Nueva técnica mapea ARN en células sin microscopio
Un método recientemente desarrollado llamado microscopía de ADN puede identificar con precisión la ubicación de las moléculas de ARNm dentro de una célula y producir un mapa visual de las transcripciones, todo sin usar un microscopio.
Un cultivo de células que producen proteína fluorescente verde y proteína fluorescente roja. La imagen superior es microscopía óptica; la parte inferior es microscopía de ADN. Weinstein et al / cell
La técnica, publicada en Cell hoy (20 de junio), funciona convirtiendo primero los ARN seleccionados en un cultivo celular en ADNc, y luego etiquetando cada molécula con un tramo único de nucleótidos. Esas etiquetas luego se amplifican a sí mismas, y cuando se expanden hasta el punto de ponerse en contacto con las etiquetas de otro cDNA, la conexión en sí misma obtiene una etiqueta de nucleótido única. Cuanto más cerca estén dos ADNc, más etiquetas de conexión generarán.
Como lo describe Science, «para contar las etiquetas, los investigadores trituran las células y analizan el ADN que contienen. Un algoritmo informático puede…
La primera vez que vi una imagen de microscopía de ADN, me impactó, dice el coautor Aviv Regev, biólogo computacional y de sistemas del Broad Institute, a The New York Times.
Los investigadores compararon sus imágenes generadas por computadora con imágenes de microscopía real de las mismas células y descubrieron que, si bien la microscopía de ADN no era tan nítida, las ubicaciones de los ARNm seleccionados se trazaron con precisión. [U]na debilidad clave de la microscopía de ADN sigue siendo la resolución del espacio vacío, que podría distorsionar el mapa cuando las moléculas de ARN están muy separadas, escriben Regev y sus colegas en su estudio, y será necesario trabajar en el futuro para eliminar este obstáculo y producir una alta -reconstrucciones de calidad de muestras en grandes longitudes donde hay brechas en la densidad molecular.
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