Miles de infecciones por coronavirus surgieron de un evento biotecnológico

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En febrero de este año, más de 100 líderes de la compañía farmacéutica Biogen se reunieron en Boston. Entre ellos había al menos una persona infectada con COVID-19.

Si bien el Departamento de Salud Pública de Massachusetts identificó inicialmente 97 casos vinculados a la conferencia a través del rastreo de contactos, un nuevo estudio que detalla los genomas de los virus recopilados del área metropolitana de Boston indica que la reunión puede haber dado lugar a más de 20 000 casos en cuatro condados.

Los autores del estudio llegaron al nuevo recuento utilizando lo que Bronwyn MacInnis, investigador de enfermedades infecciosas en Broad Institute y el autor principal del artículo, describe a Associated Press como un cálculo bastante poco sofisticado y al dorso del sobre. El total no aparece en el artículo, publicado el 25 de agosto en el servidor de preimpresión medRxiv, pero su coautor Jacob Lemieux, médico de enfermedades infecciosas en el Hospital General de Massachusetts, le dice al Boston Globe, Estoy seguro de que la escala para medir este evento es de decenas de miles.

A finales de febrero, cuando comenzó la conferencia, el vicepresidente Mike Pence estaba formando su grupo de trabajo sobre coronavirus, se identificaron unas pocas docenas de casos de COVID-19 en los EE. UU., y los autores enfatizan que no están culpando a Biogen. En una declaración preparada enviada a The Washington Post, Biogen compartió que había seguido todas las precauciones necesarias disponibles en ese momento e inmediatamente informó cada caso a los funcionarios de salud.

Poco después de que la gente comenzó Al enfermarse, los empleados de Biogen se dieron cuenta de que tenían la oportunidad de ofrecer su propia información médica anónima a los esfuerzos de investigación, dijo Maha Radhakrishnan, directora médica de Biogen, a The Scientist en un correo electrónico en mayo. Nos dimos cuenta de que estábamos en una posición única para contribuir al avance de la ciencia de COVID-19 de una manera organizada y deliberada.

Su información médica se convirtió en parte de uno de los estudios de genoma viral más completos que surgieron de la pandemia. . El equipo de investigación, que incluía a más de 50 científicos y funcionarios de salud pública de todo Massachusetts, analizó los genomas del SARS-CoV-2 extraídos de 772 pacientes. Casi todos eran de los condados de Essex, Middlesex, Norfolk y Suffolk en Massachusetts que habían visitado un hospital o una clínica entre enero y mayo, informa el Globe, incluidas 28 personas identificadas en los 97 casos iniciales vinculados a la conferencia.

Ver Biogen utiliza su propio evento de superpropagador para ayudar en la investigación de COVID-19

A medida que un virus se replica, acumula pequeños cambios, a menudo insignificantes, en su código genético. Los científicos identificaron una sola mutación común en el virus de los que asistieron a la conferencia, una mutación que llamaron C2416T por su ubicación a lo largo del genoma y los dos ácidos nucleicos, citosina (C) y uracilo (la T es para timina, que reemplaza los ARN uracilo en el ADN), que se cambiaron.

Los autores encontraron esta mutación en 289 pacientes, más de un tercio de todas las personas que examinaron, superando con creces el número de personas que habían asistido a la conferencia. De hecho, esos 289 genomas representan el 3 por ciento de todos los genomas del SARS-CoV-2 secuenciados en todo Estados Unidos, según el Post.

Un gran porcentaje de estos casos surgieron de personas locales sin hogar que se refugiaron en refugios y de los empleados que trabajaban allí, un hallazgo que Pardis Sabeti, biólogo computacional del Instituto Broad y uno de los investigadores principales del estudio, llama asombroso. Fue darse cuenta de que estos eventos realmente afectan a los más vulnerables entre nosotros, dice Sabeti a The Post. Se desconoce cómo saltó el virus de la conferencia a quienes vivían en las calles de Boston.

Los investigadores también identificaron otras 79 variantes únicas del SARS-CoV-2 que se habían introducido en Boston, en su mayoría de otros Estados Unidos. o de Europa occidental, informan los autores. Y así como las variantes se vierten en un área, también se extienden hacia afuera. Además de los casos locales, la firma molecular del brote de Biogen se ha encontrado en pacientes en Tennessee, Carolina del Norte, Indiana, Nueva Jersey, Washington, DC y en el extranjero, según Globe.

Este es el tipo de estudio que . . . define por qué la genómica puede ser tan útil en la reconstrucción de brotes, dice Vaughn Cooper, un microbiólogo de la Universidad de Pittsburgh que no participó en el estudio, al Globe. Refleja una gran cantidad de trabajo de coordinación, y eso es lo que en parte lo hace tan poderoso».

Los expertos externos también han aceptado en gran medida la estimación de los equipos de cuántos casos pueden atribuirse a la conferencia. Caroline Buckee, una epidemióloga de la Universidad de Harvard, le dice al Globe que no tiene ningún problema en creer que un solo evento podría causar 20 000 casos. La superpropagación es realmente un componente clave de cómo terminamos con una epidemia de esta gravedad, dice ella.

Del mismo modo, Dan Hartl, un genetista de poblaciones de la Universidad de Harvard que no participó en el estudio, le dice al Globe que encontró creíble la estimación de 20,000 casos, aunque te concedo que es sorprendente.

Los autores se han apresurado a insistir en que no hay nada particularmente especial en la variante C2416T que la haga más poderosa que otras cepas. Algunas introducciones [virales] fracasan afuera, otros encienden fuegos, MacInnis le dice al Globo. Las circunstancias de este e ventilación? el hecho de que sucedió tan temprano en la epidemia y el momento en que estábamos con COVID en la conciencia pública? significó que tuvo un efecto desproporcionado.