Primer genoma humano secuenciado de la antigua Pompeya

ARRIBA: Ilustración del Monte Vesubio que se cierne sobre las ruinas de Pompeya ISTOCK.COM, BLAMB

La ciudad de Pompeya enterrada por una erupción del Monte Vesubio en el año 79 CEhas sido estudiado intensamente durante décadas. La repentina tragedia lo transformó en un vistazo de la vida durante la época imperial romana, detenido en el tiempo, que ha brindado nuevos conocimientos sobre la arquitectura, las costumbres y el lenguaje de la época. Pero un objetivo ha quedado fuera de alcance: secuenciar el genoma completo de cualquier pompeyano. Los científicos han estado intentando hacerlo durante años con la esperanza de aprender más sobre la población que una vez vivió allí, por ejemplo, de dónde venían o qué enfermedades padecían.

Ahora, gracias a la mejora tecnologías genómicas y colaboración interdisciplinaria, un grupo diverso de investigadores finalmente ha logrado la hazaña. Anuncian hoy (26 de mayo) en Scientific Reports los análisis bioarqueológicos y genómicos de dos adultos (un hombre y una mujer) encontrados en un edificio de Pompeya llamado Casa del Fabbro, traducido como Casa del Herrero. Sin embargo, según la condición del ADN, solo se pudo secuenciar el genoma del hombre, aunque con baja calidad.

Previamente se informaron fragmentos cortos de ADN humano y animal antiguo del sitio, explica el coautor Gabriele Scorrano. , un paleogenético actualmente en la Universidad de Copenhague que llevó a cabo este trabajo mientras estaba en la Universidad Tor Vergata de Roma. Pero recuperar suficiente material para ensamblar un genoma completo de la ciudad destruida es un desafío, agrega. Esos individuos han estado cubiertos durante mucho tiempo por las cenizas de la erupción, lo que significa que los huesos han estado expuestos a altas temperaturas que pueden dañarlos y cualquier ADN conservado en su interior.

Los avances en tecnologías para extraer y secuenciar ADN antiguo motivados Scorrano y sus colegas para llevar a cabo la tarea de dos individuos del sitio: un hombre que probablemente rondaba los treinta y una mujer de más de 50 años cuando entró en erupción el Vesubio, ambos encontrados apoyados en los restos de una especie de sofá en una esquina de lo que fue probablemente el comedor de la Casa del Fabbro. Los investigadores de ADN antiguo de hoy también están mejor informados sobre qué tipo de huesos son mejores para la extracción de moléculas, dice Scorrano. Por ejemplo, el hueso petroso, que protege el oído interno, produce concentraciones excepcionalmente altas de ADN humano, ya que es el hueso más denso de los mamíferos. Tuvimos suerte porque, en ambas muestras, teníamos peñascos, dice. Aún así, la calidad y cantidad del ADN de la mujer no fueron suficientes para ensamblar su genoma.

Los dos individuos encontrados en el edificio de Pompeya «Casa del Fabbro», traducido como «Casa del Herrero»Notizie degli Scavi di Antichit, 1934, pág. 286, figura. 10

El ensamblaje del genoma del hombre tenía solo una cobertura de 0,42x, lo que indica que las lecturas tenían poca superposición y había lagunas. Aún así, según Scorrano, la secuencia fue lo suficientemente buena para analizar ciertos aspectos del ADN. Los resultados sugirieron que el hombre de Pompeya era genéticamente similar a las poblaciones mediterráneas modernas y, en comparación con otros genomas publicados de la antigua Roma, que estaba estrechamente relacionado con los individuos de la época imperial romana, dice Scorrano, y agrega que eso es lo que el equipo esperaba encontrar. Pero al mismo tiempo, señala que Roma estaba repleta de personas de diversos orígenes genéticos en ese entonces. De hecho, los marcadores de los linajes materno y paterno del hombre estaban ausentes entre las secuencias publicadas anteriormente, lo que sugiere que la región tenía una gran diversidad genética durante ese tiempo.

La península italiana era increíblemente heterogénea cuando el Vesubio entró en erupción. de todo el imperio a Roma o a ciudades portuarias como Pompeya, dice la arqueóloga de la Universidad de Chicago Hannah Moots, quien no participó en el estudio pero ha caracterizado previamente el grupo genómico de la antigua Roma. Es emocionante tener genomas de regiones italianas fuera de Roma, dice, y agrega que mirar sitios como Pompeya es realmente interesante porque pueden proporcionar información sobre áreas más rurales.

Los autores del nuevo estudio también informan que el hombre podría haber sido afectado por tuberculosis espinal, con base en la destrucción de un fragmento de una de sus vértebras lumbares, junto con otros marcadores morfológicos óseos. Motivado por este diagnóstico, el equipo buscó ADN antiguo de Mycobacterium tuberculosis, la bacteria que causa la enfermedad. Encontraron secuencias que podrían estar asociadas con esta bacteria. Scorrano explica que es imposible estar seguro, dado el alto nivel de similitud entre los miembros del género Mycobacterium. Sin embargo, la evidencia general apunta fuertemente hacia esa enfermedad, concluye el equipo en el artículo.

Ver TB a lo largo del tiempo

Dejando a un lado las historias médicas, los análisis arqueológicos y genómicos de los equipos también ayudaron a reconstruir la relatos personales de las dos víctimas del Vesubio. La antropóloga de la Universidad de Salento Serena Viva, coautora del nuevo estudio, escribe en un correo electrónico a The Scientist que los hallazgos también buscaban explicar por qué los dos individuos, dada su posición original, no intentaron escapar. a diferencia de muchos otros durante la erupción. Según ella, la respuesta está en su estado de salud y su avanzada edad. Según la forma de tuberculosis diagnosticada por el equipo, es probable que el hombre tuviera poca movilidad, mientras que los análisis de los huesos de la mujer presentados en el documento indican que era anciana y sufría de artrosis, por lo que se quedó allí esperando, protegiendo un pequeño tesoro de monedas. escribe ella.

Es muy interesante para nosotros reconstruir la historia personal de dos protagonistas de uno de los eventos históricos catastróficos más conocidos del mundo, concluye Viva.