Los investigadores están desarrollando un ‘descifrador de códigos’ más rápido para analizar el ADN humano

Crédito: CC0 Public Domain

Investigadores de la Universidad de Missouri, dirigidos por Praveen Rao, están desarrollando un recurso gratuito en línea que podría ayudar a los científicos a acelerar sus descubrimientos para varias enfermedades humanas como la enfermedad de células falciformes, la fibrosis quística e incluso COVID-19 mediante el análisis de genomas humanos tres veces más rápido que los métodos disponibles actualmente.

«El genoma de cada persona es diferente, por lo que uno de los beneficios de nuestro enfoque es ayudar a los científicos a ver cómo el genoma de un individuo puede hacerlos susceptibles a diferentes enfermedades de diferentes maneras», dijo Rao, profesor asociado de gestión de la salud e informática con una nombramiento en el departamento de ingeniería eléctrica e informática. «Sin embargo, la investigación de los genomas humanos crea una enorme cantidad de datos, por lo que también se requiere mucha potencia computacional para analizar estos genomas antes de que se puedan realizar descubrimientos científicos».

Rao dijo que al acelerar el proceso de análisis de datos, su recurso podría ayudar a reducir el costo asociado tanto en tiempo como en dinero, brindando así oportunidades para que los científicos realicen estudios más amplios sobre el genoma humano con la capacidad de procesar rápidamente miles de genomas a la vez.

«Los científicos podrán manejar muchos más datos que antes, por lo que su modelado de datos será más preciso», dijo Rao. «Este enfoque también permitirá que se incluyan más conocimientos en los estudios, lo que puede hacer que los descubrimientos sean más generalizables y escalables en tratamientos potenciales a escala de producción en masa. Este trabajo también nos está llevando un paso adelante en la aceleración de la tubería de procesamiento genómico, que puede afectar indirectamente la toma de decisiones y otras cosas relacionadas con la atención del paciente en un entorno médico».

Desde que comenzó el Proyecto Genoma Humano (HGP) a principios de la década de 1990, los avances tecnológicos han permitido a los científicos desarrollar una visión más detallada del «código» humano, también conocido como el genoma humano o ADN, que constituye el «modelo» individual para cada persona.

Rao dijo que este proyecto de investigación está inspirado en otros científicos que actualmente están estudiando formas de identificar posibles conexiones genéticas relacionadas con el COVID-19.

«Hemos aprendido con el COVID-19 que nuestro ADN contiene muchas de las respuestas, ya sea que seamos susceptibles de contraerlo, si estamos hospitalizados, si nos recuperamos de o incluso si mostramos síntomas», dijo Rao.

El documento, «Aceleración de la solicitud de variantes en genomas humanos mediante un clúster de productos básicos», se presentó durante la 30.ª Conferencia internacional virtual de ACM sobre gestión de la información y el conocimiento ( CIKM 2021), que se llevó a cabo del 1 al 5 de noviembre de 2021. El artículo fue nominado para el «Premio al mejor artículo corto». Los coautores incluyen a Arun Zachariah, Deepthi Rao, Peter Tonellato, Wesley Warren y Eduardo Simoes en MU.

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Los científicos están en camino de secuenciar 1 millón de genomas humanos y usar big data para descubrir secretos genéticos Más información: Praveen Rao et al, Aceleración de la solicitud de variantes en genomas humanos usando a Commodity Cluster, Actas de la 30.ª Conferencia Internacional ACM sobre Gestión de la Información y el Conocimiento (2021). DOI: 10.1145/3459637.3482047. Proporcionado por la Universidad de Missouri Cita: Los investigadores están desarrollando un «descifrador de códigos» más rápido para analizar el ADN humano (8 de diciembre de 2021) consultado el 29 de agosto de 2022 en https://medicalxpress.com/news/2021- 12-faster-code-breaker-human-dna.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.