Mapeo de enfermedades

FLICKR, MOONLIGHTBULB La semana pasada, investigadores y periodistas se apresuraron a mapear la propagación de la gripe aviar H7N9 en China para identificar su fuente y resaltar las áreas de riesgo. El mapeo es una respuesta común a los brotes, especialmente de nuevas enfermedades, pero algunos científicos creen que debe convertirse en una parte más proactiva del control de enfermedades.

Estas técnicas de mapeo se han utilizado desde principios del siglo XIX para rastrear brotes. en tiempo real y entender sus causas. En 1854, por ejemplo, John Snow escribió un famoso diagrama de un brote de cólera en Londres, señalando una bomba de agua como la fuente.

A pesar de esta larga historia, sin embargo, los esfuerzos para trazar las ubicaciones de las enfermedades infecciosas todavía Tienden a ser más reactivos que proactivos. Y si bien los brotes locales se mapean de manera regular y exhaustiva, el panorama más amplio es mucho más turbio. Según un equipo de científicos dirigido por Simon Hay de la Universidad…

Tenemos muy poca información sobre dónde se encuentran las enfermedades en el mundo, dijo David Pigott, quien forma parte del equipo de Hays en Oxford. Dicha información es crucial cuando se trata de planificar la vigilancia, las evaluaciones de riesgos, los programas de vacunación y las respuestas a los brotes. [Por ejemplo], si obtiene casos fuera de una distribución conocida, puede ver rápidamente si hay una expansión de rango genuina o un diagnóstico erróneo, dijo Pigott. Es una parte tan integral del control de enfermedades.

El equipo auditó mapas existentes para 174 enfermedades infecciosas de importancia clínica. Luego de una gran revisión sistemática, calificaron los mapas para cada enfermedad de acuerdo con la cantidad de cobertura global conocida y la calidad de los datos, si estaban actualizados y si se basaban en medidas precisas como diagnósticos moleculares o coordenadas GPS. , en lugar de la opinión de expertos no verificados.

Es un estudio muy impresionante, dijo Tom Koch, un experto en mapas médicos de la Universidad de Columbia Británica, que no participó en el estudio. Reúne una gran cantidad de datos y presenta un retrato a partir del cual podemos hacer un trabajo interesante.

Con una puntuación de 75 sobre 100 considerada como una calificación aprobatoria, solo 7 enfermedades cumplieron con ese criterio, incluida la fiebre del dengue. , viruela del simio y dos tipos de malaria. La mayoría de las infecciones, incluidas algunas enfermedades intensamente estudiadas como el VIH, no cumplieron con el punto de referencia debido a una compensación entre calidad y escala. Había datos clínicos realmente detallados donde alguien había ido a un pueblo y había hecho un mapa a pequeña escala, dijo Pigott. Pero los mapas que cubrían el mundo eran de menor calidad y se basaban en un experto que decía: Sé que está en este país.

E incluso las enfermedades con la puntuación más alta tienen margen de mejora. Tras una revisión exhaustiva sobre el paradero del dengue, recientemente publicada en Nature, el equipo de Hays concluyó que cada año se producen 390 millones de infecciones, más del triple de la cifra estimada por la Organización Mundial de la Salud.

A pesar de carencias como esta, Hay y sus colegas son optimistas. Argumentan que la tecnología puede ayudar a llenar los vacíos en nuestros mapas en el futuro y señalan varias fuentes de datos sin explotar. Por ejemplo, tanto PubMed como GenBank, que recopilan literatura biomédica y secuencias de genes respectivamente, contienen información geoespacial para la mayoría de las enfermedades que revisó el equipo. Y las redes sociales como Twitter pueden proporcionar pistas invaluables en tiempo real sobre la propagación de síntomas y enfermedades, a menudo etiquetadas con información geográfica. Durante el brote de gripe porcina H1N1 de 2009, por ejemplo, Twitter predijo brotes 1 o 2 semanas antes de las medidas de vigilancia tradicionales.

Sin embargo, Koch advierte que los datos de la enfermedad no están tan disponibles como sugiere el equipo. En algunos casos, las preocupaciones por la privacidad y las actitudes propietarias de los gobiernos nos han dificultado obtener algunos tipos de datos, como los datos de mortalidad de un brote, dijo. [John] Snow nunca habría obtenido sus datos hoy.

John Brownstein del Boston Childrens Hospital, uno del equipo de Hays, enfrentó estos problemas durante su trabajo de doctorado sobre el virus del Nilo Occidental y la enfermedad de Lyme. Luché porque los gobiernos o los investigadores no compartían su información, dijo. Pero había todo este conocimiento increíble en la web discutido a través de redes profesionales o medios de comunicación.

Para recopilar esas fuentes de datos ricas pero dispares, Brownstein creó el sitio web HealthMapa que monitorea, organiza y mapea automáticamente la información sobre enfermedades infecciosas. de fuentes desconectadas. Estos incluyen noticias de Google, listas de correo como ProMED Mail y boletines de organizaciones como la Organización Mundial de la Salud. Otro sitio llamado Biocaster, desarrollado por Nigel Collier en el Instituto Nacional de Informática y colaboradores internacionales, funciona de manera similar.

El equipo de Hays cree que el problema ahora no es la falta de datos sino una avalancha de datos. Sitios como HealthMap y BioCaster ya están utilizando algoritmos de aprendizaje para filtrar fuentes en línea en busca de información relevante para las infecciones. También están utilizando herramientas de crowdsourcing que les piden a los voluntarios en línea que verifiquen si las conversaciones en las redes sociales marcadas realmente se relacionan con la enfermedad de interés.

Sin embargo, estas soluciones no son la panacea. Brownstein enfatiza la necesidad de construir contactos regionales para obtener los datos correctos en primer lugar. El aspecto local es crítico, dijo. Nuestro equipo está minando Weibo [una destacada red social china] para obtener información sobre el H7N9. Las cosas que hemos podido obtener de esa información son increíbles, como algunos informes de casos de H7N9 que surgieron mucho antes de que se informaran oficialmente. Esto no estuvo disponible durante el SARS.

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