Los datos abiertos sobre los genomas de la malaria ayudarán a combatir la resistencia a los medicamentos
Crédito: CC0 Public Domain
Los datos de variación del genoma de más de 7000 parásitos de la malaria de 28 países endémicos se publican hoy en Wellcome Open Research. Ha sido producido por MalariaGEN, una red de intercambio de datos de grupos de todo el mundo que trabajan juntos para crear recursos de datos de alta calidad para la investigación de la malaria y el control de enfermedades.
Esta publicación de datos abiertos representa el recurso más grande del mundo de datos genómicos sobre la evolución del parásito de la malaria y la resistencia a los medicamentos. Proporciona datos de referencia sobre la variación del genoma del parásito que se necesitan en la búsqueda de nuevos medicamentos y vacunas, y en el desarrollo de herramientas de vigilancia para el control y la eliminación de la malaria.
La malaria es un importante problema de salud mundial que causa un estimado de 409.000 muertes en 2019, con el 67 por ciento de las muertes ocurriendo en niños menores de cinco años. Este recurso de datos se centra en Plasmodium falciparum, la especie de parásito de la malaria que es responsable de la forma más común y mortal de la enfermedad.
La Red de Epidemiología Genómica de la Malaria (MalariaGEN) proporciona investigadores y programas de control de la malaria. países endémicos con acceso a tecnologías de secuenciación de ADN y herramientas para análisis genómico. Fundada en 2005, MalariaGEN ahora cuenta con socios en 39 países, cada uno de los cuales dirige sus propios estudios sobre diferentes aspectos de la biología y la epidemiología de la malaria, con el objetivo común de encontrar formas de mejorar el control de la malaria.
Esta última publicación representa la trabajo de 49 estudios de socios en 73 lugares de África, Asia, América del Sur y Oceanía, que en conjunto contribuyeron con 7113 muestras de P. falciparum para la secuenciación del genoma. En el Instituto Wellcome Sanger, cada muestra se analizó en busca de más de 3 millones de variantes genéticas y los datos se seleccionaron cuidadosamente antes de devolverlos a los socios para que los usen en su propia investigación. Este documento reúne los datos de todos los estudios de socios para proporcionar un recurso de datos abiertos para la comunidad científica en general.
Dr. Richard Pearson, coautor del Instituto Wellcome Sanger, dijo: «Hemos creado un recurso de datos que está ‘listo para el análisis’ para que cualquiera lo use, incluidos aquellos sin capacitación especializada en genética. Cada muestra de conjunto de datos anotado incluye características clave que son relevantes para control de la malaria, como la resistencia a los seis principales medicamentos antipalúdicos, y si conlleva cambios estructurales particulares que hacen que las pruebas de diagnóstico de la malaria fallen.Como el Proyecto Genoma Humano fue un recurso para el análisis de los datos de la secuencia del genoma humano, esperamos que este sea uno de los principales recursos para la investigación de la malaria».
Uno de los principios fundamentales de MalariaGEN es proporcionar una atribución y un reconocimiento claros de todos los grupos que han contribuido a un recurso de datos. En este conjunto de datos, cada muestra se relaciona con el estudio asociado al que pertenece, con una descripción de los objetivos científicos del estudio y los investigadores locales que dirigieron el trabajo.
Profesor Dominic Kwiatkowski, coautor del Wellcome Sanger Institute y el Big Data Institute de la Universidad de Oxford, dijo: «Ha sido un gran privilegio colaborar con nuestros socios de MalariaGEN en todo el mundo para construir este recurso de datos. Estamos orgullosos de ver que estos datos genómicos se utilizan en publicaciones de nuestros colegas en estudios endémicos de malaria y otros en la comunidad de investigación de malaria. Esperamos que las nuevas características en esta publicación de datos la hagan accesible a una audiencia aún más amplia, y nuestro equipo ahora está trabajando arduamente para producir la próxima versión».
El profesor Abdoulaye Djimde, coautor de la Universidad de Ciencias, Técnicas y Tecnologías de Bamako, Mali, dijo: «Una evaluación cuantitativa de cómo los parásitos de la malaria responden a las intervenciones de salud pública es clave para una campaña de eliminación exitosa y sostenible. Con el tiempo, este recurso disponible de forma abierta facilitará la investigación sobre los procesos evolutivos del parásito de la malaria, lo que en última instancia informará estrategias efectivas y sostenibles de control y eliminación de la malaria que serán clave para poner fin a esta enfermedad devastadora».
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Nuevo Las mutaciones en el parásito de la malaria fomentan la resistencia contra un fármaco preventivo clave. /wellcomeopenres.16168.1 Proporcionado por Wellcome Trust Sanger Institute Cita: Los datos abiertos sobre los genomas de la malaria ayudarán a combatir la resistencia a los medicamentos (2021, 24 de febrero) consultado el 30 de agosto de 2022 en https://medicalxpress.com/news/ 2021-02-malaria-genomes-combat-drug-resistance.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede producido sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.