informe es un ejemplo más de que podemos encontrar señales microbianas en este caso específico, en realidad, señales bacterianas prácticamente en todos los lugares donde miramos. El desafío es descubrir cuál es su relevancia biológica, dice Nadim Ajami, quien trabaja con Wargo en MD Anderson y no participó en el estudio.
La secuenciación de 16s solo brinda información sobre bacterias y algunas arqueas, pero no olvidarse de los otros componentes del mundo microbiano también es clave, dice. Por ejemplo, la presencia de fagos puede cambiar el perfil biológico de una bacteria, ya que los fagos portan genes que afectan la función bacteriana. Además, encontrar cromosomas bacterianos y fagos puede crear una imagen más completa de qué microbios están presentes.
Por lo general, las personas piensan en los microbios como contaminación y no como información, dice Sandrine Miller-Montgomery, quien formó parte de un equipo que mostró en 2020 que la información del microbioma de la sangre y los tejidos está asociada con varios tipos de cáncer. Miller-Montgomery es ahora el director ejecutivo y presidente de Micronoma, una empresa de biotecnología que surgió del trabajo de 2020 y se enfoca en predecir el cáncer mediante el análisis de señales microbianas en biopsias líquidas, como muestras de sangre. Espero que otros busquen en [el] microbioma circulante en busca de otras enfermedades, agrega. Si bien es cierto que su baja biomasa, baja biomasa no significa que no sea muy relevante.