Principales genomas de 2012

Wikimedia, Eliza42015

Tomate, tomäto

Especie: Tomate, Solanum lycopersicum Tamaño del genoma: 900 millones de pares de bases

Después de un esfuerzo de 9 años por parte de investigadores en 14 países, la primera secuencia del genoma de un tomate, de la variedad original de ketchup Heinz, se publicó en mayo. La anticipación del genoma de la fruta carnosa se deriva de lo que las secuencias podrían decirles a los investigadores sobre los parientes económicamente importantes del tomate, como la papa, la berenjena, el tabaco y la pimienta. La patata, por ejemplo, cuyo genoma también se ha secuenciado recientemente, es genéticamente similar al tomate en un 92 por ciento. Ahora, los científicos pueden comenzar a descubrir cómo el 8 por ciento diferente de sus genes hace que las plantas de tomate produzcan deliciosos frutos sobre el suelo, mientras que las plantas de patata dan como resultado tubérculos subterráneos nudosos. La secuencia del genoma del tomate también reveló que la especie ha triplicado su genoma dos veces. Un evento de triplicación ocurrió hace unos 130 millones de años, luego otra vez hace unos 60 millones de años, justo cuando muchos dinosaurios…

The Tomato Genome Consortium, La secuencia del genoma del tomate proporciona información sobre la evolución de la fruta carnosa , Nature, doi:10.1038/nature11119, 2012. (Citado 17 veces)

Flickr, abbybatchelder

Descendencia en incubación

Especie: Feto humano, homo sapiens Tamaño del genoma: 3 mil millones de pares de bases

Seguimiento de un estudio de 1997 Lancet  que encontró ADN fetal circulando en la sangre materna, este año vio un flujo constante de estudios y ensayos clínicos sobre la secuenciación del ADN fetal, incluido un genoma fetal completo, publicado en junio. La nueva tecnología se basa en el hecho de que el ADN del bebé constituye del 3 al 10 por ciento del ADN libre de células que flota en el torrente sanguíneo de una mujer embarazada. Como era de esperar, la nueva tecnología se ha disparado en el mercado como pruebas no invasivas para detectar trastornos genéticos en fetos a partir de las 9 semanas de embarazo. Actualmente, las tres pruebas del marcador se centran en encontrar aneuploidías, anomalías en el número de cromosomas o regiones cromosómicas, incluida la trisomía 21, la causa del síndrome de Down. Pero, el avance continuo de las tecnologías de secuenciación promete pruebas más extensas en un futuro próximo. Para obtener más información sobre las pruebas genéticas prenatales, el estado de la industria y las cuestiones éticas asociadas, consulte el artículo de The Scientists, Year of the Fetus.

JO Kitzman et. al., Secuenciación no invasiva del genoma completo de un feto humano, Science Translational Medicine, 137: 137ra76, 2012. (Citado 10 veces)

Flickr, wbeem

Gorila, expuesto

Especie: Gorila occidental de llanura, Gorilla gorilla gorilla Tamaño del genoma: 3.040 millones de pares de bases

En marzo, un gorila cautivo de 30 años y 300 libras llamado Kamilah reveló nuevas similitudes entre nosotros y nuestro segundo pariente más cercano. Al analizar el genoma completamente secuenciado de Kamilah, los 21,000 genes de los investigadores del Instituto Sanger en Cambridge, Reino Unido, descubrieron que los gorilas se separaron de los humanos y los chimpancés hace unos 10 millones de años, 3 millones de años antes de que los humanos se separaran de los chimpancés. Por lo tanto, no es sorprendente que la mayoría de los genes humanos y de chimpancé sean genéticamente más similares entre sí que los genes de gorilas, pero los investigadores descubrieron que el 30 por ciento de los genes de gorilas también están estrechamente relacionados con los genes humanos y de chimpancé, a veces más similares que esos genes entre humanos y chimpancés. . Tal genética compartida sugiere que las tres especies continuaron entrecruzándose después de su divorcio evolutivo. A medida que el clima cambió, las poblaciones se fragmentaron, evolucionaron por separado y los pequeños grupos disidentes se extinguieron o encontraron formas creativas de continuar, como reproducirse con otros grupos, dijo a New Scientist Aylwyn Scally, autora principal del Instituto Sanger. em>. El genoma de Kamilah también mostró que 500 de los genes compartidos entre los simios y los humanos, principalmente involucrados en la audición y el desarrollo del cerebro, evolucionaron en los gorilas después de que las dos especies se separaron.

A. Scally et. al., Insights into hominid evolution from the gorilla genoma secuencia, Nature, 483: 169-75, 2012. (Citado 13 veces)

Wikimedia, Pkuczynski

Cerdo para todo uso

Especie: Cerdo doméstico, Sus scrofa domesticus Tamaño del genoma: ~3 mil millones de pares de bases

Después de décadas de trabajo genético y 10.000 años de relación humano-cerdo, los investigadores secuenciaron el mes pasado (noviembre) el genoma completo de una hembra piga domesticada de Illinois llamada TJ Tabasco. Las aplicaciones más inmediatas de esta nueva información genética probablemente se verán en la granja, donde los criadores tratarán de sacar a codazos los genes que están relacionados con la susceptibilidad a enfermedades, como el síndrome reproductivo y respiratorio porcino que le cuesta a la industria porcina $ 600 millones cada año. . Pero, además de la promesa de animales más sanos y carnosos para la producción de alimentos, los nuevos datos genómicos podrían usarse para avances médicos: los investigadores han estado trabajando durante años para usar cerdos como modelos para enfermedades humanas e incluso han imaginado usarlos para criar humanos. órganos para trasplante. Aprovechando las similitudes en la anatomía, los cerdos ya son modelos para las enfermedades oculares humanas, la fibrosis quística y la diabetes. Ahora, los investigadores están trabajando para desarrollar modelos porcinos de la enfermedad de Alzheimer, el cáncer y la distrofia muscular.

MAM Groenen et al., El análisis de los genomas porcinos proporciona información sobre la demografía y la evolución porcina,Nature, 491: 393-98, 2012 (Citado 3 veces)

Wikimedia, Carport

Cereales con alcohol

Especie: Cebada, Hordeum vulgare L. Tamaño del genoma: ~5.300 millones de pares de bases

La cebada es el cuarto cereal más importante del mundo y uno de los primeros granos domesticados, pero lo que es más importante, es fundamental para la producción de cerveza y whisky. Entonces, el estudio publicado en octubre pasado que revela la secuencia completa del genoma dos veces el tamaño del genoma humano recibió aplausos de productores agrícolas, destiladores y maestros cerveceros por igual. El borrador del genoma producido por el Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma de la Cebada, un equipo de investigadores de 22 organizaciones de todo el mundo, es un mapa de alta resolución del genoma haploide de los granos, que incluye la mayoría de sus 32.000 genes. Los investigadores agrícolas elogian los nuevos datos como una forma de hacer que el grano básico sea más resistente a las enfermedades y resistente durante el cambio climático, fortaleciendo así la seguridad alimentaria. Sin embargo, los bebedores de cerveza y whisky buscan utilizar los nuevos datos para elaborar mejores bebidas espirituosas.

K. Mayer et al., Un ensamblaje de secuencias físicas, genéticas y funcionales del genoma de la cebada,  Nature, 491: 711-16, 2012. (Todavía no citado)

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