Investigación multiómica que revela las características de las células infectadas por VIH-1 in vivo
Usando las muestras obtenidas de la infección por VIH1-GFP en un modelo de ratón humanizado, se realizaron una serie de análisis ómicos. Crédito: SATO Kei
Para la erradicación de la infección por VIH-1, es importante dilucidar las características detalladas y la heterogeneidad de las células infectadas por VIH-1 in vivo. En este estudio, se utilizó un modelo de ratón humanizado trasplantado con células madre hematopoyéticas infectado con un VIH-1 modificado genéticamente para revelar múltiples características de las células productoras de VIH-1 in vivo.
Un grupo de investigación del Instituto de Ciencias Médicas de la Universidad de Tokio (IMSUT) que utilizó células infectadas con VIH-1 realizó análisis de «multiómica», que son tecnologías desarrolladas recientemente para investigar exhaustivamente las características de las muestras biológicas.
«Nuestros hallazgos describen múltiples características de las células productoras de VIH-1 in vivo, lo que podría proporcionar pistas para el desarrollo de una cura para el VIH-1», dijo el científico principal, Kei Sato, profesor asociado (investigador principal) en la División de Virología de Sistemas, Departamento de Control de Enfermedades Infecciosas, IMSUT. Los resultados de esta investigación se publicaron en Cell Reports el 14 de julio de 2020.
Estudio para la ‘cura del VIH-1’
Para la erradicación de la infección por el VIH-1, es importante obtener una comprensión profunda de la amplia gama de características de las células infectadas por el VIH-1 in vivo.
Los análisis «ómicos» desarrollados recientemente pueden ser una herramienta poderosa para identificar las características de las células infectadas por el VIH-1. células. Sin embargo, debe tenerse en cuenta que una gran mayoría de las células T CD4+ en individuos infectados no están infectadas y, por lo tanto, los perfiles transcripcionales de las células T CD4+ «en masa» in vivo no reflejan los de las células productoras de VIH-1 «puras». .
Análisis multiómicos para revelar de manera integral las características de las células infectadas con VIH-1 in vivo
En este estudio, el grupo de investigación utilizó un modelo de ratón humanizado trasplantado con células madre hematopoyéticas humanas que mantiene la leucopoyesis humana en condiciones inmunológicas relativamente estables in vivo y un reportero competente en replicación del VIH-1, y utilizó cuatro técnicas desarrolladas recientemente para investigar la genómica y transcriptómica viral.
Según el grupo de investigación, este estudio consistió en los cuatro análisis siguientes:
Primero, la PCR digital de gotas reveló la presencia de reservorios potenciales en ratones humanizados infectados. En segundo lugar, la PCR mediada por ligación mostró la preferencia del VIH-1 por integrarse en las regiones de cromatina abierta, como sugiere la asociación de las modificaciones epigenéticas de los sitios de integración con la producción viral. En tercer lugar, la secuenciación digital de ARN cuantificó el número absoluto de copias de los transcritos virales en las células productoras de VIH-1 in vivo e identificó además los genes expresados diferencialmente entre las células infectadas por virus y las no infectadas. Finalmente, la secuenciación de ARN de una sola célula reveló y caracterizó la heterogeneidad de las células productoras de VIH-1 in vivo.
El profesor asociado Sato enfatizó: «Hasta donde sabemos, este estudio es la primera investigación que describe múltiples aspectos de células productoras de VIH-1 y también la primera investigación exhaustiva de las características de las células infectadas por VIH-1 in vivo».
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El enfoque AIDSan para dirigirse a los reservorios del VIH Más información: Hirofumi Aso et al, Investigación de Multiomics que revela las características de las células infectadas por el VIH-1 InVivo, Cell Reports (2020). DOI: 10.1016/j.celrep.2020.107887 Información de la revista: Cell Reports
Proporcionado por la Universidad de Tokio Cita: Investigación multiómica que revela las características de los infectados con VIH-1 cell in vivo (28 de julio de 2020) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-07-multiomics-revealing-characteristics-hiv-infected-cells.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.