Un año de evolución del SARS-CoV-2
Representación creativa de partículas del SARS-CoV-2 (no a escala). Crédito: Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas, NIH
Han surgido varias variantes del SARS-CoV-2 de huéspedes inmunocomprometidos, según ha identificado una investigación. Se cree que las variantes preocupantes, incluida la B.1.1.7, una variante identificada por primera vez en Kent, fueron el resultado de una infección a largo plazo en personas con un sistema inmunitario debilitado.
Las infecciones persistentes en personas inmunocomprometidas podrían hacer que el virus mute con más frecuencia porque el sistema inmunitario de la persona no puede eliminar el virus tan rápido como el sistema inmunitario de una persona sana.
Autores, la profesora Wendy Barclay, la Dra. Thomas Peacock, el profesor Julian Hiscox y Rebekah Penrice-Randal explican la importancia de monitorear los cambios genéticos en el SARS-CoV-2 para el control futuro del virus: «A medida que aparecen más y más variantes, obtenemos una mejor imagen de sus similitudes compartidas y diferencias y puede predecir mejor cómo se verán otras variantes nuevas. Reunir toda esta información también nos ayudará a diseñar vacunas de refuerzo que protejan contra tantas variantes como sea posible o diseñar diagnósticos específicos», dijeron.
Su revisión analiza dónde se han producido mutaciones, qué parte del virus afectan y cómo las variantes resultantes podrían afectar los esfuerzos de vacunación. Según los autores, se esperan mutaciones en el SARS-CoV-2, ya que el virus se está adaptando a los humanos. «La secuenciación de los coronavirus estacionales humanos no se ha realizado a una escala como la del SARS-CoV-2, en particular cuando inicialmente se habrían propagado a los humanos. El SARS-CoV-2 está al comienzo de su viaje en los humanos, mientras que otros coronavirus humanos han sido en algunos casos, durante muchas décadas», dijeron.
Las variantes con las mismas mutaciones o similares han surgido de forma independiente en diferentes países: «El SARS-CoV-2 probablemente todavía se está abriendo camino en los humanos en términos de infección y transmisión óptimas. La escala del brote y los esfuerzos masivos de secuenciación identificarán mutaciones concurrentes; básicamente, el virus está experimentando los mismos tipos de presiones de selección en cualquier lugar del mundo, y el brote fue sembrado por el mismo virus original. virus», explicaron los autores.
Las mutaciones de particular interés incluyen aquellas en la proteína espiga. Esta proteína permite que el virus ingrese a las células huésped y es el objetivo principal del sistema inmunitario, incluida la inmunidad generada por todas las vacunas contra el SARS-CoV-2 actuales.
Las mutaciones en el gen que codifica el pico podrían cambiar la forma de la proteína, lo que permite que el sistema inmunitario ya no la reconozca. Debido a que esta proteína es tan importante para la entrada del SARS-CoV-2, es más probable que las mutaciones favorables tengan éxito y creen nuevas variantes dominantes del virus.
Los cambios que le dan una ventaja al virus pueden convertirse rápidamente en dominantes. Por ejemplo, se encontró una mutación, llamada D614G, en el 80 % de los virus SARS-CoV-2 secuenciados solo cuatro meses después de que se detectara por primera vez. Ahora, los virus sin la mutación D614G solo se ven comúnmente en partes de África.
Otra mutación, N501Y, se encuentra en la variante B.1.1.7 del SARS-CoV-2. Se cree que esta mutación es el resultado de la infección de un individuo inmunocomprometido y puede contribuir a que el virus sea más contagioso. Las infecciones con esta variante tienen una mayor tasa de mortalidad. En el Reino Unido, B.1.1.7 se convirtió en la variante dominante en tres meses y ahora es responsable de más del 90 % de las infecciones allí.
Las mutaciones significativas de la proteína espiga analizadas en la revisión incluyen:
D614G:
En febrero de 2020, se detectó una mutación en la proteína espiga del SARS-CoV-2 y se denominó D614G. Se descubrió que esta mutación hace que el SARS-CoV-2 sea más infeccioso, sin embargo, no hace que el virus sea más dañino. Este aumento en la infectividad condujo a una ventaja de aptitud física significativa y, en cuatro meses, se descubrió que el 80 % de los virus SARS-CoV-2 secuenciados en todo el mundo tenían la mutación. Ahora, solo partes de África tienen virus circulantes sin la mutación D614G.
