Los científicos revelan un mapa proteómico completo del adenocarcinoma de pulmón humano
Crédito: CC0 Public Domain
Un equipo de científicos chinos del Laboratorio Estatal Clave de Investigación de Medicamentos, Instituto de Materia Médica de Shanghái de la Academia de Ciencias de China, junto con varios colaboradores institucionales, ha publicado recientemente un análisis proteómico exhaustivo basado en 103 pacientes chinos con adenocarcinoma de pulmón (LUAD), una de las principales causas de muerte entre todos los tipos de cáncer en todo el mundo.
La investigación reveló características moleculares relacionadas con LUAD, su asociación con resultados clínicos, posibles biomarcadores de pronóstico y dianas farmacológicas. Este estudio se publicó en línea en Cell el 9 de julio.
A pesar del progreso notable en el estudio genómico de LUAD en los últimos años, un gran porcentaje de pacientes con LUAD todavía carecen de estrategias terapéuticas específicas. Dado que las proteínas son los ejecutores directos de las actividades biológicas, un estudio proteómico integral de LUAD podría llenar el vacío de conocimiento entre la anomalía genómica y la función de la proteína oncogénica.
Para proporcionar una comprensión integral del panorama molecular de LUAD y ofrecer la oportunidad para un diagnóstico y tratamiento más precisos de LUAD, los científicos de este estudio realizaron análisis proteómicos y fosfoproteómicos integrados de tejidos tumorales y sus tejidos adyacentes no cancerosos emparejados de 103 pacientes con LUAD. Se identificaron un total de 11.119 proteínas y 22.564 sitios de fosforilación. Al combinar estos datos proteómicos con información clínica y datos genómicos, se obtuvo un panorama molecular integral de LUAD.
Los científicos descubrieron que la transición epitelio-mesénquima, así como las vías de señalización inflamatorias y oncogénicas, probablemente condujeron a un mal pronóstico. en etapa I LUAD. Además, establecieron conexiones entre las alteraciones genéticas y las características proteómicas en pacientes con mutación de EGFR o TP53, dos genes impulsores predominantes en pacientes chinos con LUAD.
Niveles elevados de expresión de dos marcadores histológicos, TTF-1 y Napsin-A , y se observaron proteínas en spliceosomas en pacientes con mutación de EGFR. En pacientes con la mutación TP53, varias vías oncogénicas, incluida la replicación del ADN y la reparación de errores de emparejamiento, cambiaron notablemente.
Los investigadores clasificaron a todos los pacientes en tres subtipos proteómicos (SI, S-II, S-III) , cada uno con distintas características moleculares y características clínicas. El análisis bioinformático integral mostró que los pacientes con SI estaban asociados con un entorno celular y un buen pronóstico. Por el contrario, los pacientes S-III se asociaron con proliferación celular y estabilidad del proteoma y un mal pronóstico. El análisis fosfoproteómico reveló además vías de señalización y quinasas activadas en diferentes subtipos proteómicos. El análisis integrador de datos proteómicos y clínicos reveló además 27 biomarcadores plasmáticos potenciales y varios objetivos farmacológicos para LUAD. HSP 90, uno de los biomarcadores potenciales, se validó aún más en una cohorte independiente.
Este estudio proporciona nuevos conocimientos sobre LUAD más allá de la comprensión genómica actual. El conjunto de datos proteómicos sirve como un recurso valioso y poderoso para acelerar la traducción de la investigación básica en diagnósticos y tratamientos terapéuticos más precisos en la práctica clínica.
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Modulación de factores de proliferación en adenocarcinoma de pulmón Información de la revista: Cell
Proporcionado por la Academia de Ciencias de China Cita: Los científicos revelan proteómica integral mapa de adenocarcinoma de pulmón humano (2020, 9 de julio) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-07-scientists-reveal-comprehensive-proteomic-human.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.