Opinión: Trabajo de laboratorio bajo aislamiento

ARRIBA: ISTOCK.COM, TONAQUATIC

Mi laboratorio se centra en la investigación de biología sintética, específicamente, en la construcción de células sintéticas para estudiar la vida terrestre moderna y para investigar las posibilidades de vida en otras partes del Sistema Solar. Nuestro trabajo no es directamente aplicable a la detección, prevención o tratamiento de enfermedades virales, por lo que no hay nada inmediatamente útil para el esfuerzo de COVID-19 que podríamos estar haciendo en el laboratorio. Por lo tanto, para la seguridad de todos, nuestro laboratorio ha estado trabajando de forma remota desde mediados de marzo como resultado de una orden de cierre de operaciones no esenciales en todo el campus, seguida de una orden de refugio en todo el estado un par de días después. 

No poder hacer el trabajo de laboratorio significa que no podemos progresar mucho en ninguno de nuestros proyectos experimentales. Sin embargo, esto no significa que no podamos hacer ningún trabajo. Comparto nuestras experiencias aquí con la esperanza de que puedan ser útiles para otros investigadores durante el cierre actual, o en la planificación de la posibilidad de futuras interrupciones.

Cierre por precauciones de COVID-19

Gracias a las comunicaciones efectivas de nuestra universidad a principios de marzo, nuestro laboratorio tuvo varios días para prepararse para un posible cierre antes de recibir el orden oficial para comenzar a trabajar de forma remota. Durante ese tiempo, limitamos los experimentos a largo plazo y congelamos todos los reactivos que no estábamos usando en los últimos días de trabajo.

La mayoría de las veces, las bacterias se congelan bien en glicerol. Si le preocupa la estabilidad de las existencias de glicerol, pruebe con cultivos de punción. Esos tubos llenos de agar, perforados con una punta de pipeta que contiene cultivo de bacterias, son buenos en el refrigerador durante unos meses.  

Se entregó un nuevo microscopio al laboratorio de Adamala el día antes del cierre. KATE ADAMALA

Cada grupo tiene sus propios especímenes quisquillosos que siempre causan problemas. Para nuestro laboratorio, son cianobacterias. Las bacterias verdes crecen muy lentamente y no existe un buen método de almacenamiento. Decidimos cubrir nuestras apuestas, dividiendo los cultivos entre reservas de refrigeración oscuras e incubadoras de 4 C que alternan entre la luz y la oscuridad.

También tenemos grandes (y costosas) cantidades de reactivos frágiles purificados, incluidas ribozimas y ARNt. No hay nada especial que podamos hacer para preservarlos, más allá del almacenamiento habitual a -80 C. También cultivamos bacterias de micoplasma (las nuestras son principalmente parásitos de cabra), pero, afortunadamente, esas y nuestras células de mamífero se congelan bien en medios regulares. Para algunas líneas celulares agregamos crioprotectores como DMSO.

En nuestro último día en el laboratorio, nos esforzamos por recordar cosas pequeñas, como mover botellas de etanol de los bancos a la campana extractora. Hicimos un inventario de todos los tampones y existencias que deben prepararse frescos, hicimos una lista de soluciones que tendremos que hacer desde cero a primera hora cuando volvamos al laboratorio, y tiramos todo lo que tenía menos de un mes de vida útil. También nos aseguramos de que todos los congeladores estén enchufados a tomacorrientes que recibirán energía de emergencia en caso de que se corte la electricidad, aunque esto fue principalmente para su tranquilidad. sus escritorios, incluidos monitores y periféricos, en casa por el momento. Esto nos ayudará a establecer oficinas temporales en casa sin gastar dinero adicional.

Para ayudarnos a reanudar las operaciones sin problemas después de un tiempo fuera del banco, les pedí a todos en mi grupo que escribieran un breve resumen de sus actividades actuales, una instantánea de dónde están todos sus proyectos y qué próximos pasos inmediatos planean tomar.

Algunas personas en cada laboratorio de nuestra universidad están designadas como personal de emergencia, y los que en esta función irá un par de veces a la semana para asegurarse de que nada se filtre o necesite atención inmediata. Intentaremos no olvidarnos de regar las plantas del laboratorio, pero eventualmente podemos convertirnos en una suculenta comunidad.

Afortunadamente, mi laboratorio no tiene experimentos de incubación a largo plazo ni animales. Es probable que los grupos que trabajan con vertebrados sufran los mayores contratiempos en el cierre actual, especialmente dado que algunos necesitarán tiempo para reconstruir colonias una vez que se reanuden los trabajos de laboratorio. /h3>

Mantenerse productivo durante la pandemia

La mayoría de los miembros de mi laboratorio pasarán su tiempo fuera del laboratorio escribiendo documentos. Tenemos muchos datos que deben analizarse y estábamos trabajando en algunas revisiones y perspectivas. Además, los estudiantes todavía tienen clases y exámenes preliminares para estudiar, y los posdoctorados pueden tomarse el tiempo para revisar las opciones de becas y comenzar a escribir sus solicitudes.

Este también es un buen momento para hacer las cosas que tenemos siempre ha estado postergando, como la documentación de laboratorio y las tareas de catalogación y respaldo que todos los grupos posponen. Por ejemplo, ¿están catalogados todos los plásmidos de su laboratorio? Si no tiene una lista maestra, este podría ser un buen momento para comenzar una. Mi laboratorio utiliza una base de datos en línea gratuita. Como mínimo, cada plásmido tiene el nombre, la fuente, el promotor, el inserto y la información sobre la resistencia a los antibióticos. ¿Todos los mapas de plásmidos están disponibles para todos? Si no es así, sugiero que las personas extraigan archivos de mapas de las profundidades de sus cuadernos y correos electrónicos y creen un depósito de información de plásmidos compartidos.

Los reactivos son otro candidato para la catalogación. Nuestro laboratorio se mantiene al tanto de esta tarea en particular al mantener todos los pedidos en una base de datos, lo que brinda fácil acceso a la información sobre la ubicación y cuánto tenemos. Si no lo ha hecho, hay software gratuito para usar. Podría obtener una ventaja inicial en el inventario del laboratorio al ingresar algunos meses de pedidos recientes en el hogar.

¿Todos los miembros del laboratorio tienen acceso a los manuales de los instrumentos y sus códigos de error más comunes? Hay mucho conocimiento que se transmite en la tradición del laboratorio, por ejemplo, qué lector de placas es preciso para lecturas cortas pero no debe usarse durante la noche, o qué incubadora se enfría de manera confiable por debajo de la temperatura ambiente. Organizar esa información ayudará a los nuevos miembros del laboratorio y también podría ayudar a tomar decisiones informadas sobre qué piezas de equipo que se comportan mal deben reemplazarse.

Es inevitable que la investigación experimental en todo el mundo sufra pérdidas significativas. de productividad este año. Sin embargo, en este momento nuestra prioridad es la salud y la seguridad de nuestros grupos y asegurarnos de seguir siendo lo más productivos posible para estar listos para reanudar la investigación experimental una vez que la pandemia esté bajo control. Nuestro grupo ha aprendido mucho sobre cómo cerrar las operaciones del laboratorio de manera ordenada y desarrollar conjuntos de habilidades para mantenerse productivos como investigadores experimentales sin un laboratorio. Espero que nunca tengamos que volver a usar esas habilidades.

Kate Adamala es profesora asistente en la Universidad de Minnesota. Síguela en Twitter @KateAdamala.