A pesar de las preocupaciones iniciales, D614G no tiene un efecto sobre la eficacia de la vacuna y, en algunos casos, los virus con la mutación D614G son eliminados más fácilmente por los anticuerpos. contra el SARS-CoV-2.
Y435F:
A mediados de 2020, se hicieron frecuentes los informes de visones infectados por humanos. En el visón, la proteína espiga del virus comúnmente desarrolló dos mutaciones llamadas Y435F y N501T. Estas mutaciones permiten una unión más fuerte del virus a las células receptoras humanas. Se encontraron virus con estas mutaciones en un grupo de infecciones humanas en Dinamarca, que se cree que se originaron en el visón. Preocupantemente, esta variante pudo infectar a personas que previamente habían sido infectadas con SARS-CoV-2 y se pensaba que tenían cierta inmunidad al virus. Como resultado, se sacrificaron 17 millones de visones.
También se informó que la mutación Y435F se desarrolló en una persona inmunodeprimida, posiblemente como resultado de una infección crónica con el virus que le permitió adaptarse.
N501Y:
En diciembre de 2020, se aisló una variante altamente transmisible del virus en Kent, Reino Unido. Esta variante, denominada B.1.1.7, contenía una mutación en la proteína espiga denominada N501Y. Esta mutación no solo hace que el virus sea más contagioso, sino que también se descubrió que tiene una tasa de mortalidad más alta. En el Reino Unido, B.1.1.7 es ahora la variante dominante y es responsable de más del 90 % de las infecciones.
Se ha descubierto que la mutación N501Y tiene poco efecto sobre la inmunidad tanto de las vacunas como de infecciones previas. .
E484K:
La mutación de la proteína espiga E484K ha surgido en los últimos meses, una vez en Sudáfrica y al menos dos veces en Brasil. Las variantes con la mutación de E484K son capaces de evadir el sistema inmunitario de las personas vacunadas y previamente infectadas.
Se cree que esta mutación fue impulsada por los altos niveles de inmunidad de la población, lo que provocó mutaciones en la proteína espiga para evadir el sistema inmunológico. En Brasil, ha habido varios informes de trabajadores de la salud y otras personas con anticuerpos contra el SARS-CoV-2 que se han vuelto a infectar con variantes con el mutante E484K, lo que genera preocupaciones sobre la protección de la vacuna contra esta variante.
La revisión también examina las mutaciones que producen cambios en otras partes del virus, como ORF8, una proteína accesoria que se cree que suprime el sistema inmunitario del huésped. Se ha descubierto que los virus con una deleción en el gen que codifica para ORF8 causan una enfermedad clínica menos grave.
Los autores de la revisión han pedido mayores esfuerzos globales para monitorear las mutaciones del SARS-CoV-2. Actualmente, el Reino Unido y Dinamarca realizan una secuenciación desproporcionadamente alta del genoma del SARS-CoV-2. El monitoreo regular del virus permite la identificación temprana de variantes emergentes y permite a los investigadores identificar las mutaciones asociadas.
«Aunque la vigilancia genómica en Europa y EE. mundo que simplemente no tenemos idea de qué variantes están circulando. Estos están comenzando a aparecer en Europa como importaciones o brotes comunitarios. Una mejor vigilancia en una gama más amplia de países nos permitiría evaluar mejor el riesgo de cómo podría ser la próxima etapa de la pandemia. ”, dijeron los autores. «Si queremos monitorear la aparición, propagación e importación en curso de posibles mutantes de escape de vacunas, debemos continuar con este esfuerzo o arriesgarnos a nuevas olas pandémicas y fallas en las vacunas. Además, comprender la epidemiología genómica del virus lo antes posible nos permitirá para desarrollar rápidamente refuerzos de vacunas actualizados».
El profesor Alain Kohl, editor en jefe adjunto del Journal of General Virology, dijo: «La aparición de variantes del SARS-CoV-2 es uno de los grandes desafíos en el Pandemia en curso. Este artículo de revisión resume nuestro conocimiento actual y la comprensión de la evolución del virus, así como las consecuencias, por ejemplo, en términos de vacunación. Es de gran interés para cualquiera que desee aprender más sobre la historia de este virus y lo que el el futuro puede deparar».
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Siga las últimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) Más información: Thomas P. Peacock et al, SARS-CoV-2 un año después: evidencia de adaptación viral en curso, Journal of General Virology (2021). DOI: 10.1099/jgv.0.001584 Proporcionado por la Sociedad de Microbiología Cita: Un año de evolución del SARS-CoV-2 (2021, 15 de abril) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/ 2021-04-year-sars-cov-evolution.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.