Uniendo los puntos para obtener datos de salud
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La medicina de precisión requiere grandes datos. Para mejorar el tratamiento de las personas con cáncer, o para comprender las enfermedades raras, los científicos y los médicos, así como las tecnologías de IA, requieren acceso a conjuntos más grandes de datos de investigación de salud que cubran diversas poblaciones y una amplia gama de condiciones. Para la IA, más datos significan una mejor comprensión de las enfermedades, lo que conducirá a un diagnóstico y tratamiento más precisos. Al mismo tiempo, cada hospital solo atenderá a un número relativamente pequeño de personas con una enfermedad, e incluso en toda la provincia, solo tenemos acceso a una pequeña parte de los datos totales disponibles en todo el mundo. Para construir los conjuntos de datos a gran escala necesarios para impulsar la medicina de precisión, es fundamental compartir los datos en todo el país y en todo el mundo.
La Infraestructura Distribuida Canadiense para Genómica (CanDIG), presentada recientemente en una edición especial de Cell Genomics dedicada al intercambio de datos, es la solución de Canadá para permitir el intercambio de datos en todo el país (y conectar nuestros datos a conjuntos de datos en todo el mundo). Liderado por la Red de Salud de la Universidad de Toronto con sitios en la Universidad McGill de Montreal y el Centro de Ciencias del Genoma de BC, CanDIG es una colaboración de científicos informáticos, especialistas en inteligencia artificial, médicos y genetistas que trabajan juntos para permitir los estudios necesarios para abordar los desafíos de salud que enfrentan los canadienses.
CanDIG es un proyecto impulsor de la Alianza Global para la Genómica y la Salud (GA4GH), un esfuerzo internacional que establece estándares para la genómica y los datos de salud que buscan mejorar la interoperabilidad en el panorama de la genómica en todo el mundo. La organización fue el centro de la edición especial de este mes de Cell Genomics por su trabajo en genómica global y esfuerzos para compartir datos de salud. Canadá ha sido un líder en GA4GH, albergando su sede, liderando varios flujos de trabajo de proyectos e implementando muchos estándares GA4GH. CanDIG, como uno de los proyectos impulsores, no solo implementó los estándares GA4GH, sino que también ayudó a informar y construir muchos de ellos. CanDIG ya está ayudando a los científicos a nivel nacional a acceder a datos genómicos a gran escala que anteriormente estaban aislados en provincias u hospitales individuales y está comenzando a conectar los conjuntos de datos genómicos de Canadá con los de todo el mundo a través de colaboraciones como el proyecto CINECA UE/África/Canadá.
La plataforma CanDIG se desarrolló para abordar la legislación de privacidad y atención médica basada en las provincias de Canadá, creando una federación de conjuntos de datos, simplificando los desafíos de compartir a través de las fronteras provinciales. CanDIG también es un componente clave de la próxima Digital Health and Discovery Platform (DHDP), un esfuerzo de $ 200 millones de dólares financiado en parte por el gobierno canadiense, que apoyará el intercambio de datos genómicos de Terry Fox Marathon of Hope Cancer Centers Network. Poner estos datos a disposición de los investigadores es clave para desbloquear su potencial de descubrimiento y permitir mejores tratamientos contra el cáncer, porque los investigadores más inteligentes y las técnicas de aprendizaje automático más poderosas no pueden hacer nada con datos que no pueden encontrar, acceder o usar.
«En instituciones como la UHN, estamos creando recursos de datos cada vez más sofisticados que contienen datos de salud de muchas fuentes diferentes. El siguiente paso es ayudar a los investigadores a convertir esos datos en nuevos conocimientos haciéndolos localizables, disponibles y utilizables en «CanDIG es un paso significativo para permitir que los investigadores de todo Canadá accedan a la gran cantidad de datos que se recopilan y generan en cualquier parte del país», dice el Dr. Michael Brudno, investigador principal de CanDIG, científico de datos jefe de UHN y profesor de informática en la Universidad de Toronto.
«Participar en la comunidad GA4GH y proyectos internacionales como el proyecto CINECA UE/África/Canadá, CanDIG está comenzando a conectar los esfuerzos de genómica canadienses con los de todo el mundo. A medida que los tipos de datos de salud se enriquecen y los volúmenes aumentan, debemos asegurarnos de que nuestros conjuntos de datos se puedan encontrar y sean útiles; Canadá es un líder mundial en esto», explica el Dr. Guillaume Bourque, codirector de CanDIG, profesor de genética molecular en la Universidad McGill y director del Centro Canadiense de Genómica Computacional (C3G).
«Acceso a Los datos del genoma completo han sido vitales para comprender el espectro de mutaciones que se acumulan en el cáncer. CanDIG y Terry Fox Digital Health and Discovery Platforms ayudarán a que los datos recopilados por Marathon of Hope Cancer Centers Network sean estudiados por tantos investigadores aprobados como sea posible», concluye el Dr. Steve Jones, codirector de CanDIG, director de bioinformática y compañía. -Director del Centro de Ciencias del Genoma Michael Smith de BC
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GA4GH presenta una visión, un modelo para compartir datos clínicos y genómicos Más información: L. Jonathan Dursi et al, CanDIG: Red federada en Canadá para el descubrimiento y análisis de datos multiómicos y de salud, Cell Genomics (2021).DOI: 10.1016/j.xgen.2021.100033 Proporcionado por University Health Network Cita: Conectando los puntos para datos de salud (2021, 18 de noviembre) consultado el 29 de agosto de 2022 en https://medicalxpress.com/news/2021-11-dots-health.html Este documento está sujeto a derechos de autor, aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados , ninguna parte puede ser reproducida sin el permiso por escrito en. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.