La ascendencia nativa americana se asoció con más mutaciones en el gen EGFR entre los latinoamericanos
Entre los pacientes con cáncer de pulmón de América Latina, los análisis genómicos y de ascendencia revelaron que la ascendencia nativa americana se asoció con un aumento de mutaciones en el gen EGFR, independientemente del tabaquismo estado, según los resultados de un estudio publicado en Cancer Discovery, una revista de la Asociación Estadounidense para la Investigación del Cáncer.
«El cáncer de pulmón es la principal causa de mortalidad por cáncer, tanto en los Estados Unidos como a nivel mundial, y comprender los factores de riesgo heredados de esta enfermedad puede ayudarnos a identificar poblaciones que se beneficiarían de mayores esfuerzos de detección», dijo el Dr. Matthew Meyerson. , Ph.D., director del Centro de Genómica del Cáncer en el Instituto del Cáncer Dana-Farber en Boston.
«El trabajo anterior ha demostrado que el cáncer de pulmón con mutación de EGFR es más común entre las poblaciones del este de Asia en comparación con poblaciones de América del Norte o Europa, alrededor del 50 por ciento frente al 10 por ciento de los casos de cáncer de pulmón, respectivamente», dijo Meyerson, quien también es profesor de genética y medicina en el Instituto del Cáncer Dana-Farber y la Escuela de Medicina de Harvard y miembro del Instituto de la Broad Instituto del MIT y Harvard en Cambridge, Massachusetts. «Pero no está claro si la diferencia étnica en el cáncer de pulmón con mutación en EGFR se debe a factores ambientales o genéticos», agregó.
Meyerson y sus colegas analizaron muestras de 1153 pacientes con cáncer de pulmón de América Latina. De ellos, 601 eran de México y 552 de Colombia, y 499 pacientes se autoinformaron como no fumadores. A través del análisis genómico de muestras de tumores, los investigadores identificaron mutaciones somáticas en EGFR, KRAS y otros genes diana.
Usando un nuevo método desarrollado por Jian Carrot-Zhang, Ph.D., y Alexander Gusev, Ph. .D., los investigadores también realizaron análisis de ascendencia a partir de muestras de tumores en esta población mixta. Se realizó un análisis de ascendencia global para medir las proporciones de ascendencia africana, europea y nativa americana en todo el genoma. Además, se realizó un análisis de ascendencia local, que evalúa la ascendencia genética en una ubicación cromosómica particular. Debido a que la ascendencia local solo evalúa una pequeña porción del genoma, hay menos posibilidades de que las asociaciones observadas se confundan con las exposiciones ambientales o el estado socioeconómico, lo que puede verse en los análisis de ascendencia global, explicó Meyerson.
Usando los datos genómicos y de ascendencia, los investigadores evaluaron las asociaciones de mutaciones somáticas en genes objetivo y grupos de ascendencia global dentro de una sola población mixta. Después de ajustar una variedad de factores, incluido el estado de tabaquismo autoinformado y la carga mutacional del tumor específico de la muestra, los investigadores encontraron que la ascendencia global de nativos americanos se correlacionó positivamente con mutaciones en el gen EGFR. Además, los investigadores encontraron que la ascendencia nativa americana se asoció predominantemente con mutaciones oncogénicas en el gen EGFR, pero no con mutaciones no oncogénicas.
Meyerson y sus colegas luego estratificaron a los pacientes según su estado de fumador autoinformado y evaluaron la asociación entre la ascendencia global y las mutaciones en los genes diana. Tanto en los fumadores como en los nunca fumadores, la ascendencia nativa americana global se asoció con mutaciones en el gen EGFR, lo que sugiere que las diferencias genómicas asociadas con la ascendencia nativa americana son independientes del tabaquismo.
«Fumar aumenta el riesgo de KRAS cánceres de pulmón mutantes, mientras que los pacientes con cáncer de pulmón que no fuman desarrollan con mayor frecuencia cáncer de pulmón mutante en EGFR», dijo Meyerson. «Sin embargo, mostramos en nuestro estudio que el cáncer de pulmón con mutación de EGFR también está elevado entre los fumadores con ascendencia nativa americana».
Los investigadores desarrollaron luego una puntuación de riesgo local de ascendencia nativa americana para evaluar la asociación de la ascendencia con Frecuencia de mutación de EGFR en múltiples sitios distintos en el genoma. Descubrieron que la correlación entre la ascendencia y el aumento de la frecuencia de mutaciones en el gen EGFR era más fuerte a nivel del genoma local que a nivel del genoma global. «Estos resultados sugieren que la genética de la línea germinal, además de los factores ambientales o el nivel socioeconómico, puede tener una influencia en el riesgo de cáncer de pulmón con mutación de EGFR entre las personas con ascendencia nativa americana», dijo Meyerson.
«Muchos cánceres de pulmón son ahora tratable con terapia dirigida o inmunoterapia», continuó Meyerson. «Es muy importante que los pacientes con cáncer de pulmón se sometan a pruebas genéticas somáticas para determinar qué tratamientos tienen más probabilidades de ser efectivos para su cáncer en particular».
El estudio fue dirigido conjuntamente por Meyerson; por Gusev, profesor asistente de medicina en Dana-Farber y la Escuela de Medicina de Harvard; por Andrés F. Cardona, MD, de la Clínica del Country/Fundación para la Investigación Clínica y Aplicada del Cáncer (FICMAC) en Bogotá, Colombia; y por Oscar Arrieta, MD, jefe de Oncología Torácica del Instituto Nacional de Cancerología en la Ciudad de México. Carrot-Zhang, investigadora posdoctoral en el Dana-Farber Cancer Institute y el Broad Institute, y primera autora del estudio, desarrolló métodos computacionales con Gusev y realizó la mayor parte de los análisis computacionales.
Limitaciones del estudio incluyen un tamaño de muestra pequeño, lo que Meyerson señaló que impidió la identificación del gen o sitio específico en la línea germinal que está asociado con un aumento de mutaciones somáticas de EGFR entre aquellos con ascendencia nativa americana. Además, los investigadores solo probaron mutaciones de puntos críticos conocidas y mutaciones de truncamiento de proteínas en los genes impulsores del cáncer de pulmón, y se necesita trabajo futuro para caracterizar de manera integral los genomas del cáncer de pulmón de pacientes latinoamericanos, dijo Meyerson.
Este estudio fue respaldado por un Premio de Investigación Traslacional del Stuart Scott Memorial Fund de la Fundación V y del Instituto Nacional del Cáncer. Meyerson es profesor de investigación de la Sociedad Estadounidense del Cáncer.
Meyerson es presidente del consejo asesor científico de OrigiMed e inventor de patentes con licencia para LabCorp para el diagnóstico de mutaciones en el gen EGFR, con solicitudes de patentes pendientes sobre inhibidores de EGFR. . Meyerson recibe financiación para investigación de Bayer, Janssen, Novo Ventures y Ono Pharmaceutical Co.
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La ascendencia indígena estadounidense vinculada al cáncer de mama HER2+ Más información: Cancer Discovery (2020). DOI: 10.1158/2159-8290.CD-20-1165 Información de la revista: Cancer Discovery
Proporcionado por la Asociación Estadounidense para la Investigación del Cáncer Cita: ascendencia nativa americana asociada con más mutaciones en el gen EGFR entre latinoamericanos (2 de diciembre de 2020) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-12-native-american-ancestry-mutations-egfr.html Este documento está sujeto a derechos de autor . Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.