La secuenciación del genoma completo aumenta el diagnóstico de trastornos raros en casi un tercio, según un estudio
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Los trastornos mitocondriales afectan a alrededor de 1 de cada 4300 personas y causan enfermedades progresivas e incurables. Se encuentran entre las enfermedades hereditarias más comunes, pero son difíciles de diagnosticar para los médicos, sobre todo porque pueden afectar a muchos órganos diferentes y parecerse a muchas otras afecciones.
Los regímenes actuales de pruebas genéticas no logran diagnosticar alrededor del 40 % de los pacientes, lo que tiene importantes implicaciones para los pacientes, sus familias y los servicios de salud que utilizan.
Un nuevo estudio, publicado hoy en el BMJ, ofrece esperanza a familias sin diagnóstico, y respalda los planes para que el Reino Unido establezca un programa de diagnóstico nacional basado en la secuenciación del genoma completo (WGS) para hacer más diagnósticos más rápido.
Si bien estudios anteriores basados en cohortes pequeñas y altamente seleccionadas han sugirió que WGS puede identificar trastornos mitocondriales, este es el primero en examinar su eficacia en un sistema nacional de salud, el NHS.
El estudio, dirigido por investigadores de la Unidad de Biología Mitocondrial de MRC y los Departamentos de Neurociencia Clínica y Genética Médica en la Universidad de Cambridge, involucró a 319 familias con sospecha de enfermedad mitocondrial reclutadas a través del Proyecto 100,000 Genomas que se estableció para incorporar pruebas genómicas en el NHS, descubrir nuevos genes de enfermedades y hacer diagnósticos genéticos disponible para más pacientes.
En total, a 345 participantes de 0 a 92 años con una mediana de edad de 25 años se les secuenció todo el genoma. A través de diferentes análisis, los investigadores encontraron que podían hacer un diagnóstico genético definitivo o probable para 98 familias (31%). Las pruebas estándar, que a menudo son más invasivas, no lograron llegar a estos diagnósticos. Se realizaron seis posibles diagnósticos (2% de las 98 familias). Un total de 95 genes diferentes estaban implicados.
Sorprendentemente, el 62,5 % de los diagnósticos eran en realidad trastornos no mitocondriales, y algunos tenían tratamientos específicos. Esto sucedió porque muchas enfermedades diferentes se parecen a los trastornos mitocondriales, lo que hace que sea muy difícil saber cuáles son cuáles.
El profesor Patrick Chinnery de la Unidad de Biología Mitocondrial del MRC y el Departamento de Neurociencias Clínicas de la Universidad de Cambridge, dijo :
«Recomendamos que la secuenciación del genoma completo se ofrezca de forma temprana y antes de pruebas invasivas como una biopsia muscular. Todo lo que los pacientes tendrían que hacer es hacerse un análisis de sangre, lo que significa que esto podría ofrecerse en todo el todo el país de manera equitativa. Las personas no tendrían que viajar largas distancias para múltiples citas, y recibirían su diagnóstico mucho más rápido».
Dr. Katherine Schon de la Unidad de Biología Mitocondrial del MRC y los Departamentos de Neurociencia Clínica y Genética Médica, dijo:
«Un diagnóstico genético definitivo realmente puede ayudar a los pacientes y sus familias, brindándoles acceso a información personalizada sobre el pronóstico y el tratamiento , asesoramiento genético y opciones reproductivas, incluido el diagnóstico genético previo a la implantación o el diagnóstico prenatal».
Los investigadores realizaron el 37,5 % de sus diagnósticos en genes que se sabe que causan enfermedades mitocondriales. Estos diagnósticos fueron casi todos exclusivos de una familia participante en particular, lo que refleja la diversidad genética que se encuentra en estos trastornos. El deterioro de la función mitocondrial tiende a afectar tejidos con alta demanda energética como el cerebro, los nervios periféricos, el ojo, el corazón y los músculos periféricos. El estudio ofrece un nuevo recurso valioso para el descubrimiento de futuros genes de enfermedades mitocondriales.
