Los investigadores descubren nuevas vías que podrían ayudar a tratar los virus de ARN
Un bucle en horquilla de un pre-ARNm. Resaltadas son las nucleobases (verde) y el esqueleto de ribosa-fosfato (azul). Tenga en cuenta que se trata de una sola hebra de ARN que se pliega sobre sí misma. Crédito: Vossman/ Wikipedia
Investigadores de la Universidad de New Hampshire han identificado nuevas vías en un virus basado en ARN donde los inhibidores, como los tratamientos médicos, se desatan. El hallazgo podría ser beneficioso para comprender cómo reaccionan estos inhibidores y potencialmente ayudar a desarrollar una nueva generación de medicamentos para combatir virus con altas tasas de mortalidad, como el VIH-1, el zika, el ébola y el SARS-CoV2, el virus que causa el COVID-19.
«Cuando comenzamos esta investigación, nunca anticipamos que estaríamos en medio de una pandemia causada por un virus de ARN», dijo Harish Vashisth, profesor asociado de ingeniería química. «Pero a medida que surjan estos tipos de virus, esperamos que nuestros hallazgos ofrezcan una mejor comprensión de cómo los ARN virales interactúan con los inhibidores y se utilizan para diseñar mejores tratamientos».
Al igual que los humanos están compuestos por una serie de cromosomas diferentes, conocidos como ADN, muchos virus tienen una composición genética de moléculas de ARN. Estos genomas basados en ARN contienen sitios potenciales donde los inhibidores pueden unirse y desactivar el virus. Parte del desafío en el desarrollo de fármacos pueden ser las fluctuaciones en el genoma viral que pueden evitar que los inhibidores se adhieran.
En su artículo, publicado recientemente en el Journal of Physical Chemistry Letters, los investigadores observaron específicamente un ARN fragmento del virus VIH-1 y su interacción con un ligando/inhibidor, un compuesto complejo que se sabe que interfiere con el proceso de replicación del virus. Mediante el uso de modelos informáticos, los investigadores descubrieron las vías de desunión del inhibidor del ARN viral en varios eventos raros que inesperadamente mostraron un movimiento coordinado en muchas partes del bolsillo de unión que son los componentes básicos del ARN. Los científicos se centraron en los elementos estructurales del genoma del ARN del VIH-1 porque se consideran un buen modelo para estudiar los mismos procesos en una amplia gama de virus de ARN. Los investigadores realizaron simulaciones a nivel molecular de las raras acciones estructurales y conformacionales del proceso de unión/desunión que a menudo son difíciles de observar utilizando métodos experimentales en el laboratorio.
«Observamos lo que se denominan bases raras- eventos de inversión involucrados en el proceso de unión/desunión del inhibidor que proporcionaron los nuevos detalles del mecanismo subyacente de este proceso», dijo Vashisth. «Nuestra esperanza es que esto agregue nuevas posibilidades a un campo tradicionalmente centrado en estructuras biomoleculares estáticas y conduzca a nuevos medicamentos».
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Diseño de inhibidores peptídicos para posibles tratamientos de COVID-19 Información de la revista: Journal of Physical Chemistry Letters
Proporcionado por la Universidad de New Hampshire Cita: Los investigadores descubren nuevas vías que podrían ayudar a tratar los virus de ARN (22 de julio de 2020) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-07-pathways-rna-viruses.html Este documento está sujeto a derechos de autor . Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.