Investigadores desarrollan pautas para informar puntajes de riesgo poligénico
Los estudios de investigación usan puntajes de riesgo poligénico para determinar el riesgo heredado de una persona para ciertas enfermedades, pero los médicos calculan estos puntajes de manera inconsistente. Crédito: Harry Wedel, NHGRI
Los científicos y proveedores de atención médica están comenzando a utilizar un nuevo enfoque para evaluar el riesgo heredado de una persona de enfermedades como la diabetes tipo 2, la enfermedad coronaria y el cáncer de mama, que implica calcular una puntuación de riesgo poligénico. La puntuación proporciona una estimación del riesgo de una persona de padecer enfermedades específicas, en función de los cambios en su ADN relacionados con esas enfermedades.
A pesar del aumento de estudios que utilizan puntajes de riesgo poligénico, los investigadores han observado inconsistencias en la forma en que se calculan e informan dichos puntajes. Estas diferencias amenazan con comprometer la adopción de puntajes de riesgo poligénico en la atención clínica.
Para abordar esta preocupación, los equipos de investigación, financiados principalmente por el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI), publicaron un informe de 22 elementos marco en la revista Nature que identifica la información mínima relacionada con la puntuación de riesgo poligénico que los científicos deben incluir en sus estudios. Este marco creado por el Grupo de Trabajo de Enfermedades Complejas de Clinical Genome Resource (ClinGen) del NHGRI y el Polygenic Score Catalog (PGS), una base de datos abierta de puntajes de riesgo poligénico ayudará a promover la validez, transparencia y reproducibilidad de los puntajes de riesgo poligénico. NHGRI es parte de los Institutos Nacionales de la Salud.
Para calcular la puntuación de riesgo poligénico de una persona, los investigadores analizan las variantes de ADN en más de 6 mil millones de ubicaciones en el genoma humano.
«Un verdadero desafío es que la comunidad de investigación no ha adoptado ninguna de las mejores prácticas universales para informar las puntuaciones de riesgo poligénico», dijo Erin Ramos, Ph.D., directora de programa de ClinGen, subdirectora de la División de Medicina Genómica del NHGRI y coautora del artículo. . «Con el campo creciendo tan rápido, necesitamos estándares establecidos para que podamos evaluar de manera significativa estos puntajes y determinar cuáles están listos para usarse en la atención clínica».
Este marco se basa en otro mejor modelo de práctica llamado Declaración de estudios de predicción de riesgos genéticos (GRIPS), publicado por un grupo de trabajo internacional en 2011. GRIPS hizo hincapié en los modelos que incluían un conjunto más pequeño de variantes genómicas y puntajes genéticos. Sin embargo, los modelos de predicción del riesgo genético han evolucionado rápidamente desde entonces y se basan en un conjunto mucho mayor de variantes genómicas y metodologías más complejas. Además, los investigadores no han adoptado completamente el marco GRIPS.
«Un énfasis renovado en los estándares de informes por parte de ClinGen y Polygenic Score Catalog llega en un momento crucial para las puntuaciones de riesgo poligénico», dijo Genevieve Wojcik, Ph.D. ., MHS, profesor asistente de epidemiología en la Escuela de Salud Pública Bloomberg de Johns Hopkins, Baltimore, y autor correspondiente del artículo. «Especifica la información mínima que debe describirse en un trabajo de investigación para interpretar una puntuación de riesgo poligénico, reproducir resultados y, finalmente, traducir la información a la atención clínica».
Algunos de los nuevos elementos del marco de informes incluyen detallar el población de estudio y la base para elegir esa población.
«Si vamos a poner estos puntajes a disposición de personas de todo el mundo, los estudios deben definir a quiénes están estudiando y por qué, de la manera más clara posible, «, dijo Katrina Goddard, Ph.D., directora de Genómica Traslacional y Aplicada en el Centro Kaiser Permanente para la Investigación de la Salud, Portland, Oregón, quien también es coautora del artículo. «Sin esa transparencia y reproducibilidad, los esfuerzos para usar puntajes de riesgo poligénico pueden verse socavados».
El nuevo marco sugiere que los científicos deberían explicar los métodos estadísticos que usaron para desarrollar y validar los puntajes de riesgo poligénico. Sin una forma coherente de informar las puntuaciones de riesgo poligénico, es casi imposible comparar la utilidad de las puntuaciones para evaluar el riesgo de enfermedad en las personas. De acuerdo con las nuevas pautas, los investigadores también deben considerar las limitaciones potenciales de estos puntajes y cómo los médicos deben usar los puntajes en la atención al paciente.
«Si los investigadores pueden seguir estos lineamientos, será más sencillo evaluar los resultados poligénicos publicados». puntuaciones de riesgo y decidir cuáles se ajustan bien al entorno clínico», dijo Michael Inouye, Ph.D., director de Cambridge Baker Systems Genomics Initiative, Reino Unido, y coautor principal del artículo. «Para enfermedades como el cáncer de mama y muchas otras, podremos colocar a los pacientes de manera responsable en diferentes categorías de riesgo y proporcionar estrategias de detección y tratamientos beneficiosos. Idealmente, en el futuro, detectaremos el riesgo lo suficientemente temprano como para combatir la enfermedad de manera efectiva».
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Un estudio encuentra que ciertas pruebas genéticas no son útiles para predecir el riesgo de enfermedad cardíaca Más información: Mejora de los estándares de informes para puntajes poligénicos en estudios de predicción de riesgo, Nature (2021). DOI: 10.1038/s41586-021-03243-6 , dx.doi.org/10.1038/s41586-021-03243-6 Información de la revista: Nature
Proporcionada por NIH/National Human Genome Research Cita del Instituto: Los investigadores desarrollan pautas para informar puntajes de riesgo poligénico (10 de marzo de 2021) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-03-guidelines-polygenic-scores.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.