La mayoría de los diagnósticos del equipo (62,5 %) fueron, sin embargo, de trastornos no mitocondriales que tenían características parecidas a las enfermedades mitocondriales. Estos trastornos se habrían pasado por alto si los participantes solo hubieran sido investigados por trastornos mitocondriales a través de una biopsia muscular y/o un panel de genes mitocondriales específicos. Estos participantes vivían con una variedad de condiciones que incluyen trastornos del desarrollo con discapacidad intelectual, condiciones epilépticas severas y trastornos metabólicos, así como enfermedades cardíacas y neurológicas.
Chinnery dijo: «Estos pacientes fueron remitidos debido a una sospecha de enfermedad mitocondrial y las pruebas de diagnóstico convencionales son específicamente para enfermedades mitocondriales. A menos que considere estas otras posibilidades, no las diagnosticará. La secuenciación del genoma completo no está restringida por ese sesgo».
Un pequeño número de Como resultado, los participantes recién diagnosticados ya están recibiendo tratamientos. El equipo identificó trastornos potencialmente tratables en seis participantes con un trastorno mitocondrial y nueve con un trastorno no mitocondrial, pero aún no se ha determinado el impacto de los tratamientos.
Chinnery dijo: «Los servicios de diagnóstico están fragmentados y distribuidos de manera desigual en todo el Reino Unido, y eso crea grandes desafíos para las personas con enfermedades raras y sus familias. Al ofrecer un programa nacional basado en este enfoque de todo el genoma, puede ofrecer el mismo nivel de servicio a todos.
Schon dijo: «Si podemos crear una plataforma nacional de familias con enfermedades raras, podemos darles la oportunidad de participar en ensayos clínicos para que podamos obtener evidencia definitiva de que los nuevos tratamientos funcionan».
El estudio señala que el número relativamente alto de pacientes con diagnósticos probables o posibles refleja la necesidad de una mayor inversión en el análisis de los efectos funcionales de las nuevas variantes genéticas que podrían ser la causa de la enfermedad, pero no es seguro en este momento ent.
También argumenta que la secuenciación rápida del genoma completo en trío debe ofrecerse a todas las personas con enfermedades agudas con sospecha de trastornos mitocondriales, de modo que los resultados puedan ayudar a guiar el manejo clínico. Actualmente en el Reino Unido, esto solo está disponible para niños con enfermedades agudas.
Dr. Ellen Thomas, directora clínica y directora de calidad de Genomics England, dijo: «Estamos muy complacidos de ver que una investigación importante como esta sea posible gracias a los datos generosamente donados por los participantes del Proyecto 100,000 Genomes. A partir de estos resultados, queda claro cómo sus contribuciones a un conjunto de datos rico y, lo que es más importante, seguro es fundamental para facilitar la investigación genómica que conduce a conocimientos como estos que luego tienen el potencial de devolver valor al NHS y a sus pacientes.Esperamos ver cómo estos hallazgos podrían respaldar la atención futura de los pacientes. con sospecha de trastornos mitocondriales».
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Investigadores desarrollan herramientas para medir la función del músculo esquelético en pacientes con enfermedad mitocondrial Más información: KR Schon et al., «Uso de la secuenciación del genoma completo para determinar la base genética de sospecha de trastornos mitocondriales: un estudio de cohorte», BMJ (2021). DOI: 10.1136/ bmj-2021-066288 Información de la revista: British Medical Journal (BMJ)
Proporcionado por la Universidad de Cambridge Cita: La secuenciación del genoma completo aumenta el diagnóstico de en casi un tercio, encuentra un estudio (3 de noviembre de 2021) consultado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-11-genome-sequencing-diagnosis-rare-disorders.html Este documento está sujeto a derechos de autor . Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.