Muere el biólogo informático James Taylor

ARRIBA: WILL KIRK/JOHNS HOPKINS UNIVERSITY, ISTOCK.COM, ESKEMAR

James Taylor, biólogo informático de la Universidad Johns Hopkins que desarrolló una popular bioinformática de código abierto plataforma, murió el 2 de abril a la edad de 40 años.

Taylor es conocido por su trabajo con Galaxy Project, una herramienta de código abierto diseñada originalmente para ayudar a procesar datos para genómicos.

Taylor obtuvo una licenciatura en informática en 2000 de la Universidad de Vermont, y luego recibió su doctorado en el campo de la Universidad de Penn State en 2006, durante el cual ayudó a desarrollar el Proyecto Galaxy. Trabajó como profesor asociado en la Universidad de Emory durante cinco años, según un memorial de la Universidad Johns Hopkins. Durante este tiempo, continuó su trabajo con Galaxy, ampliándolo a escala global y escribiendo muchos artículos sobre la plataforma que han sido citados miles de veces. Dejó Emory y se unió al personal de Johns Hopkins, donde se hizo conocido por su espíritu de colaboración.

Llegó en 2014, y fue transformador, Vince Hilser, presidente de biología departamento, dice en el comunicado. Fue este catalizador para el cambio, con un gran impacto positivo.

Taylor fue uno de los fundadores y desarrolladores del Proyecto Galaxy en 2005. La plataforma permitió a los científicos comprender mejor la genómica y la epigenómica. actividad entre individuos y especies sin que todos los investigadores necesiten aprender programación informática. Galaxy ahora se utiliza para analizar datos bioinformáticos con mayor precisión y reproducibilidad en muchos campos, desde el descubrimiento de fármacos hasta la ecología, y se ha utilizado en casi 9000 publicaciones científicas, según su sitio web.

Desde el inicio de la pandemia de SARS-CoV-2, Taylor utilizó su cuenta de Twitter para hablar sobre la necesidad de compartir datos genómicos y criticar la falta de suministros adecuados para quienes trabajan en primera línea.

A lo largo de su carrera, ha estado involucrado con el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano de los Institutos Nacionales de la Salud y ENCODE, miembro del Consejo Asesor Científico del Centro Nacional para el Análisis del Genoma, y muchos otros. También copresidió el Grupo de Trabajo del Portal del Proyecto AnVIL, otra herramienta de bioinformática basada en la nube.

La noticia de su muerte sorprendió a muchos en el mundo de la biología computacional, alentando a amigos y colegas. para expresar su dolor en las redes sociales y en el centro de la comunidad Galaxy.

Qué gran pérdida. James hizo grandes contribuciones al código abierto, la accesibilidad y la reproducibilidad. Cualquiera que ejecute una herramienta bioinformática en la nube lo hace gracias al trabajo de James, tuiteó el genomicista Andrew Carroll.

La búsqueda de su vida fue comprender cómo se usa la información genómica en el desarrollo normal y cómo cambia en el genoma puede desregular este proceso en la enfermedad. Además, al codirigir el proyecto Galaxy y el proyecto Anvil, un impulso importante de la carrera de James ha sido apoyar el trabajo de otros científicos, especialmente para empoderar a aquellos con recursos limitados, Michael Schatz, profesor asociado de informática y biología en la Hopkins, relata en Taylors memoriam.

Hopkins no tenía información disponible sobre la causa de la muerte de Taylor. Le sobrevive su esposa Meredith Greif, una socióloga que también es profesora en Johns Hopkins.